RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591767.5

POLR2E-209, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 1,214 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-209ENST00000591767 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.58■■■□□ 2.49
POLR2E-209ENST00000591767 TSPOAP1O95153 1857 aa30.58■■■□□ 2.49
POLR2E-209ENST00000591767 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.57■■■□□ 2.48
POLR2E-209ENST00000591767 MAPKBP1O60336 1514 aa30.57■■■□□ 2.48
POLR2E-209ENST00000591767 JPH4Q96JJ6 628 aa30.53■■■□□ 2.48
POLR2E-209ENST00000591767 KDM6BO15054 1643 aa30.52■■■□□ 2.48
POLR2E-209ENST00000591767 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.52■■■□□ 2.48
POLR2E-209ENST00000591767 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
POLR2E-209ENST00000591767 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.46
POLR2E-209ENST00000591767 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.32■■■□□ 2.44
POLR2E-209ENST00000591767 CUL7Q14999 1698 aa30.28■■■□□ 2.44
POLR2E-209ENST00000591767 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.27■■■□□ 2.44
POLR2E-209ENST00000591767 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
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POLR2E-209ENST00000591767 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.98■■■□□ 2.39
POLR2E-209ENST00000591767 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.97■■■□□ 2.39
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POLR2E-209ENST00000591767 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
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POLR2E-209ENST00000591767 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.81■■■□□ 2.36
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POLR2E-209ENST00000591767 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.66■■■□□ 2.34
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POLR2E-209ENST00000591767 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.66■■■□□ 2.34
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POLR2E-209ENST00000591767 CD109Q6YHK3 1445 aa29.49■■■□□ 2.31
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POLR2E-209ENST00000591767 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.33■■■□□ 2.29
POLR2E-209ENST00000591767 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.31■■■□□ 2.28
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POLR2E-209ENST00000591767 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.23■■■□□ 2.27
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POLR2E-209ENST00000591767 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.17■■■□□ 2.26
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POLR2E-209ENST00000591767 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.08■■■□□ 2.25
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POLR2E-209ENST00000591767 RAPGEF3O95398 923 aa29.07■■■□□ 2.24
POLR2E-209ENST00000591767 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.07■■■□□ 2.24
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POLR2E-209ENST00000591767 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.04■■■□□ 2.24
POLR2E-209ENST00000591767 RICTORQ6R327 1708 aa29.04■■■□□ 2.24
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POLR2E-209ENST00000591767 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.75■■■□□ 2.19
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POLR2E-209ENST00000591767 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.71■■■□□ 2.19
POLR2E-209ENST00000591767 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
POLR2E-209ENST00000591767 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.68■■■□□ 2.18
POLR2E-209ENST00000591767 CERKQ8TCT0 537 aa28.66■■■□□ 2.18
POLR2E-209ENST00000591767 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.66■■■□□ 2.18
POLR2E-209ENST00000591767 MLECQ14165 292 aa28.65■■■□□ 2.18
POLR2E-209ENST00000591767 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.65■■■□□ 2.18
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