RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583763.1

CSAG4-202, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene CSAG4, Length 237 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-202ENST00000583763 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.58■□□□□ 0.56
CSAG4-202ENST00000583763 TSPOAP1O95153 1857 aa18.56■□□□□ 0.56
CSAG4-202ENST00000583763 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CSAG4-202ENST00000583763 ADAMTS12P58397 1594 aa18.55■□□□□ 0.56
CSAG4-202ENST00000583763 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.52■□□□□ 0.55
CSAG4-202ENST00000583763 JPH4Q96JJ6 628 aa18.49■□□□□ 0.55
CSAG4-202ENST00000583763 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
CSAG4-202ENST00000583763 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.54
CSAG4-202ENST00000583763 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.44■□□□□ 0.54
CSAG4-202ENST00000583763 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CSAG4-202ENST00000583763 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.39■□□□□ 0.54
CSAG4-202ENST00000583763 ILDR2Q71H61 639 aa18.35■□□□□ 0.53
CSAG4-202ENST00000583763 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.32■□□□□ 0.52
CSAG4-202ENST00000583763 SOCS7O14512 581 aa18.3■□□□□ 0.52
CSAG4-202ENST00000583763 GLI2P10070 1586 aa18.3■□□□□ 0.52
CSAG4-202ENST00000583763 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.28■□□□□ 0.52
CSAG4-202ENST00000583763 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
CSAG4-202ENST00000583763 ASXL2Q76L83 1435 aa18.22■□□□□ 0.51
CSAG4-202ENST00000583763 TOP2BQ02880 1626 aa18.2■□□□□ 0.5
CSAG4-202ENST00000583763 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.17■□□□□ 0.5
CSAG4-202ENST00000583763 ABCC2Q92887 1545 aa18.17■□□□□ 0.5
CSAG4-202ENST00000583763 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa18.16■□□□□ 0.5
CSAG4-202ENST00000583763 PTPRGP23470 1445 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG4-202ENST00000583763 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CSAG4-202ENST00000583763 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.12■□□□□ 0.49
CSAG4-202ENST00000583763 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.11■□□□□ 0.49
CSAG4-202ENST00000583763 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.08■□□□□ 0.49
CSAG4-202ENST00000583763 CUL7Q14999 1698 aa18.08■□□□□ 0.48
CSAG4-202ENST00000583763 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.07■□□□□ 0.48
CSAG4-202ENST00000583763 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.04■□□□□ 0.48
CSAG4-202ENST00000583763 PTPRMP28827 1452 aa18.03■□□□□ 0.48
CSAG4-202ENST00000583763 KIF21BO75037 1637 aa18.02■□□□□ 0.48
CSAG4-202ENST00000583763 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
CSAG4-202ENST00000583763 TNIKQ9UKE5 1360 aa18■□□□□ 0.47
CSAG4-202ENST00000583763 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG4-202ENST00000583763 CERKQ8TCT0 537 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG4-202ENST00000583763 ADAMTSL3P82987 1691 aa17.99■□□□□ 0.47
CSAG4-202ENST00000583763 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CSAG4-202ENST00000583763 UACAQ9BZF9 1416 aa17.97■□□□□ 0.47
CSAG4-202ENST00000583763 IGF1RP08069 1367 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG4-202ENST00000583763 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.91■□□□□ 0.46
CSAG4-202ENST00000583763 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CSAG4-202ENST00000583763 HSPA2P54652 639 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG4-202ENST00000583763 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.87■□□□□ 0.45
CSAG4-202ENST00000583763 DISP1Q96F81 1524 aa17.86■□□□□ 0.45
CSAG4-202ENST00000583763 CD109Q6YHK3 1445 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG4-202ENST00000583763 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa17.85■□□□□ 0.45
CSAG4-202ENST00000583763 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.84■□□□□ 0.45
CSAG4-202ENST00000583763 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.82■□□□□ 0.44
CSAG4-202ENST00000583763 MADDQ8WXG6 1647 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG4-202ENST00000583763 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.81■□□□□ 0.44
CSAG4-202ENST00000583763 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.8■□□□□ 0.44
CSAG4-202ENST00000583763 IQGAP2Q13576 1575 aa17.75■□□□□ 0.43
CSAG4-202ENST00000583763 KCNH8Q96L42 1107 aa17.73■□□□□ 0.43
CSAG4-202ENST00000583763 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG4-202ENST00000583763 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
CSAG4-202ENST00000583763 RAPGEF3O95398 923 aa17.69■□□□□ 0.42
CSAG4-202ENST00000583763 KIF27Q86VH2 1401 aa17.66■□□□□ 0.42
CSAG4-202ENST00000583763 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.66■□□□□ 0.42
CSAG4-202ENST00000583763 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG4-202ENST00000583763 KIAA0556O60303 1618 aa17.64■□□□□ 0.41
CSAG4-202ENST00000583763 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CSAG4-202ENST00000583763 STRCQ7RTU9 1775 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG4-202ENST00000583763 ABCA8O94911 1581 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG4-202ENST00000583763 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.59■□□□□ 0.41
CSAG4-202ENST00000583763 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa17.58■□□□□ 0.4
CSAG4-202ENST00000583763 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.57■□□□□ 0.4
CSAG4-202ENST00000583763 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.55■□□□□ 0.4
CSAG4-202ENST00000583763 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17.53■□□□□ 0.4
CSAG4-202ENST00000583763 NEO1Q92859 1461 aa17.51■□□□□ 0.39
CSAG4-202ENST00000583763 LTBP4Q8N2S1 1624 aa17.51■□□□□ 0.39
CSAG4-202ENST00000583763 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.51■□□□□ 0.39
CSAG4-202ENST00000583763 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.48■□□□□ 0.39
CSAG4-202ENST00000583763 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.47■□□□□ 0.39
CSAG4-202ENST00000583763 ATP10BO94823 1461 aa17.46■□□□□ 0.39
CSAG4-202ENST00000583763 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.45■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 RICTORQ6R327 1708 aa17.44■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 IQSEC2Q5JU85 1478 aa17.44■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 PTPRTO14522 1441 aa17.42■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 FANCAO15360 1455 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 ARID3CA6NKF2 412 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG4-202ENST00000583763 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG4-202ENST00000583763 MLECQ14165 292 aa17.38■□□□□ 0.37
CSAG4-202ENST00000583763 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CSAG4-202ENST00000583763 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG4-202ENST00000583763 AKNAQ7Z591 1439 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG4-202ENST00000583763 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG4-202ENST00000583763 GOLGA3Q08378 1498 aa17.32■□□□□ 0.36
CSAG4-202ENST00000583763 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.31■□□□□ 0.36
CSAG4-202ENST00000583763 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
CSAG4-202ENST00000583763 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
CSAG4-202ENST00000583763 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.29■□□□□ 0.36
CSAG4-202ENST00000583763 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.28■□□□□ 0.36
CSAG4-202ENST00000583763 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.27■□□□□ 0.36
CSAG4-202ENST00000583763 MAGI2Q86UL8 1455 aa17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms