RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, human

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGMS1-208	ENST00000608287	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		34.2	■■■■□ 3.06
SGMS1-208	ENST00000608287	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		34.16	■■■■□ 3.06
SGMS1-208	ENST00000608287	MAPKBP1	O60336	1514 aa		34.15	■■■■□ 3.06
SGMS1-208	ENST00000608287	JPH4	Q96JJ6	628 aa		34.15	■■■■□ 3.06
SGMS1-208	ENST00000608287	DIP2B	Q9P265	1576 aa		34.06	■■■■□ 3.04
SGMS1-208	ENST00000608287	KDM6B	O15054	1643 aa		34.03	■■■■□ 3.04
SGMS1-208	ENST00000608287	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		34.03	■■■■□ 3.04
SGMS1-208	ENST00000608287	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.93	■■■■□ 3.02
SGMS1-208	ENST00000608287	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.87	■■■■□ 3.01
SGMS1-208	ENST00000608287	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.83	■■■■□ 3.01
SGMS1-208	ENST00000608287	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.8	■■■■□ 3
SGMS1-208	ENST00000608287	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
SGMS1-208	ENST00000608287	CUL7	Q14999	1698 aa		33.68	■■■□□ 2.98
SGMS1-208	ENST00000608287	PTPRG	P23470	1445 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SGMS1-208	ENST00000608287	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.59	■■■□□ 2.97
SGMS1-208	ENST00000608287	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.58	■■■□□ 2.97
SGMS1-208	ENST00000608287	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.58	■■■□□ 2.97
SGMS1-208	ENST00000608287	KIF27	Q86VH2	1401 aa		33.58	■■■□□ 2.97
SGMS1-208	ENST00000608287	GLI2	P10070	1586 aa		33.58	■■■□□ 2.97
SGMS1-208	ENST00000608287	IGF1R	P08069	1367 aa		33.53	■■■□□ 2.96
SGMS1-208	ENST00000608287	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.53	■■■□□ 2.96
SGMS1-208	ENST00000608287	ADGRL1	O94910	1474 aa		33.52	■■■□□ 2.96
SGMS1-208	ENST00000608287	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.51	■■■□□ 2.95
SGMS1-208	ENST00000608287	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
SGMS1-208	ENST00000608287	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SGMS1-208	ENST00000608287	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SGMS1-208	ENST00000608287	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
SGMS1-208	ENST00000608287	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SGMS1-208	ENST00000608287	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.36	■■■□□ 2.93
SGMS1-208	ENST00000608287	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SGMS1-208	ENST00000608287	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SGMS1-208	ENST00000608287	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SGMS1-208	ENST00000608287	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
SGMS1-208	ENST00000608287	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SGMS1-208	ENST00000608287	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
SGMS1-208	ENST00000608287	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SGMS1-208	ENST00000608287	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
SGMS1-208	ENST00000608287	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SGMS1-208	ENST00000608287	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SGMS1-208	ENST00000608287	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SGMS1-208	ENST00000608287	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SGMS1-208	ENST00000608287	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SGMS1-208	ENST00000608287	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SGMS1-208	ENST00000608287	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SGMS1-208	ENST00000608287	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SGMS1-208	ENST00000608287	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SGMS1-208	ENST00000608287	KIF21B	O75037	1637 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SGMS1-208	ENST00000608287	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SGMS1-208	ENST00000608287	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SGMS1-208	ENST00000608287	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SGMS1-208	ENST00000608287	ABCA8	O94911	1581 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SGMS1-208	ENST00000608287	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SGMS1-208	ENST00000608287	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SGMS1-208	ENST00000608287	PTPRM	P28827	1452 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SGMS1-208	ENST00000608287	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SGMS1-208	ENST00000608287	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SGMS1-208	ENST00000608287	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SGMS1-208	ENST00000608287	NEO1	Q92859	1461 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SGMS1-208	ENST00000608287	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SGMS1-208	ENST00000608287	ATP10B	O94823	1461 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SGMS1-208	ENST00000608287	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SGMS1-208	ENST00000608287	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SGMS1-208	ENST00000608287	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SGMS1-208	ENST00000608287	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SGMS1-208	ENST00000608287	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SGMS1-208	ENST00000608287	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SGMS1-208	ENST00000608287	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SGMS1-208	ENST00000608287	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SGMS1-208	ENST00000608287	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SGMS1-208	ENST00000608287	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SGMS1-208	ENST00000608287	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SGMS1-208	ENST00000608287	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SGMS1-208	ENST00000608287	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SGMS1-208	ENST00000608287	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SGMS1-208	ENST00000608287	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
SGMS1-208	ENST00000608287	FANCA	O15360	1455 aa		32.25	■■■□□ 2.75
SGMS1-208	ENST00000608287	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SGMS1-208	ENST00000608287	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SGMS1-208	ENST00000608287	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SGMS1-208	ENST00000608287	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SGMS1-208	ENST00000608287	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SGMS1-208	ENST00000608287	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SGMS1-208	ENST00000608287	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SGMS1-208	ENST00000608287	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SGMS1-208	ENST00000608287	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SGMS1-208	ENST00000608287	HSPA2	P54652	639 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SGMS1-208	ENST00000608287	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SGMS1-208	ENST00000608287	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
SGMS1-208	ENST00000608287	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SGMS1-208	ENST00000608287	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SGMS1-208	ENST00000608287	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SGMS1-208	ENST00000608287	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SGMS1-208	ENST00000608287	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SGMS1-208	ENST00000608287	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32	■■■□□ 2.71
SGMS1-208	ENST00000608287	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SGMS1-208	ENST00000608287	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SGMS1-208	ENST00000608287	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SGMS1-208	ENST00000608287	EEA1	Q15075	1411 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SGMS1-208	ENST00000608287	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.96	■■■□□ 2.71
SGMS1-208	ENST00000608287	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.93	■■■□□ 2.7

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