RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MOGSQ13724 837 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP2C8P10632 490 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BCRP11274 1271 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PANK1Q8TE04 598 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SIL1Q9H173 461 aa23.42■■□□□ 1.34
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 GABRQQ9UN88 632 aa23.41■■□□□ 1.34
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 EVI5O60447 810 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SGPL1O95470 568 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTX1Q13505 466 aa23.4■■□□□ 1.34
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.39■■□□□ 1.33
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 FLT3LGP49771 235 aa23.37■■□□□ 1.33
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.37■■□□□ 1.33
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 AK9Q5TCS8 1911 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.35■■□□□ 1.33
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC5A1P13866 664 aa23.35■■□□□ 1.33
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP40Q9NVE5 1235 aa23.35■■□□□ 1.33
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 STAP2Q9UGK3 403 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COG6Q9Y2V7 657 aa23.34■■□□□ 1.33
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 MGAMO43451 1857 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.31■■□□□ 1.32
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATP2B3Q16720 1220 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RGS3P49796 1198 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDE3AQ14432 1141 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SSH3Q8TE77 659 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COA7Q96BR5 231 aa23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ENTPD3O75355 529 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TFCP2Q12800 502 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LAMA3Q16787 3333 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CEP85Q6P2H3 762 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IDI2Q9BXS1 227 aa23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6A-201ENST00000006275 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
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