RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596224.5

CPAMD8-208, Transcript of C3 and PZP like, alpha-2-macroglobulin domain containing 8, human

TSL 2

Gene CPAMD8, Length 2,117 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPAMD8-208	ENST00000596224	IFT140	Q96RY7	1462 aa		34.07	■■■■□ 3.05
CPAMD8-208	ENST00000596224	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	34.07	■■■■□ 3.04
CPAMD8-208	ENST00000596224	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.97	■■■■□ 3.03
CPAMD8-208	ENST00000596224	GRIN2B	Q13224	1484 aa		33.96	■■■■□ 3.03
CPAMD8-208	ENST00000596224	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.96	■■■■□ 3.03
CPAMD8-208	ENST00000596224	ADAMTS12	P58397	1594 aa		33.95	■■■■□ 3.02
CPAMD8-208	ENST00000596224	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		33.92	■■■■□ 3.02
CPAMD8-208	ENST00000596224	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.91	■■■■□ 3.02
CPAMD8-208	ENST00000596224	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
CPAMD8-208	ENST00000596224	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
CPAMD8-208	ENST00000596224	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
CPAMD8-208	ENST00000596224	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
CPAMD8-208	ENST00000596224	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		33.79	■■■■□ 3
CPAMD8-208	ENST00000596224	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
CPAMD8-208	ENST00000596224	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.78	■■■■□ 3
CPAMD8-208	ENST00000596224	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.76	■■■□□ 2.99
CPAMD8-208	ENST00000596224	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
CPAMD8-208	ENST00000596224	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
CPAMD8-208	ENST00000596224	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CPAMD8-208	ENST00000596224	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.66	■■■□□ 2.98
CPAMD8-208	ENST00000596224	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.66	■■■□□ 2.98
CPAMD8-208	ENST00000596224	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.66	■■■□□ 2.98
CPAMD8-208	ENST00000596224	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CPAMD8-208	ENST00000596224	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.64	■■■□□ 2.98
CPAMD8-208	ENST00000596224	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CPAMD8-208	ENST00000596224	GRIN2A	Q12879	1464 aa		33.6	■■■□□ 2.97
CPAMD8-208	ENST00000596224	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
CPAMD8-208	ENST00000596224	FBLN2	P98095	1184 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CPAMD8-208	ENST00000596224	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
CPAMD8-208	ENST00000596224	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
CPAMD8-208	ENST00000596224	SYNJ2	O15056	1496 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CPAMD8-208	ENST00000596224	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CPAMD8-208	ENST00000596224	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CPAMD8-208	ENST00000596224	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CPAMD8-208	ENST00000596224	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CPAMD8-208	ENST00000596224	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CPAMD8-208	ENST00000596224	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CPAMD8-208	ENST00000596224	ITGAE	P38570	1179 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CPAMD8-208	ENST00000596224	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CPAMD8-208	ENST00000596224	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CPAMD8-208	ENST00000596224	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CPAMD8-208	ENST00000596224	HECW1	Q76N89	1606 aa		33.28	■■■□□ 2.92
CPAMD8-208	ENST00000596224	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.26	■■■□□ 2.92
CPAMD8-208	ENST00000596224	NUP160	Q12769	1436 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CPAMD8-208	ENST00000596224	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
CPAMD8-208	ENST00000596224	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CPAMD8-208	ENST00000596224	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
CPAMD8-208	ENST00000596224	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
CPAMD8-208	ENST00000596224	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CPAMD8-208	ENST00000596224	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CPAMD8-208	ENST00000596224	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
CPAMD8-208	ENST00000596224	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CPAMD8-208	ENST00000596224	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CPAMD8-208	ENST00000596224	CHD1	O14646	1710 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CPAMD8-208	ENST00000596224	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CPAMD8-208	ENST00000596224	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.07	■■■□□ 2.89
CPAMD8-208	ENST00000596224	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CPAMD8-208	ENST00000596224	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
CPAMD8-208	ENST00000596224	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
CPAMD8-208	ENST00000596224	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33	■■■□□ 2.87
CPAMD8-208	ENST00000596224	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33	■■■□□ 2.87
CPAMD8-208	ENST00000596224	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CPAMD8-208	ENST00000596224	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CPAMD8-208	ENST00000596224	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.93	■■■□□ 2.86
CPAMD8-208	ENST00000596224	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
CPAMD8-208	ENST00000596224	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CPAMD8-208	ENST00000596224	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CPAMD8-208	ENST00000596224	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CPAMD8-208	ENST00000596224	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
CPAMD8-208	ENST00000596224	ABCA8	O94911	1581 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CPAMD8-208	ENST00000596224	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CPAMD8-208	ENST00000596224	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CPAMD8-208	ENST00000596224	PTPRG	P23470	1445 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CPAMD8-208	ENST00000596224	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
CPAMD8-208	ENST00000596224	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
CPAMD8-208	ENST00000596224	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CPAMD8-208	ENST00000596224	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CPAMD8-208	ENST00000596224	KIF14	Q15058	1648 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CPAMD8-208	ENST00000596224	ATP10B	O94823	1461 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CPAMD8-208	ENST00000596224	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CPAMD8-208	ENST00000596224	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CPAMD8-208	ENST00000596224	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CPAMD8-208	ENST00000596224	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CPAMD8-208	ENST00000596224	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CPAMD8-208	ENST00000596224	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.81
CPAMD8-208	ENST00000596224	NAIP	Q13075	1403 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CPAMD8-208	ENST00000596224	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CPAMD8-208	ENST00000596224	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CPAMD8-208	ENST00000596224	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.52	■■■□□ 2.8
CPAMD8-208	ENST00000596224	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.52	■■■□□ 2.8
CPAMD8-208	ENST00000596224	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
CPAMD8-208	ENST00000596224	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
CPAMD8-208	ENST00000596224	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
CPAMD8-208	ENST00000596224	DAPK1	P53355	1430 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CPAMD8-208	ENST00000596224	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
CPAMD8-208	ENST00000596224	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CPAMD8-208	ENST00000596224	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CPAMD8-208	ENST00000596224	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
CPAMD8-208	ENST00000596224	ABCC5	O15440	1437 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CPAMD8-208	ENST00000596224	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.41	■■■□□ 2.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms