RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609571.5

ATRNL1-209, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATRNL1, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-209ENST00000609571 GRIN2BQ13224 1484 aa42.12■■■■■ 4.33
ATRNL1-209ENST00000609571 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.1■■■■■ 4.33
ATRNL1-209ENST00000609571 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.09■■■■■ 4.33
ATRNL1-209ENST00000609571 ADAMTS12P58397 1594 aa42.07■■■■■ 4.32
ATRNL1-209ENST00000609571 MAP3K1Q13233 1512 aa42.03■■■■■ 4.32
ATRNL1-209ENST00000609571 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
ATRNL1-209ENST00000609571 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
ATRNL1-209ENST00000609571 SAMD9Q5K651 1589 aa41.9■■■■■ 4.3
ATRNL1-209ENST00000609571 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
ATRNL1-209ENST00000609571 TIAM1Q13009 1591 aa41.85■■■■■ 4.29
ATRNL1-209ENST00000609571 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.82■■■■■ 4.29
ATRNL1-209ENST00000609571 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
ATRNL1-209ENST00000609571 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
ATRNL1-209ENST00000609571 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.79■■■■■ 4.28
ATRNL1-209ENST00000609571 FMN1Q68DA7 1419 aa41.78■■■■■ 4.28
ATRNL1-209ENST00000609571 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.76■■■■■ 4.27
ATRNL1-209ENST00000609571 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.75■■■■■ 4.27
ATRNL1-209ENST00000609571 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.73■■■■■ 4.27
ATRNL1-209ENST00000609571 IQGAP2Q13576 1575 aa41.73■■■■■ 4.27
ATRNL1-209ENST00000609571 P3H3Q8IVL6 736 aa41.72■■■■■ 4.27
ATRNL1-209ENST00000609571 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
ATRNL1-209ENST00000609571 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.63■■■■■ 4.26
ATRNL1-209ENST00000609571 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
ATRNL1-209ENST00000609571 GRIN2AQ12879 1464 aa41.6■■■■■ 4.25
ATRNL1-209ENST00000609571 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.56■■■■■ 4.24
ATRNL1-209ENST00000609571 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.56■■■■■ 4.24
ATRNL1-209ENST00000609571 SYNJ2O15056 1496 aa41.54■■■■■ 4.24
ATRNL1-209ENST00000609571 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
ATRNL1-209ENST00000609571 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.23
ATRNL1-209ENST00000609571 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
ATRNL1-209ENST00000609571 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.41■■■■■ 4.22
ATRNL1-209ENST00000609571 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
ATRNL1-209ENST00000609571 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
ATRNL1-209ENST00000609571 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.31■■■■■ 4.2
ATRNL1-209ENST00000609571 CEP170Q5SW79 1584 aa41.31■■■■■ 4.2
ATRNL1-209ENST00000609571 KIAA0556O60303 1618 aa41.29■■■■■ 4.2
ATRNL1-209ENST00000609571 NUP160Q12769 1436 aa41.29■■■■■ 4.2
ATRNL1-209ENST00000609571 HECW1Q76N89 1606 aa41.28■■■■■ 4.2
ATRNL1-209ENST00000609571 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.28■■■■■ 4.2
ATRNL1-209ENST00000609571 DISP1Q96F81 1524 aa41.26■■■■■ 4.19
ATRNL1-209ENST00000609571 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.23■■■■■ 4.19
ATRNL1-209ENST00000609571 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.16■■■■■ 4.18
ATRNL1-209ENST00000609571 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.16■■■■■ 4.18
ATRNL1-209ENST00000609571 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.11■■■■■ 4.17
ATRNL1-209ENST00000609571 FBLN2P98095 1184 aa41.09■■■■■ 4.17
ATRNL1-209ENST00000609571 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
ATRNL1-209ENST00000609571 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
ATRNL1-209ENST00000609571 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.01■■■■■ 4.16
ATRNL1-209ENST00000609571 NCOA2Q15596 1464 aa40.97■■■■■ 4.15
ATRNL1-209ENST00000609571 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.97■■■■■ 4.15
ATRNL1-209ENST00000609571 ARHGEF11O15085 1522 aa40.96■■■■■ 4.15
ATRNL1-209ENST00000609571 JPH4Q96JJ6 628 aa40.95■■■■■ 4.15
ATRNL1-209ENST00000609571 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.95■■■■■ 4.15
ATRNL1-209ENST00000609571 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.94■■■■■ 4.14
ATRNL1-209ENST00000609571 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.89■■■■■ 4.14
ATRNL1-209ENST00000609571 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.89■■■■■ 4.14
ATRNL1-209ENST00000609571 CHD1O14646 1710 aa40.88■■■■■ 4.13
ATRNL1-209ENST00000609571 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
ATRNL1-209ENST00000609571 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
ATRNL1-209ENST00000609571 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
ATRNL1-209ENST00000609571 ITGAEP38570 1179 aa40.8■■■■■ 4.12
ATRNL1-209ENST00000609571 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
ATRNL1-209ENST00000609571 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.75■■■■■ 4.11
ATRNL1-209ENST00000609571 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.69■■■■■ 4.1
ATRNL1-209ENST00000609571 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.69■■■■■ 4.1
ATRNL1-209ENST00000609571 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
ATRNL1-209ENST00000609571 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
ATRNL1-209ENST00000609571 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.68■■■■■ 4.1
ATRNL1-209ENST00000609571 ABCA8O94911 1581 aa40.67■■■■■ 4.1
ATRNL1-209ENST00000609571 SHROOM2Q13796 1616 aa40.67■■■■■ 4.1
ATRNL1-209ENST00000609571 MIA2Q96PC5 1412 aa40.66■■■■■ 4.1
ATRNL1-209ENST00000609571 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
ATRNL1-209ENST00000609571 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
ATRNL1-209ENST00000609571 ARID3CA6NKF2 412 aa40.53■■■■■ 4.08
ATRNL1-209ENST00000609571 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.51■■■■■ 4.08
ATRNL1-209ENST00000609571 PTPRGP23470 1445 aa40.48■■■■■ 4.07
ATRNL1-209ENST00000609571 HFM1A2PYH4 1435 aa40.47■■■■■ 4.07
ATRNL1-209ENST00000609571 PTPRKQ15262 1439 aa40.46■■■■■ 4.07
ATRNL1-209ENST00000609571 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.44■■■■■ 4.06
ATRNL1-209ENST00000609571 ATP10BO94823 1461 aa40.39■■■■■ 4.06
ATRNL1-209ENST00000609571 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.37■■■■■ 4.05
ATRNL1-209ENST00000609571 AKNAQ7Z591 1439 aa40.36■■■■■ 4.05
ATRNL1-209ENST00000609571 MAPKBP1O60336 1514 aa40.34■■■■■ 4.05
ATRNL1-209ENST00000609571 NAIPQ13075 1403 aa40.31■■■■■ 4.04
ATRNL1-209ENST00000609571 UACAQ9BZF9 1416 aa40.28■■■■■ 4.04
ATRNL1-209ENST00000609571 KIF14Q15058 1648 aa40.28■■■■■ 4.04
ATRNL1-209ENST00000609571 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.28■■■■■ 4.04
ATRNL1-209ENST00000609571 OSCARQ8IYS5 282 aa40.27■■■■■ 4.04
ATRNL1-209ENST00000609571 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.27■■■■■ 4.04
ATRNL1-209ENST00000609571 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
ATRNL1-209ENST00000609571 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
ATRNL1-209ENST00000609571 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.2■■■■■ 4.03
ATRNL1-209ENST00000609571 DAPK1P53355 1430 aa40.17■■■■■ 4.02
ATRNL1-209ENST00000609571 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.17■■■■■ 4.02
ATRNL1-209ENST00000609571 ABCC2Q92887 1545 aa40.16■■■■■ 4.02
ATRNL1-209ENST00000609571 ROCK1Q13464 1354 aa40.15■■■■■ 4.02
ATRNL1-209ENST00000609571 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
ATRNL1-209ENST00000609571 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.12■■■■■ 4.01
ATRNL1-209ENST00000609571 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
ATRNL1-209ENST00000609571 ABCC5O15440 1437 aa40.11■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms