RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 GJC1P36383 396 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 KIAA1468Q9P260 1216 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 RAPGEF1Q13905 1077 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 TSPYL6Q8N831 410 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 VCX3AQ9NNX9 186 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 OPHN1O60890 802 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 PAK1Q13153 545 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 RILPL1Q5EBL4 403 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 DENND2CQ68D51 928 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 TAB2Q9NYJ8 693 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 SGSM2O43147 1006 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 COG7P83436 770 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 HHATQ5VTY9 493 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 CUL5Q93034 780 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 BICD1Q96G01 975 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 USH1CQ9Y6N9 552 aa17.91■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 PDE4BQ07343 736 aa17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 ESR2Q92731 530 aa17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 VAT1LQ9HCJ6 419 aa17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 PRDM11Q9NQV5 511 aa17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 RASEFQ8IZ41 740 aa17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 MCM7P33993 719 aa17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 ERMNQ8TAM6 284 aa17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 TOP2BQ02880 1626 aa17.9■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 NBPF14Q5TI25 921 aa17.89■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.46
CTIF-201ENST00000256413 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 DNAI2Q9GZS0 605 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 AOX1Q06278 1338 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 CLUL1Q15846 466 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 AMOTQ4VCS5 1084 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 TRIM58Q8NG06 486 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 HOMER3Q9NSC5 361 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 ALDH1L1O75891 902 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 CALML3P27482 149 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 STX2P32856 288 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 POSTNQ15063 836 aa17.89■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 ERCC3P19447 782 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 RPS6KA1Q15418 735 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 MGARPQ8TDB4 240 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 PARD6BQ9BYG5 372 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 NUF2Q9BZD4 464 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 PAG1Q9NWQ8 432 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 DTHD1Q6ZMT9 781 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 MIER3Q7Z3K6 550 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 CHAMP1Q96JM3 812 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 SLC24A3Q9HC58 644 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 HDAC9Q9UKV0 1011 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 VWA3AA6NCI4 1184 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 STX10O60499 249 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 TCP11Q8WWU5 503 aa17.88■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB17Q13105 803 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 PPP4R3AQ6IN85 833 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 CCDC197Q8NCU1 140 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 CABP5Q9NP86 173 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 HYOU1Q9Y4L1 999 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 CHUKO15111 745 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD42Q8N9B4 389 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 MTMR6Q9Y217 621 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 HSPA1LP34931 641 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 SESN3P58005 492 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 GSDMBQ8TAX9 411 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 IRX4P78413 519 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 KCTD16Q68DU8 428 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 COMMD10Q9Y6G5 202 aa17.87■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 INSRP06213 1382 aa17.86■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 GUCY2CP25092 1073 aa17.86■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 ADALQ6DHV7 355 aa17.86■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 RAB17Q9H0T7 212 aa17.86■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 HAUS4Q9H6D7 363 aa17.86■□□□□ 0.45
CTIF-201ENST00000256413 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms