RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W

YHR213W, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeastyeast

Gene YHR213W, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR213WYHR213W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
YHR213WYHR213W COQ8P27697 501 aa7.75□□□□□ -1.17
YHR213WYHR213W PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
YHR213WYHR213W PTC4P38089 393 aa7.74□□□□□ -1.17
YHR213WYHR213W ATH1P48016 1211 aa7.74□□□□□ -1.17
YHR213WYHR213W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
YHR213WYHR213W GUT1P32190 709 aa7.73□□□□□ -1.17
YHR213WYHR213W EDS1P38073 919 aa7.73□□□□□ -1.17
YHR213WYHR213W YEL023CP39992 682 aa7.73□□□□□ -1.17
YHR213WYHR213W DAN4P47179 1161 aa7.72□□□□□ -1.17
YHR213WYHR213W YDL129WQ07555 291 aa7.66□□□□□ -1.18
YHR213WYHR213W SAP30P38429 201 aa7.62□□□□□ -1.19
YHR213WYHR213W AI4P03878 556 aa7.56□□□□□ -1.2
YHR213WYHR213W SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
YHR213WYHR213W MPH3P0CE00 602 aa7.55□□□□□ -1.2
YHR213WYHR213W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
YHR213WYHR213W NST1P53935 1240 aa7.55□□□□□ -1.2
YHR213WYHR213W PML39Q03760 334 aa7.55□□□□□ -1.2
YHR213WYHR213W SOL3P38858 249 aa7.54□□□□□ -1.2
YHR213WYHR213W YGR273CP53329 174 aa7.53□□□□□ -1.2
YHR213WYHR213W PRE3P38624 215 aa7.52□□□□□ -1.21
YHR213WYHR213W IFH1P39520 1085 aa7.51□□□□□ -1.21
YHR213WYHR213W PEX29Q03370 554 aa7.46□□□□□ -1.22
YHR213WYHR213W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
YHR213WYHR213W MID1P41821 548 aa7.44□□□□□ -1.22
YHR213WYHR213W ARH1P48360 493 aa7.44□□□□□ -1.22
YHR213WYHR213W BCK2P33306 851 aa7.43□□□□□ -1.22
YHR213WYHR213W ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
YHR213WYHR213W KEX1P09620 729 aa7.39□□□□□ -1.23
YHR213WYHR213W SPT23P35210 1082 aa7.37□□□□□ -1.23
YHR213WYHR213W SLI15P38283 698 aa7.37□□□□□ -1.23
YHR213WYHR213W HAP5Q02516 242 aa7.37□□□□□ -1.23
YHR213WYHR213W YPR148CQ06523 435 aa7.37□□□□□ -1.23
YHR213WYHR213W MPC54Q08550 464 aa7.36□□□□□ -1.23
YHR213WYHR213W UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YHR213WYHR213W YDR344CQ05510 147 aa7.34□□□□□ -1.23
YHR213WYHR213W DPL1Q05567 589 aa7.34□□□□□ -1.23
YHR213WYHR213W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
YHR213WYHR213W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W VHR2P40041 505 aa7.33□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W BNI4P53858 892 aa7.33□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W RAD54P32863 898 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W VRP1P37370 817 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W XDJ1P39102 459 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W NMA111P53920 997 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W KIC1P38692 1080 aa7.29□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.28□□□□□ -1.24not detected
YHR213WYHR213W PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W ISU2Q12056 156 aa7.28□□□□□ -1.24
YHR213WYHR213W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
YHR213WYHR213W VPS70P47161 811 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR213WYHR213W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YHR213WYHR213W YDR090CQ03193 310 aa7.23□□□□□ -1.25
YHR213WYHR213W CDC73Q06697 393 aa7.23□□□□□ -1.25
YHR213WYHR213W DMA1P38823 416 aa7.21□□□□□ -1.26
YHR213WYHR213W CKB1P43639 278 aa7.21□□□□□ -1.26
YHR213WYHR213W COX6P00427 148 aa7.18□□□□□ -1.26
YHR213WYHR213W PEX21P50091 288 aa7.16□□□□□ -1.26
YHR213WYHR213W CSC1Q06538 782 aa7.16□□□□□ -1.26
YHR213WYHR213W TFB4Q12004 338 aa7.15□□□□□ -1.26
YHR213WYHR213W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
YHR213WYHR213W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
YHR213WYHR213W RAM1P22007 431 aa7.12□□□□□ -1.27
YHR213WYHR213W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
YHR213WYHR213W PBS2P08018 668 aa7.1□□□□□ -1.27
YHR213WYHR213W ORC6P38826 435 aa7.1□□□□□ -1.27
YHR213WYHR213W SAS4Q04003 481 aa7.09□□□□□ -1.27
YHR213WYHR213W YPR015CQ12531 247 aa7.09□□□□□ -1.27
YHR213WYHR213W PDR1P12383 1068 aa7.08□□□□□ -1.28
YHR213WYHR213W GYP1Q08484 637 aa7.08□□□□□ -1.28
YHR213WYHR213W YRR1Q12172 810 aa7.08□□□□□ -1.28
YHR213WYHR213W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YHR213WYHR213W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
YHR213WYHR213W MVP1P40959 511 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
YHR213WYHR213W MAM3Q12296 706 aa7.03□□□□□ -1.28
YHR213WYHR213W NPL4P33755 580 aa7.02□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W NUD1P32336 851 aa7.01□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W DSF2P38213 736 aa7.01□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W PRT1P06103 763 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W RGR1P19263 1082 aa7□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W YPR109WQ06104 294 aa6.98□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W CLB5P30283 435 aa6.97□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W STR2P47164 639 aa6.97□□□□□ -1.29
YHR213WYHR213W ISM1P48526 1002 aa6.96□□□□□ -1.3
YHR213WYHR213W YEL077CQ3E7X8 1277 aa6.96□□□□□ -1.3
YHR213WYHR213W AMS1P22855 1083 aa6.95□□□□□ -1.3
YHR213WYHR213W IES2P40154 320 aa6.94□□□□□ -1.3
YHR213WYHR213W GCD11P32481 527 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
YHR213WYHR213W ERG12P07277 443 aa6.91□□□□□ -1.3
YHR213WYHR213W RAS1P01119 309 aa6.9□□□□□ -1.3
YHR213WYHR213W PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
YHR213WYHR213W SDH2P21801 266 aa6.89□□□□□ -1.31
YHR213WYHR213W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
YHR213WYHR213W NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
YHR213WYHR213W TY1A-DR4O74302 440 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 93.4 ms