RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 CLUHP3Q96NS8 147 aa8□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 RASSF4Q9H2L5 321 aa8□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 STRN4Q9NRL3 753 aa8□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 PPFIA4O75335 1185 aa7.99□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 ARNTP27540 789 aa7.99□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 CDK8P49336 464 aa7.99□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.99□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 VHLLQ6RSH7 139 aa7.99□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 F11P03951 625 aa7.98□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 PCDH1Q08174 1060 aa7.97□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 PNMA5Q96PV4 448 aa7.97□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.97□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 EFCC1Q9HA90 598 aa7.97□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.97□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.97□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.97□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.97□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 C14orf80Q86SX3 495 aa7.97□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 ATL2Q8NHH9 583 aa7.97□□□□□ -1.13
MDM2-201ENST00000258148 RIN3Q8TB24 985 aa7.97□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 SLC30A3Q99726 388 aa7.97□□□□□ -1.13
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MDM2-201ENST00000258148 NEK2P51955 445 aa7.96□□□□□ -1.14
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MDM2-201ENST00000258148 LAMC2Q13753 1193 aa7.96□□□□□ -1.14
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MDM2-201ENST00000258148 J3QW42 95 aa7.95□□□□□ -1.14
MDM2-201ENST00000258148 TNFRSF10CO14798 259 aa7.95□□□□□ -1.14
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MDM2-201ENST00000258148 CCNFP41002 786 aa7.95□□□□□ -1.14
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MDM2-201ENST00000258148 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
MDM2-201ENST00000258148 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.95□□□□□ -1.14
MDM2-201ENST00000258148 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
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