RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRT-210ENST00000617474 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRT-210ENST00000617474 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PTPRT-210ENST00000617474 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRT-210ENST00000617474 SLC24A1O60721 1099 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRT-210ENST00000617474 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 ABCC8Q09428 1581 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 NACADO15069 1562 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 NEFMP07197 916 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 TSPY4P0CV99 314 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 TSPY10P0CW01 314 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 RGL3Q3MIN7 710 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRT-210ENST00000617474 KCNH8Q96L42 1107 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRT-210ENST00000617474 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRT-210ENST00000617474 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRT-210ENST00000617474 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRT-210ENST00000617474 KIF27Q86VH2 1401 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRT-210ENST00000617474 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRT-210ENST00000617474 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRT-210ENST00000617474 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PTPRT-210ENST00000617474 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTPRT-210ENST00000617474 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PTPRT-210ENST00000617474 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTPRT-210ENST00000617474 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRT-210ENST00000617474 CCER2I3L3R5 266 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRT-210ENST00000617474 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRT-210ENST00000617474 FOXD1Q16676 465 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRT-210ENST00000617474 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRT-210ENST00000617474 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PTPRT-210ENST00000617474 RGS3P49796 1198 aa20.39■□□□□ 0.86
PTPRT-210ENST00000617474 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRT-210ENST00000617474 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRT-210ENST00000617474 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRT-210ENST00000617474 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRT-210ENST00000617474 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRT-210ENST00000617474 NEUROD2Q15784 382 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRT-210ENST00000617474 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 CUX2O14529 1486 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 WIZO95785 1651 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRT-210ENST00000617474 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PTPRT-210ENST00000617474 BECN1Q14457 450 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRT-210ENST00000617474 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRT-210ENST00000617474 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRT-210ENST00000617474 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PTPRT-210ENST00000617474 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRT-210ENST00000617474 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRT-210ENST00000617474 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRT-210ENST00000617474 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRT-210ENST00000617474 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRT-210ENST00000617474 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRT-210ENST00000617474 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRT-210ENST00000617474 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRT-210ENST00000617474 PKD2Q13563 968 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRT-210ENST00000617474 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRT-210ENST00000617474 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRT-210ENST00000617474 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRT-210ENST00000617474 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRT-210ENST00000617474 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRT-210ENST00000617474 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRT-210ENST00000617474 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRT-210ENST00000617474 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
PTPRT-210ENST00000617474 CDCA8Q53HL2 280 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRT-210ENST00000617474 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRT-210ENST00000617474 CFAP53Q96M91 514 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRT-210ENST00000617474 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 NUDCQ9Y266 331 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 TMF1P82094 1093 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 PLEKHG5O94827 1062 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 GOLGA6L22H0YM25 854 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRT-210ENST00000617474 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRT-210ENST00000617474 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRT-210ENST00000617474 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRT-210ENST00000617474 FMN1Q68DA7 1419 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRT-210ENST00000617474 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
PTPRT-210ENST00000617474 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRT-210ENST00000617474 SLC4A3P48751 1232 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRT-210ENST00000617474 NUP155O75694 1391 aa19.88■□□□□ 0.77
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