RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 IL17REQ8NFR9 667 aa7.17□□□□□ -1.26
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SETX-201ENST00000224140 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.17□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 CLEC17AQ6ZS10 378 aa7.17□□□□□ -1.26
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SETX-201ENST00000224140 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.17□□□□□ -1.26
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SETX-201ENST00000224140 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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SETX-201ENST00000224140 PPP6R2O75170 966 aa7.16□□□□□ -1.26
SETX-201ENST00000224140 KIF5AQ12840 1032 aa7.16□□□□□ -1.26
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SETX-201ENST00000224140 CNKSR1Q969H4 720 aa7.16□□□□□ -1.26
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SETX-201ENST00000224140 FDX1P10109 184 aa7.15□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 ATP2B1P20020 1258 aa7.15□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa7.14□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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SETX-201ENST00000224140 FAM89AQ96GI7 184 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 COL15A1P39059 1388 aa7.14□□□□□ -1.27
SETX-201ENST00000224140 H0YHG0 523 aa7.14□□□□□ -1.27
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