RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631166.1

HS1BP3-208, Transcript of HCLS1 binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene HS1BP3, Length 78 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRELP	P51888	382 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HS1BP3-208	ENST00000631166	HMGXB3	Q12766	1538 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HS1BP3-208	ENST00000631166	TSPOAP1	O95153	1857 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HS1BP3-208	ENST00000631166	DIP2B	Q9P265	1576 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HS1BP3-208	ENST00000631166	SYNJ1	O43426	1573 aa		5.33	□□□□□ -1.56
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
HS1BP3-208	ENST00000631166	TOM1	O60784	492 aa		5.33	□□□□□ -1.56
HS1BP3-208	ENST00000631166	MAPKBP1	O60336	1514 aa		5.3	□□□□□ -1.56
HS1BP3-208	ENST00000631166	CEP350	Q5VT06	3117 aa		5.3	□□□□□ -1.56
HS1BP3-208	ENST00000631166	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		5.3	□□□□□ -1.56
HS1BP3-208	ENST00000631166	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	5.29	□□□□□ -1.56
HS1BP3-208	ENST00000631166	SMARCA4	P51532	1647 aa		5.29	□□□□□ -1.56
HS1BP3-208	ENST00000631166	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
HS1BP3-208	ENST00000631166	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		5.27	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	TRIM52	Q96A61	297 aa		5.25	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		5.24	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		5.24	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	TNS4	Q8IZW8	715 aa		5.23	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
HS1BP3-208	ENST00000631166	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		5.19	□□□□□ -1.58
HS1BP3-208	ENST00000631166	STRC	Q7RTU9	1775 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HS1BP3-208	ENST00000631166	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		5.17	□□□□□ -1.58
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIF21B	O75037	1637 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HS1BP3-208	ENST00000631166	RXRB	P28702	533 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	MPND	Q8N594	471 aa		5.14	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	LRP5	O75197	1615 aa		5.14	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	MADD	Q8WXG6	1647 aa		5.13	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	PTPRK	Q15262	1439 aa		5.12	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	CCDC125	Q86Z20	511 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	GLI2	P10070	1586 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	CEP170	Q5SW79	1584 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		5.1	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
HS1BP3-208	ENST00000631166	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		5.08	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	HRC	P23327	699 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	FAM161A	Q3B820	660 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	HSPA6	P17066	643 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	CFTR	P13569	1480 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	ASXL2	Q76L83	1435 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	JPH4	Q96JJ6	628 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HS1BP3-208	ENST00000631166	TOPBP1	Q92547	1522 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	RAPGEF3	O95398	923 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	ABCC8	Q09428	1581 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIAA0556	O60303	1618 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	DLL1	O00548	723 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	GRIN2B	Q13224	1484 aa		5	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		5	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	NCOA1	Q15788	1441 aa		5	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		5	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		5	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	PKD2	Q13563	968 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	MLEC	Q14165	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	SHROOM2	Q13796	1616 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	CPS1	P31327	1500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	CUX1	P39880	1505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HS1BP3-208	ENST00000631166	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	NGLY1	Q96IV0	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	SOGA1	O94964	1423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HS1BP3-208	ENST00000631166	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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