RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W SEC61P32915 480 aa7.05□□□□□ -1.28
YKR078WYKR078W DAN4P47179 1161 aa7.05□□□□□ -1.28
YKR078WYKR078W ATH1P48016 1211 aa7.05□□□□□ -1.28
YKR078WYKR078W JIP4Q03361 876 aa7.05□□□□□ -1.28
YKR078WYKR078W GUT1P32190 709 aa7.05□□□□□ -1.28
YKR078WYKR078W YEL023CP39992 682 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR078WYKR078W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YKR078WYKR078W PTC4P38089 393 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR078WYKR078W BMT6Q12291 365 aa7.02□□□□□ -1.29
YKR078WYKR078W SET1P38827 1080 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
YKR078WYKR078W SOL3P38858 249 aa6.98□□□□□ -1.29
YKR078WYKR078W NST1P53935 1240 aa6.98□□□□□ -1.29
YKR078WYKR078W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
YKR078WYKR078W YDL129WQ07555 291 aa6.93□□□□□ -1.3
YKR078WYKR078W SAP30P38429 201 aa6.92□□□□□ -1.3
YKR078WYKR078W MPH3P0CE00 602 aa6.9□□□□□ -1.3
YKR078WYKR078W YGR273CP53329 174 aa6.9□□□□□ -1.3
YKR078WYKR078W PML39Q03760 334 aa6.9□□□□□ -1.31
YKR078WYKR078W AI4P03878 556 aa6.89□□□□□ -1.31
YKR078WYKR078W ILV3P39522 585 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
YKR078WYKR078W MID1P41821 548 aa6.85□□□□□ -1.31
YKR078WYKR078W YDR344CQ05510 147 aa6.82□□□□□ -1.32
YKR078WYKR078W IFH1P39520 1085 aa6.81□□□□□ -1.32
YKR078WYKR078W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
YKR078WYKR078W PRE3P38624 215 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR078WYKR078W YPR148CQ06523 435 aa6.8□□□□□ -1.32
YKR078WYKR078W KEX1P09620 729 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR078WYKR078W UBP14P38237 781 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
YKR078WYKR078W DMA1P38823 416 aa6.78□□□□□ -1.32
YKR078WYKR078W SLI15P38283 698 aa6.77□□□□□ -1.33
YKR078WYKR078W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
YKR078WYKR078W VHR2P40041 505 aa6.77□□□□□ -1.33
YKR078WYKR078W ARH1P48360 493 aa6.75□□□□□ -1.33
YKR078WYKR078W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
YKR078WYKR078W PEX29Q03370 554 aa6.75□□□□□ -1.33
YKR078WYKR078W VPS70P47161 811 aa6.73□□□□□ -1.33
YKR078WYKR078W MPC54Q08550 464 aa6.73□□□□□ -1.33
YKR078WYKR078W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data6.72□□□□□ -1.33 RIP-Chip
YKR078WYKR078W REF2P42073 533 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
YKR078WYKR078W YDR090CQ03193 310 aa6.7□□□□□ -1.34
YKR078WYKR078W RAD54P32863 898 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR078WYKR078W NMA111P53920 997 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR078WYKR078W HAP5Q02516 242 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR078WYKR078W DPL1Q05567 589 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR078WYKR078W BCK2P33306 851 aa6.68□□□□□ -1.34
YKR078WYKR078W SPT23P35210 1082 aa6.67□□□□□ -1.34
YKR078WYKR078W CDC73Q06697 393 aa6.67□□□□□ -1.34
YKR078WYKR078W VRP1P37370 817 aa6.64□□□□□ -1.35
YKR078WYKR078W BNI4P53858 892 aa6.64□□□□□ -1.35
YKR078WYKR078W ISU2Q12056 156 aa6.63□□□□□ -1.35
YKR078WYKR078W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
YKR078WYKR078W KIC1P38692 1080 aa6.62□□□□□ -1.35
YKR078WYKR078W COX6P00427 148 aa6.61□□□□□ -1.35
YKR078WYKR078W CKB1P43639 278 aa6.61□□□□□ -1.35
YKR078WYKR078W PTC2P39966 464 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YKR078WYKR078W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YKR078WYKR078W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YKR078WYKR078W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
YKR078WYKR078W XDJ1P39102 459 aa6.57□□□□□ -1.36
YKR078WYKR078W PBS2P08018 668 aa6.56□□□□□ -1.36
YKR078WYKR078W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
YKR078WYKR078W RAM1P22007 431 aa6.55□□□□□ -1.36
YKR078WYKR078W PDR1P12383 1068 aa6.54□□□□□ -1.36
YKR078WYKR078W ORC6P38826 435 aa6.54□□□□□ -1.36
YKR078WYKR078W YPR015CQ12531 247 aa6.54□□□□□ -1.36
YKR078WYKR078W CSC1Q06538 782 aa6.52□□□□□ -1.37
YKR078WYKR078W PEX21P50091 288 aa6.5□□□□□ -1.37
YKR078WYKR078W TFB4Q12004 338 aa6.5□□□□□ -1.37
YKR078WYKR078W YRR1Q12172 810 aa6.5□□□□□ -1.37
YKR078WYKR078W DSF2P38213 736 aa6.48□□□□□ -1.37
YKR078WYKR078W MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YKR078WYKR078W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YKR078WYKR078W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
YKR078WYKR078W MAM3Q12296 706 aa6.46□□□□□ -1.37
YKR078WYKR078W RGR1P19263 1082 aa6.46□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W YPR109WQ06104 294 aa6.44□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W IES2P40154 320 aa6.42□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W NUD1P32336 851 aa6.41□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W STR2P47164 639 aa6.41□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W GYP1Q08484 637 aa6.41□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W ISM1P48526 1002 aa6.41□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W DPS1P04802 557 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
YKR078WYKR078W SAS4Q04003 481 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR078WYKR078W DIT2P21595 489 aa6.37□□□□□ -1.39
YKR078WYKR078W PRT1P06103 763 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YKR078WYKR078W NPL4P33755 580 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR078WYKR078W SDH2P21801 266 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR078WYKR078W TY1A-DR4O74302 440 aa6.34□□□□□ -1.4
YKR078WYKR078W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
YKR078WYKR078W TY1A-AP0CX57 440 aa6.34□□□□□ -1.4
YKR078WYKR078W TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.34□□□□□ -1.4
YKR078WYKR078W TY1A-ORP0CX59 440 aa6.34□□□□□ -1.4
YKR078WYKR078W TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.34□□□□□ -1.4
YKR078WYKR078W TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.34□□□□□ -1.4
YKR078WYKR078W TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.34□□□□□ -1.4
YKR078WYKR078W TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.34□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.4 ms