RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CAPNS1-204ENST00000587718 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.47■■■■■ 4.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CUL7Q14999 1698 aa41.42■■■■■ 4.22
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.35■■■■■ 4.21
CAPNS1-204ENST00000587718 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.33■■■■■ 4.21
CAPNS1-204ENST00000587718 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.96■■■■■ 4.15
CAPNS1-204ENST00000587718 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.95■■■■■ 4.15
CAPNS1-204ENST00000587718 IQGAP2Q13576 1575 aa40.93■■■■■ 4.14
CAPNS1-204ENST00000587718 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.9■■■■■ 4.14
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRGP23470 1445 aa40.89■■■■■ 4.14
CAPNS1-204ENST00000587718 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.88■■■■■ 4.13
CAPNS1-204ENST00000587718 MAPKBP1O60336 1514 aa40.86■■■■■ 4.13
CAPNS1-204ENST00000587718 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.85■■■■■ 4.13
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.84■■■■■ 4.13
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.81■■■■■ 4.12
CAPNS1-204ENST00000587718 DISP1Q96F81 1524 aa40.79■■■■■ 4.12
CAPNS1-204ENST00000587718 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.74■■■■■ 4.11
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.74■■■■■ 4.11
CAPNS1-204ENST00000587718 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
CAPNS1-204ENST00000587718 PRXQ9BXM0 1461 aa40.68■■■■■ 4.1
CAPNS1-204ENST00000587718 DIP2BQ9P265 1576 aa40.66■■■■■ 4.1
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCC2Q92887 1545 aa40.64■■■■■ 4.1
CAPNS1-204ENST00000587718 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.62■■■■■ 4.09
CAPNS1-204ENST00000587718 UACAQ9BZF9 1416 aa40.6■■■■■ 4.09
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA0556O60303 1618 aa40.57■■■■■ 4.08
CAPNS1-204ENST00000587718 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.51■■■■■ 4.08
CAPNS1-204ENST00000587718 ASXL2Q76L83 1435 aa40.46■■■■■ 4.07
CAPNS1-204ENST00000587718 EEA1Q15075 1411 aa40.45■■■■■ 4.07
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.44■■■■■ 4.06
CAPNS1-204ENST00000587718 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.43■■■■■ 4.06
CAPNS1-204ENST00000587718 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.43■■■■■ 4.06
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA3Q08378 1498 aa40.4■■■■■ 4.06
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CAPNS1-204ENST00000587718 GLI2P10070 1586 aa40.32■■■■■ 4.04
CAPNS1-204ENST00000587718 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPOAP1O95153 1857 aa40.26■■■■■ 4.04
CAPNS1-204ENST00000587718 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCA8O94911 1581 aa40.22■■■■■ 4.03
CAPNS1-204ENST00000587718 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM6BO15054 1643 aa40.19■■■■■ 4.02
CAPNS1-204ENST00000587718 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
CAPNS1-204ENST00000587718 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.14■■■■■ 4.02
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.1■■■■■ 4.01
CAPNS1-204ENST00000587718 P3H3Q8IVL6 736 aa40.1■■■■■ 4.01
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.07■■■■■ 4.01
CAPNS1-204ENST00000587718 SAMD9Q5K651 1589 aa40.05■■■■■ 4
CAPNS1-204ENST00000587718 HRCP23327 699 aa40.01■■■■□ 3.99
CAPNS1-204ENST00000587718 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.93■■■■□ 3.98
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP10BO94823 1461 aa39.92■■■■□ 3.98
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNH8Q96L42 1107 aa39.9■■■■□ 3.98
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF21BO75037 1637 aa39.9■■■■□ 3.98
CAPNS1-204ENST00000587718 ARID3CA6NKF2 412 aa39.84■■■■□ 3.97
CAPNS1-204ENST00000587718 CD109Q6YHK3 1445 aa39.84■■■■□ 3.97
CAPNS1-204ENST00000587718 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.82■■■■□ 3.96
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.79■■■■□ 3.96
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.79■■■■□ 3.96
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CAPNS1-204ENST00000587718 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.79■■■■□ 3.96
CAPNS1-204ENST00000587718 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
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CAPNS1-204ENST00000587718 CEP162Q5TB80 1403 aa39.63■■■■□ 3.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.59■■■■□ 3.93
CAPNS1-204ENST00000587718 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.58■■■■□ 3.93
CAPNS1-204ENST00000587718 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.51■■■■□ 3.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRL1O94910 1474 aa39.46■■■■□ 3.91
CAPNS1-204ENST00000587718 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.45■■■■□ 3.91
CAPNS1-204ENST00000587718 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.44■■■■□ 3.9
CAPNS1-204ENST00000587718 NEO1Q92859 1461 aa39.38■■■■□ 3.9
CAPNS1-204ENST00000587718 FMN1Q68DA7 1419 aa39.35■■■■□ 3.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.88
CAPNS1-204ENST00000587718 RAPGEF3O95398 923 aa39.28■■■■□ 3.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 HECW1Q76N89 1606 aa39.2■■■■□ 3.87
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
CAPNS1-204ENST00000587718 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.18■■■■□ 3.86
CAPNS1-204ENST00000587718 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.16■■■■□ 3.86
CAPNS1-204ENST00000587718 FANCAO15360 1455 aa39.15■■■■□ 3.86
CAPNS1-204ENST00000587718 AKNAQ7Z591 1439 aa39.15■■■■□ 3.86
CAPNS1-204ENST00000587718 CLIP1P30622 1438 aa39.11■■■■□ 3.85
CAPNS1-204ENST00000587718 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
CAPNS1-204ENST00000587718 PLCH2O75038 1416 aa39.07■■■■□ 3.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.05■■■■□ 3.84
CAPNS1-204ENST00000587718 RICTORQ6R327 1708 aa39.01■■■■□ 3.83
CAPNS1-204ENST00000587718 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.99■■■■□ 3.83
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.99■■■■□ 3.83
CAPNS1-204ENST00000587718 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.98■■■■□ 3.83
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF14Q15058 1648 aa38.94■■■■□ 3.82
CAPNS1-204ENST00000587718 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
CAPNS1-204ENST00000587718 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.9■■■■□ 3.82
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