RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ZNF827Q17R98 1081 aa24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 DONSONQ9NYP3 566 aa24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 PIP4K2BP78356 416 aa24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 TNNI3KQ59H18 835 aa24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 WDR93Q6P2C0 686 aa24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.19■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 TEX33O43247 280 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 LTKP29376 864 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 CCDC102BQ68D86 513 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 RABEP2Q9H5N1 569 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 RBL2Q08999 1139 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 NR1I3Q14994 352 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 LINS1Q8NG48 757 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 TFCP2Q12800 502 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 ACRBPQ8NEB7 543 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 KAT14Q9H8E8 782 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 SUFUQ9UMX1 484 aa24.18■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 TUBBP07437 444 aa24.17■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 RESP18Q5W5W9 173 aa24.17■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.17■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.17■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 NWD1Q149M9 1564 aa24.17■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 HAUS7Q99871 368 aa24.17■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.17■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 EHD4Q9H223 541 aa24.17■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 EBAG9O00559 213 aa24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 HOXC9P31274 260 aa24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 MED15Q96RN5 788 aa24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 UTYO14607 1347 aa24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 MRC1P22897 1456 aa24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 AIFM3Q96NN9 605 aa24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.16■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 BTBD11A6QL63 1104 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 GGCXP38435 758 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 PTPAQ15257 358 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 SPECC1Q5M775 1068 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 CPLX1O14810 134 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 TECPR2O15040 1411 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 PPP6R2O75170 966 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 PPFIBP1Q86W92 1011 aa24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 JMYQ8N9B5 988 aa24.14■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.14■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.14■■□□□ 1.46
ODC1-201ENST00000234111 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 A0A1B0GTH6 734 aa24.14■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.14■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 STIM1Q13586 685 aa24.13■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 VPS37DQ86XT2 251 aa24.13■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 MYO6Q9UM54 1294 aa24.13■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.13■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 IRAK1P51617 712 aa24.13■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 GOLIM4O00461 696 aa24.12■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 USP8P40818 1118 aa24.12■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 AMPD2Q01433 879 aa24.12■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 FAM76AQ8TAV0 307 aa24.12■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 COG1Q8WTW3 980 aa24.12■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.12■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 MFAP3LO75121 409 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 IGKV5-2P06315 115 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 INPP5BP32019 993 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 BCAS4Q8TDM0 211 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 ZMYND10O75800 440 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 CASP14P31944 242 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 USP14P54578 494 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 MAP3K14Q99558 947 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.11■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 HAND2P61296 217 aa24.1■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 POSTNQ15063 836 aa24.1■■□□□ 1.45
ODC1-201ENST00000234111 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms