RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599766.5

FCHO1-229, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 747 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-229ENST00000599766 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.27■■■□□ 2.44
FCHO1-229ENST00000599766 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.18■■■□□ 2.42
FCHO1-229ENST00000599766 MAPKBP1O60336 1514 aa30.17■■■□□ 2.42
FCHO1-229ENST00000599766 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
FCHO1-229ENST00000599766 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.13■■■□□ 2.41
FCHO1-229ENST00000599766 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.11■■■□□ 2.41
FCHO1-229ENST00000599766 DIP2BQ9P265 1576 aa30.11■■■□□ 2.41
FCHO1-229ENST00000599766 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.06■■■□□ 2.4
FCHO1-229ENST00000599766 CUL7Q14999 1698 aa30.01■■■□□ 2.39
FCHO1-229ENST00000599766 IGF1RP08069 1367 aa29.99■■■□□ 2.39
FCHO1-229ENST00000599766 KIF27Q86VH2 1401 aa29.96■■■□□ 2.39
FCHO1-229ENST00000599766 KDM6BO15054 1643 aa29.95■■■□□ 2.38
FCHO1-229ENST00000599766 TSPOAP1O95153 1857 aa29.91■■■□□ 2.38
FCHO1-229ENST00000599766 PTPRGP23470 1445 aa29.84■■■□□ 2.37
FCHO1-229ENST00000599766 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.8■■■□□ 2.36
FCHO1-229ENST00000599766 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.78■■■□□ 2.36
FCHO1-229ENST00000599766 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.77■■■□□ 2.36
FCHO1-229ENST00000599766 ABCC2Q92887 1545 aa29.76■■■□□ 2.36
FCHO1-229ENST00000599766 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.76■■■□□ 2.35
FCHO1-229ENST00000599766 IQGAP2Q13576 1575 aa29.72■■■□□ 2.35
FCHO1-229ENST00000599766 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
FCHO1-229ENST00000599766 ASXL2Q76L83 1435 aa29.7■■■□□ 2.34
FCHO1-229ENST00000599766 GLI2P10070 1586 aa29.69■■■□□ 2.34
FCHO1-229ENST00000599766 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.69■■■□□ 2.34
FCHO1-229ENST00000599766 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
FCHO1-229ENST00000599766 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.68■■■□□ 2.34
FCHO1-229ENST00000599766 UACAQ9BZF9 1416 aa29.61■■■□□ 2.33
FCHO1-229ENST00000599766 DISP1Q96F81 1524 aa29.61■■■□□ 2.33
FCHO1-229ENST00000599766 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.54■■■□□ 2.32
FCHO1-229ENST00000599766 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.52■■■□□ 2.32
FCHO1-229ENST00000599766 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
FCHO1-229ENST00000599766 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.51■■■□□ 2.32
FCHO1-229ENST00000599766 ADGRL1O94910 1474 aa29.49■■■□□ 2.31
FCHO1-229ENST00000599766 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
FCHO1-229ENST00000599766 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
FCHO1-229ENST00000599766 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.47■■■□□ 2.31
FCHO1-229ENST00000599766 KIAA0556O60303 1618 aa29.45■■■□□ 2.31
FCHO1-229ENST00000599766 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.45■■■□□ 2.31
FCHO1-229ENST00000599766 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.34■■■□□ 2.29
FCHO1-229ENST00000599766 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
FCHO1-229ENST00000599766 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.3■■■□□ 2.28
FCHO1-229ENST00000599766 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.24■■■□□ 2.27
FCHO1-229ENST00000599766 GOLGA3Q08378 1498 aa29.23■■■□□ 2.27
FCHO1-229ENST00000599766 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.23■■■□□ 2.27
FCHO1-229ENST00000599766 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.22■■■□□ 2.27
FCHO1-229ENST00000599766 ABCA8O94911 1581 aa29.22■■■□□ 2.27
FCHO1-229ENST00000599766 CD109Q6YHK3 1445 aa29.2■■■□□ 2.26
FCHO1-229ENST00000599766 KCNH8Q96L42 1107 aa29.13■■■□□ 2.25
FCHO1-229ENST00000599766 PRXQ9BXM0 1461 aa29.06■■■□□ 2.24
FCHO1-229ENST00000599766 KIF21BO75037 1637 aa29.03■■■□□ 2.24
FCHO1-229ENST00000599766 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.01■■■□□ 2.23
FCHO1-229ENST00000599766 ATP10BO94823 1461 aa28.94■■■□□ 2.22
FCHO1-229ENST00000599766 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
FCHO1-229ENST00000599766 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.92■■■□□ 2.22
FCHO1-229ENST00000599766 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.89■■■□□ 2.22
FCHO1-229ENST00000599766 ARID3CA6NKF2 412 aa28.89■■■□□ 2.22
FCHO1-229ENST00000599766 P3H3Q8IVL6 736 aa28.86■■■□□ 2.21
FCHO1-229ENST00000599766 SAMD9Q5K651 1589 aa28.85■■■□□ 2.21
FCHO1-229ENST00000599766 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.83■■■□□ 2.21
FCHO1-229ENST00000599766 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.81■■■□□ 2.2
FCHO1-229ENST00000599766 NEO1Q92859 1461 aa28.81■■■□□ 2.2
FCHO1-229ENST00000599766 PTPRMP28827 1452 aa28.79■■■□□ 2.2
FCHO1-229ENST00000599766 RAPGEF3O95398 923 aa28.77■■■□□ 2.2
FCHO1-229ENST00000599766 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.74■■■□□ 2.19
FCHO1-229ENST00000599766 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.73■■■□□ 2.19
FCHO1-229ENST00000599766 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.7■■■□□ 2.18
FCHO1-229ENST00000599766 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
FCHO1-229ENST00000599766 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
FCHO1-229ENST00000599766 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
FCHO1-229ENST00000599766 FBXO41Q8TF61 875 aa28.69■■■□□ 2.18
FCHO1-229ENST00000599766 MADDQ8WXG6 1647 aa28.68■■■□□ 2.18
FCHO1-229ENST00000599766 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
FCHO1-229ENST00000599766 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.63■■■□□ 2.17
FCHO1-229ENST00000599766 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
FCHO1-229ENST00000599766 RICTORQ6R327 1708 aa28.61■■■□□ 2.17
FCHO1-229ENST00000599766 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.59■■■□□ 2.17
FCHO1-229ENST00000599766 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
FCHO1-229ENST00000599766 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.58■■■□□ 2.17
FCHO1-229ENST00000599766 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.57■■■□□ 2.16
FCHO1-229ENST00000599766 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.56■■■□□ 2.16
FCHO1-229ENST00000599766 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
FCHO1-229ENST00000599766 AKNAQ7Z591 1439 aa28.55■■■□□ 2.16
FCHO1-229ENST00000599766 FANCAO15360 1455 aa28.53■■■□□ 2.16
FCHO1-229ENST00000599766 EEA1Q15075 1411 aa28.53■■■□□ 2.16
FCHO1-229ENST00000599766 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
FCHO1-229ENST00000599766 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
FCHO1-229ENST00000599766 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.5■■■□□ 2.15
FCHO1-229ENST00000599766 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.49■■■□□ 2.15
FCHO1-229ENST00000599766 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.47■■■□□ 2.15
FCHO1-229ENST00000599766 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.46■■■□□ 2.15
FCHO1-229ENST00000599766 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.44■■■□□ 2.14
FCHO1-229ENST00000599766 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.43■■■□□ 2.14
FCHO1-229ENST00000599766 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.42■■■□□ 2.14
FCHO1-229ENST00000599766 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.41■■■□□ 2.14
FCHO1-229ENST00000599766 HECW1Q76N89 1606 aa28.37■■■□□ 2.13
FCHO1-229ENST00000599766 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
FCHO1-229ENST00000599766 HSPA2P54652 639 aa28.36■■■□□ 2.13
FCHO1-229ENST00000599766 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.35■■■□□ 2.13
FCHO1-229ENST00000599766 PLCH2O75038 1416 aa28.33■■■□□ 2.13
FCHO1-229ENST00000599766 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.8 ms