RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W SET1P38827 1080 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
YKR104WYKR104W JIP4Q03361 876 aa10.71□□□□□ -0.69
YKR104WYKR104W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
YKR104WYKR104W SEC61P32915 480 aa10.68□□□□□ -0.7
YKR104WYKR104W YEL023CP39992 682 aa10.66□□□□□ -0.7
YKR104WYKR104W YJL171CP46992 396 aa10.66□□□□□ -0.7
YKR104WYKR104W PTC4P38089 393 aa10.65□□□□□ -0.7
YKR104WYKR104W NCR1Q12200 1170 aa10.64□□□□□ -0.71
YKR104WYKR104W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
YKR104WYKR104W DAN4P47179 1161 aa10.61□□□□□ -0.71
YKR104WYKR104W IFH1P39520 1085 aa10.6□□□□□ -0.71
YKR104WYKR104W BMT6Q12291 365 aa10.57□□□□□ -0.72
YKR104WYKR104W DMA1P38823 416 aa10.56□□□□□ -0.72
YKR104WYKR104W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
YKR104WYKR104W SOL3P38858 249 aa10.51□□□□□ -0.73
YKR104WYKR104W NST1P53935 1240 aa10.51□□□□□ -0.73
YKR104WYKR104W YGR273CP53329 174 aa10.5□□□□□ -0.73
YKR104WYKR104W AI4P03878 556 aa10.49□□□□□ -0.73
YKR104WYKR104W YDL129WQ07555 291 aa10.49□□□□□ -0.73
YKR104WYKR104W MPH3P0CE00 602 aa10.48□□□□□ -0.73
YKR104WYKR104W YPR148CQ06523 435 aa10.47□□□□□ -0.73
YKR104WYKR104W SAP30P38429 201 aa10.41□□□□□ -0.74
YKR104WYKR104W PML39Q03760 334 aa10.41□□□□□ -0.74
YKR104WYKR104W ILV3P39522 585 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
YKR104WYKR104W VPS70P47161 811 aa10.35□□□□□ -0.75
YKR104WYKR104W KEX1P09620 729 aa10.33□□□□□ -0.76
YKR104WYKR104W UBP14P38237 781 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
YKR104WYKR104W VHR2P40041 505 aa10.31□□□□□ -0.76
YKR104WYKR104W REF2P42073 533 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
YKR104WYKR104W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
YKR104WYKR104W MID1P41821 548 aa10.29□□□□□ -0.76
YKR104WYKR104W CKB1P43639 278 aa10.29□□□□□ -0.76
YKR104WYKR104W PEX29Q03370 554 aa10.29□□□□□ -0.76
YKR104WYKR104W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
YKR104WYKR104W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
YKR104WYKR104W PRE3P38624 215 aa10.27□□□□□ -0.77
YKR104WYKR104W SLI15P38283 698 aa10.26□□□□□ -0.77
YKR104WYKR104W RAD54P32863 898 aa10.25□□□□□ -0.77
YKR104WYKR104W KIC1P38692 1080 aa10.23□□□□□ -0.77
YKR104WYKR104W ARH1P48360 493 aa10.23□□□□□ -0.77
YKR104WYKR104W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
YKR104WYKR104W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
YKR104WYKR104W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data10.2□□□□□ -0.78 RIP-Chip
YKR104WYKR104W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
YKR104WYKR104W MPC54Q08550 464 aa10.19□□□□□ -0.78
YKR104WYKR104W YDR090CQ03193 310 aa10.18□□□□□ -0.78
YKR104WYKR104W DPL1Q05567 589 aa10.18□□□□□ -0.78
YKR104WYKR104W HAP5Q02516 242 aa10.16□□□□□ -0.78
YKR104WYKR104W COX6P00427 148 aa10.15□□□□□ -0.78
YKR104WYKR104W SPT23P35210 1082 aa10.13□□□□□ -0.79
YKR104WYKR104W NMA111P53920 997 aa10.12□□□□□ -0.79
YKR104WYKR104W YDR344CQ05510 147 aa10.12□□□□□ -0.79
YKR104WYKR104W PBS2P08018 668 aa10.11□□□□□ -0.79
YKR104WYKR104W ISU2Q12056 156 aa10.1□□□□□ -0.79
YKR104WYKR104W BNI4P53858 892 aa10.09□□□□□ -0.79
YKR104WYKR104W CDC73Q06697 393 aa10.09□□□□□ -0.79
YKR104WYKR104W BCK2P33306 851 aa10.07□□□□□ -0.8
YKR104WYKR104W PTC2P39966 464 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
YKR104WYKR104W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
YKR104WYKR104W DSF2P38213 736 aa10.02□□□□□ -0.81
YKR104WYKR104W CSC1Q06538 782 aa10.02□□□□□ -0.81
YKR104WYKR104W MAM3Q12296 706 aa10.01□□□□□ -0.81
YKR104WYKR104W PEX21P50091 288 aa10□□□□□ -0.81
YKR104WYKR104W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
YKR104WYKR104W VRP1P37370 817 aa9.99□□□□□ -0.81
YKR104WYKR104W ORC6P38826 435 aa9.99□□□□□ -0.81
YKR104WYKR104W TFB4Q12004 338 aa9.98□□□□□ -0.81
YKR104WYKR104W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
YKR104WYKR104W XDJ1P39102 459 aa9.91□□□□□ -0.82
YKR104WYKR104W IES2P40154 320 aa9.9□□□□□ -0.82
YKR104WYKR104W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
YKR104WYKR104W YRR1Q12172 810 aa9.89□□□□□ -0.83
YKR104WYKR104W MVP1P40959 511 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
YKR104WYKR104W RAM1P22007 431 aa9.87□□□□□ -0.83
YKR104WYKR104W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
YKR104WYKR104W PDR1P12383 1068 aa9.85□□□□□ -0.83
YKR104WYKR104W RGR1P19263 1082 aa9.85□□□□□ -0.83
YKR104WYKR104W NUP42P49686 430 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
YKR104WYKR104W YPR109WQ06104 294 aa9.81□□□□□ -0.84
YKR104WYKR104W YPR015CQ12531 247 aa9.81□□□□□ -0.84
YKR104WYKR104W CLB5P30283 435 aa9.8□□□□□ -0.84
YKR104WYKR104W NUD1P32336 851 aa9.78□□□□□ -0.84
YKR104WYKR104W NPL4P33755 580 aa9.78□□□□□ -0.84
YKR104WYKR104W GYP1Q08484 637 aa9.77□□□□□ -0.85
YKR104WYKR104W SAS4Q04003 481 aa9.76□□□□□ -0.85
YKR104WYKR104W DIT2P21595 489 aa9.75□□□□□ -0.85
YKR104WYKR104W STR2P47164 639 aa9.71□□□□□ -0.86
YKR104WYKR104W ISM1P48526 1002 aa9.71□□□□□ -0.86
YKR104WYKR104W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
YKR104WYKR104W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
YKR104WYKR104W PRT1P06103 763 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
YKR104WYKR104W TEA1P47988 759 aa9.7□□□□□ -0.86
YKR104WYKR104W LEU3P08638 886 aa9.66□□□□□ -0.86
YKR104WYKR104W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
YKR104WYKR104W GCD11P32481 527 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
YKR104WYKR104W ATF2P53296 535 aa9.65□□□□□ -0.86
YKR104WYKR104W DPS1P04802 557 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
YKR104WYKR104W RTF1P53064 558 aa9.6□□□□□ -0.87
YKR104WYKR104W PAT1P25644 796 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
YKR104WYKR104W TY1A-DR4O74302 440 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms