RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeastyeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11YML043C JIP4Q03361 876 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN11YML043C YDR344CQ05510 147 aa6.71□□□□□ -1.33
RRN11YML043C VRP1P37370 817 aa6.71□□□□□ -1.34
RRN11YML043C DPS1P04802 557 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRN11YML043C SRC1Q03707 834 aa6.67□□□□□ -1.34
RRN11YML043C RCR1P38212 213 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN11YML043C DMA1P38823 416 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN11YML043C ABP1P15891 592 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RRN11YML043C GYP5Q12344 894 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN11YML043C PTC4P38089 393 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN11YML043C HTA1P04911 132 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RRN11YML043C HTA2P04912 132 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN11YML043C YEL023CP39992 682 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN11YML043C DCW1P36091 449 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN11YML043C TAF7Q05021 590 aa6.52□□□□□ -1.37
RRN11YML043C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RRN11YML043C PML39Q03760 334 aa6.47□□□□□ -1.37
RRN11YML043C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRN11YML043C ARH1P48360 493 aa6.44□□□□□ -1.38
RRN11YML043C MAK11P20484 414 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RRN11YML043C RAM2P29703 316 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN11YML043C GUT1P32190 709 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN11YML043C MIF2P35201 549 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN11YML043C EDS1P38073 919 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN11YML043C PTC3P34221 468 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RRN11YML043C ATH1P48016 1211 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN11YML043C NST1P53935 1240 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN11YML043C SPT23P35210 1082 aa6.35□□□□□ -1.39
RRN11YML043C MID1P41821 548 aa6.35□□□□□ -1.39
RRN11YML043C LEO1P38439 464 aa6.33□□□□□ -1.4
RRN11YML043C COQ8P27697 501 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN11YML043C SOL3P38858 249 aa6.31□□□□□ -1.4
RRN11YML043C MPH3P0CE00 602 aa6.3□□□□□ -1.4
RRN11YML043C RAS1P01119 309 aa6.29□□□□□ -1.4
RRN11YML043C AI4P03878 556 aa6.29□□□□□ -1.4
RRN11YML043C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN11YML043C ILV3P39522 585 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RRN11YML043C BNI4P53858 892 aa6.25□□□□□ -1.41
RRN11YML043C HAP5Q02516 242 aa6.24□□□□□ -1.41
RRN11YML043C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RRN11YML043C PEX29Q03370 554 aa6.23□□□□□ -1.41
RRN11YML043C YGR273CP53329 174 aa6.2□□□□□ -1.42
RRN11YML043C YPL062WQ02781 134 aa6.2□□□□□ -1.42
RRN11YML043C NOP2P40991 618 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RRN11YML043C URN1Q06525 465 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RRN11YML043C PTC2P39966 464 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RRN11YML043C TRK1P12685 1235 aa6.17□□□□□ -1.42
RRN11YML043C MPC54Q08550 464 aa6.17□□□□□ -1.42
RRN11YML043C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
RRN11YML043C LEU3P08638 886 aa6.14□□□□□ -1.43
RRN11YML043C YPR015CQ12531 247 aa6.13□□□□□ -1.43
RRN11YML043C EBP2P36049 427 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RRN11YML043C SLI15P38283 698 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN11YML043C NMA111P53920 997 aa6.12□□□□□ -1.43
RRN11YML043C DPL1Q05567 589 aa6.09□□□□□ -1.43
RRN11YML043C AMS1P22855 1083 aa6.09□□□□□ -1.44
RRN11YML043C CAB3P36076 571 aa6.07□□□□□ -1.44
RRN11YML043C KEX1P09620 729 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN11YML043C SDH2P21801 266 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN11YML043C RAM1P22007 431 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN11YML043C SIS2P36024 562 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN11YML043C ISU2Q12056 156 aa6.03□□□□□ -1.44
RRN11YML043C CDC73Q06697 393 aa5.99□□□□□ -1.45
RRN11YML043C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RRN11YML043C UBP14P38237 781 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RRN11YML043C SET1P38827 1080 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RRN11YML043C GYP1Q08484 637 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN11YML043C RPN1P38764 993 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RRN11YML043C PDR1P12383 1068 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN11YML043C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data5.93□□□□□ -1.46not detected
RRN11YML043C VHR2P40041 505 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN11YML043C SAS4Q04003 481 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN11YML043C RAD54P32863 898 aa5.9□□□□□ -1.46
RRN11YML043C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RRN11YML043C BRE2P43132 505 aa5.87□□□□□ -1.47
RRN11YML043C DMA2P53924 522 aa5.87□□□□□ -1.47
RRN11YML043C GAR1P28007 205 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
RRN11YML043C YDR090CQ03193 310 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN11YML043C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN11YML043C CKB1P43639 278 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN11YML043C YEL077CQ3E7X8 1277 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN11YML043C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
RRN11YML043C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RRN11YML043C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RRN11YML043C VPS70P47161 811 aa5.82□□□□□ -1.48
RRN11YML043C YPR148CQ06523 435 aa5.82□□□□□ -1.48
RRN11YML043C IFH1P39520 1085 aa5.81□□□□□ -1.48
RRN11YML043C AIR1P40507 360 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RRN11YML043C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RRN11YML043C PRT1P06103 763 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RRN11YML043C YRR1Q12172 810 aa5.8□□□□□ -1.48
RRN11YML043C TFB4Q12004 338 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN11YML043C KIC1P38692 1080 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN11YML043C STR2P47164 639 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN11YML043C PEX21P50091 288 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN11YML043C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data5.78□□□□□ -1.48not detected
RRN11YML043C CLA4P48562 842 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN11YML043C CSC1Q06538 782 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN11YML043C ISM1P48526 1002 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN11YML043C NUD1P32336 851 aa5.74□□□□□ -1.49
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