RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.36■■□□□ 1.33
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HOXD11-201ENST00000249504 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 NF2P35240 595 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 AIDAQ96BJ3 306 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 ENTPD3O75355 529 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 MBD4O95243 580 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 FAM151AQ8WW52 585 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
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HOXD11-201ENST00000249504 USP5P45974 858 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 LCORLQ8N3X6 602 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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HOXD11-201ENST00000249504 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.33■■□□□ 1.32
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HOXD11-201ENST00000249504 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
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HOXD11-201ENST00000249504 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
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HOXD11-201ENST00000249504 TEPSINQ96N21 525 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
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HOXD11-201ENST00000249504 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 CST9Q5W186 159 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 HOOK2Q96ED9 719 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 HSPA6P17066 643 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 GNAT2P19087 354 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 REC8O95072 547 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 SEC24BO95487 1268 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 PRKG1Q13976 671 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.28■■□□□ 1.32
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HOXD11-201ENST00000249504 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.28■■□□□ 1.32
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HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 CREBZFQ9NS37 354 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-201ENST00000249504 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.27■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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HOXD11-201ENST00000249504 DCAF15Q66K64 600 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
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HOXD11-201ENST00000249504 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
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HOXD11-201ENST00000249504 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.25■■□□□ 1.31
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HOXD11-201ENST00000249504 MAP4K1Q92918 833 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 PALD1Q9ULE6 856 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 FZD1Q9UP38 647 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 APPP05067 770 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 MOB2Q70IA6 237 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-201ENST00000249504 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.23■■□□□ 1.31
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