RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609024.5

CHMP4A-211, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHMP4A, Length 735 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-211ENST00000609024 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.86■■■□□ 2.53
CHMP4A-211ENST00000609024 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.81■■■□□ 2.52
CHMP4A-211ENST00000609024 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.74■■■□□ 2.51
CHMP4A-211ENST00000609024 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.71■■■□□ 2.51
CHMP4A-211ENST00000609024 MAPKBP1O60336 1514 aa30.67■■■□□ 2.5
CHMP4A-211ENST00000609024 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.6■■■□□ 2.49
CHMP4A-211ENST00000609024 DIP2BQ9P265 1576 aa30.59■■■□□ 2.49
CHMP4A-211ENST00000609024 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.59■■■□□ 2.49
CHMP4A-211ENST00000609024 KIF27Q86VH2 1401 aa30.55■■■□□ 2.48
CHMP4A-211ENST00000609024 KDM6BO15054 1643 aa30.54■■■□□ 2.48
CHMP4A-211ENST00000609024 CUL7Q14999 1698 aa30.52■■■□□ 2.48
CHMP4A-211ENST00000609024 IGF1RP08069 1367 aa30.51■■■□□ 2.47
CHMP4A-211ENST00000609024 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CHMP4A-211ENST00000609024 TSPOAP1O95153 1857 aa30.48■■■□□ 2.47
CHMP4A-211ENST00000609024 PTPRGP23470 1445 aa30.46■■■□□ 2.47
CHMP4A-211ENST00000609024 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.4■■■□□ 2.46
CHMP4A-211ENST00000609024 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.36■■■□□ 2.45
CHMP4A-211ENST00000609024 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.36■■■□□ 2.45
CHMP4A-211ENST00000609024 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.34■■■□□ 2.45
CHMP4A-211ENST00000609024 ABCC2Q92887 1545 aa30.3■■■□□ 2.44
CHMP4A-211ENST00000609024 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.27■■■□□ 2.44
CHMP4A-211ENST00000609024 ASXL2Q76L83 1435 aa30.25■■■□□ 2.43
CHMP4A-211ENST00000609024 IQGAP2Q13576 1575 aa30.24■■■□□ 2.43
CHMP4A-211ENST00000609024 UACAQ9BZF9 1416 aa30.18■■■□□ 2.42
CHMP4A-211ENST00000609024 GLI2P10070 1586 aa30.17■■■□□ 2.42
CHMP4A-211ENST00000609024 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.17■■■□□ 2.42
CHMP4A-211ENST00000609024 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CHMP4A-211ENST00000609024 DISP1Q96F81 1524 aa30.06■■■□□ 2.4
CHMP4A-211ENST00000609024 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.06■■■□□ 2.4
CHMP4A-211ENST00000609024 ADGRL1O94910 1474 aa30.06■■■□□ 2.4
CHMP4A-211ENST00000609024 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
CHMP4A-211ENST00000609024 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.03■■■□□ 2.4
CHMP4A-211ENST00000609024 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.02■■■□□ 2.4
CHMP4A-211ENST00000609024 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.99■■■□□ 2.39
CHMP4A-211ENST00000609024 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.99■■■□□ 2.39
CHMP4A-211ENST00000609024 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CHMP4A-211ENST00000609024 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CHMP4A-211ENST00000609024 KIAA0556O60303 1618 aa29.95■■■□□ 2.38
CHMP4A-211ENST00000609024 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CHMP4A-211ENST00000609024 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.88■■■□□ 2.37
CHMP4A-211ENST00000609024 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CHMP4A-211ENST00000609024 KCNH8Q96L42 1107 aa29.83■■■□□ 2.37
CHMP4A-211ENST00000609024 GOLGA3Q08378 1498 aa29.82■■■□□ 2.36
CHMP4A-211ENST00000609024 CD109Q6YHK3 1445 aa29.79■■■□□ 2.36
CHMP4A-211ENST00000609024 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.79■■■□□ 2.36
CHMP4A-211ENST00000609024 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.77■■■□□ 2.36
CHMP4A-211ENST00000609024 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.74■■■□□ 2.35
CHMP4A-211ENST00000609024 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.73■■■□□ 2.35
CHMP4A-211ENST00000609024 ABCA8O94911 1581 aa29.68■■■□□ 2.34
CHMP4A-211ENST00000609024 ARID3CA6NKF2 412 aa29.59■■■□□ 2.33
CHMP4A-211ENST00000609024 KIF21BO75037 1637 aa29.55■■■□□ 2.32
CHMP4A-211ENST00000609024 P3H3Q8IVL6 736 aa29.54■■■□□ 2.32
CHMP4A-211ENST00000609024 PRXQ9BXM0 1461 aa29.52■■■□□ 2.32
CHMP4A-211ENST00000609024 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.5■■■□□ 2.31
CHMP4A-211ENST00000609024 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CHMP4A-211ENST00000609024 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CHMP4A-211ENST00000609024 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.48■■■□□ 2.31
CHMP4A-211ENST00000609024 ATP10BO94823 1461 aa29.46■■■□□ 2.31
CHMP4A-211ENST00000609024 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.39■■■□□ 2.3
CHMP4A-211ENST00000609024 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CHMP4A-211ENST00000609024 RAPGEF3O95398 923 aa29.37■■■□□ 2.29
CHMP4A-211ENST00000609024 PTPRMP28827 1452 aa29.34■■■□□ 2.29
CHMP4A-211ENST00000609024 NEO1Q92859 1461 aa29.34■■■□□ 2.29
CHMP4A-211ENST00000609024 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.33■■■□□ 2.29
CHMP4A-211ENST00000609024 FBXO41Q8TF61 875 aa29.32■■■□□ 2.28
CHMP4A-211ENST00000609024 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.3■■■□□ 2.28
CHMP4A-211ENST00000609024 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.29■■■□□ 2.28
CHMP4A-211ENST00000609024 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CHMP4A-211ENST00000609024 SAMD9Q5K651 1589 aa29.28■■■□□ 2.28
CHMP4A-211ENST00000609024 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.23■■■□□ 2.27
CHMP4A-211ENST00000609024 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.21■■■□□ 2.27
CHMP4A-211ENST00000609024 MADDQ8WXG6 1647 aa29.18■■■□□ 2.26
CHMP4A-211ENST00000609024 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CHMP4A-211ENST00000609024 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CHMP4A-211ENST00000609024 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.16■■■□□ 2.26
CHMP4A-211ENST00000609024 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
CHMP4A-211ENST00000609024 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.13■■■□□ 2.25
CHMP4A-211ENST00000609024 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.12■■■□□ 2.25
CHMP4A-211ENST00000609024 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.11■■■□□ 2.25
CHMP4A-211ENST00000609024 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.11■■■□□ 2.25
CHMP4A-211ENST00000609024 AKNAQ7Z591 1439 aa29.11■■■□□ 2.25
CHMP4A-211ENST00000609024 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.1■■■□□ 2.25
CHMP4A-211ENST00000609024 FANCAO15360 1455 aa29.1■■■□□ 2.25
CHMP4A-211ENST00000609024 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CHMP4A-211ENST00000609024 EEA1Q15075 1411 aa29.08■■■□□ 2.25
CHMP4A-211ENST00000609024 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.06■■■□□ 2.24
CHMP4A-211ENST00000609024 RICTORQ6R327 1708 aa29.05■■■□□ 2.24
CHMP4A-211ENST00000609024 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
CHMP4A-211ENST00000609024 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.99■■■□□ 2.23
CHMP4A-211ENST00000609024 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.99■■■□□ 2.23
CHMP4A-211ENST00000609024 HSPA2P54652 639 aa28.98■■■□□ 2.23
CHMP4A-211ENST00000609024 MLECQ14165 292 aa28.98■■■□□ 2.23
CHMP4A-211ENST00000609024 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.95■■■□□ 2.23
CHMP4A-211ENST00000609024 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.95■■■□□ 2.22
CHMP4A-211ENST00000609024 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.95■■■□□ 2.22
CHMP4A-211ENST00000609024 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CHMP4A-211ENST00000609024 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.92■■■□□ 2.22
CHMP4A-211ENST00000609024 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.89■■■□□ 2.22
CHMP4A-211ENST00000609024 HECW1Q76N89 1606 aa28.87■■■□□ 2.21
CHMP4A-211ENST00000609024 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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