RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602800.1

PPFIA3-210, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene PPFIA3, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3-210ENST00000602800 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.79■■■■□ 3
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PPFIA3-210ENST00000602800 IGF1RP08069 1367 aa33.72■■■□□ 2.99
PPFIA3-210ENST00000602800 KIF27Q86VH2 1401 aa33.7■■■□□ 2.99
PPFIA3-210ENST00000602800 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.69■■■□□ 2.98
PPFIA3-210ENST00000602800 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.69■■■□□ 2.98
PPFIA3-210ENST00000602800 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.67■■■□□ 2.98
PPFIA3-210ENST00000602800 MAPKBP1O60336 1514 aa33.62■■■□□ 2.97
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PPFIA3-210ENST00000602800 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.57■■■□□ 2.96
PPFIA3-210ENST00000602800 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.51■■■□□ 2.96
PPFIA3-210ENST00000602800 DIP2BQ9P265 1576 aa33.5■■■□□ 2.95
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PPFIA3-210ENST00000602800 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
PPFIA3-210ENST00000602800 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.42■■■□□ 2.94
PPFIA3-210ENST00000602800 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.38■■■□□ 2.93
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PPFIA3-210ENST00000602800 ABCC2Q92887 1545 aa33.29■■■□□ 2.92
PPFIA3-210ENST00000602800 IQGAP2Q13576 1575 aa33.27■■■□□ 2.92
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PPFIA3-210ENST00000602800 TSPOAP1O95153 1857 aa33.22■■■□□ 2.91
PPFIA3-210ENST00000602800 ASXL2Q76L83 1435 aa33.21■■■□□ 2.91
PPFIA3-210ENST00000602800 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.19■■■□□ 2.9
PPFIA3-210ENST00000602800 UACAQ9BZF9 1416 aa33.19■■■□□ 2.9
PPFIA3-210ENST00000602800 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.17■■■□□ 2.9
PPFIA3-210ENST00000602800 DISP1Q96F81 1524 aa33.15■■■□□ 2.9
PPFIA3-210ENST00000602800 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.14■■■□□ 2.9
PPFIA3-210ENST00000602800 GLI2P10070 1586 aa33.1■■■□□ 2.89
PPFIA3-210ENST00000602800 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.07■■■□□ 2.88
PPFIA3-210ENST00000602800 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.03■■■□□ 2.88
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PPFIA3-210ENST00000602800 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
PPFIA3-210ENST00000602800 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.91■■■□□ 2.86
PPFIA3-210ENST00000602800 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
PPFIA3-210ENST00000602800 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
PPFIA3-210ENST00000602800 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.86■■■□□ 2.85
PPFIA3-210ENST00000602800 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.84■■■□□ 2.85
PPFIA3-210ENST00000602800 GOLGA3Q08378 1498 aa32.83■■■□□ 2.85
PPFIA3-210ENST00000602800 ADGRL1O94910 1474 aa32.81■■■□□ 2.84
PPFIA3-210ENST00000602800 KCNH8Q96L42 1107 aa32.74■■■□□ 2.83
PPFIA3-210ENST00000602800 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.73■■■□□ 2.83
PPFIA3-210ENST00000602800 CD109Q6YHK3 1445 aa32.7■■■□□ 2.83
PPFIA3-210ENST00000602800 PRXQ9BXM0 1461 aa32.7■■■□□ 2.83
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PPFIA3-210ENST00000602800 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.65■■■□□ 2.82
PPFIA3-210ENST00000602800 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.57■■■□□ 2.8
PPFIA3-210ENST00000602800 P3H3Q8IVL6 736 aa32.56■■■□□ 2.8
PPFIA3-210ENST00000602800 ARID3CA6NKF2 412 aa32.55■■■□□ 2.8
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PPFIA3-210ENST00000602800 ATP10BO94823 1461 aa32.47■■■□□ 2.79
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PPFIA3-210ENST00000602800 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.41■■■□□ 2.78
PPFIA3-210ENST00000602800 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.4■■■□□ 2.78
PPFIA3-210ENST00000602800 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.37■■■□□ 2.77
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PPFIA3-210ENST00000602800 SAMD9Q5K651 1589 aa32.31■■■□□ 2.76
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PPFIA3-210ENST00000602800 NEO1Q92859 1461 aa32.23■■■□□ 2.75
PPFIA3-210ENST00000602800 EEA1Q15075 1411 aa32.23■■■□□ 2.75
PPFIA3-210ENST00000602800 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
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PPFIA3-210ENST00000602800 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.16■■■□□ 2.74
PPFIA3-210ENST00000602800 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
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PPFIA3-210ENST00000602800 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.02■■■□□ 2.72
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PPFIA3-210ENST00000602800 FANCAO15360 1455 aa31.98■■■□□ 2.71
PPFIA3-210ENST00000602800 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.95■■■□□ 2.71
PPFIA3-210ENST00000602800 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.93■■■□□ 2.7
PPFIA3-210ENST00000602800 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.92■■■□□ 2.7
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PPFIA3-210ENST00000602800 MADDQ8WXG6 1647 aa31.9■■■□□ 2.7
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PPFIA3-210ENST00000602800 PLCH2O75038 1416 aa31.8■■■□□ 2.68
PPFIA3-210ENST00000602800 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.79■■■□□ 2.68
PPFIA3-210ENST00000602800 FMN1Q68DA7 1419 aa31.78■■■□□ 2.68
PPFIA3-210ENST00000602800 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.78■■■□□ 2.68
PPFIA3-210ENST00000602800 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.78■■■□□ 2.68
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