RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 TOP2BQ02880 1626 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRM-210ENST00000578916 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRM-210ENST00000578916 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRM-210ENST00000578916 MAPKBP1O60336 1514 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRM-210ENST00000578916 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRM-210ENST00000578916 DIP2BQ9P265 1576 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRM-210ENST00000578916 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRM-210ENST00000578916 KDM6BO15054 1643 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRM-210ENST00000578916 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.27■□□□□ 0.2
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PTPRM-210ENST00000578916 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRM-210ENST00000578916 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
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PTPRM-210ENST00000578916 KIF27Q86VH2 1401 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRM-210ENST00000578916 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRM-210ENST00000578916 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.12■□□□□ 0.17
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PTPRM-210ENST00000578916 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.09■□□□□ 0.17
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PTPRM-210ENST00000578916 CD109Q6YHK3 1445 aa15.85■□□□□ 0.13
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PTPRM-210ENST00000578916 HSPA2P54652 639 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRM-210ENST00000578916 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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PTPRM-210ENST00000578916 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.48■□□□□ 0.07
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PTPRM-210ENST00000578916 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
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PTPRM-210ENST00000578916 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.46■□□□□ 0.07
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PTPRM-210ENST00000578916 RICTORQ6R327 1708 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRM-210ENST00000578916 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.4■□□□□ 0.06
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PTPRM-210ENST00000578916 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRM-210ENST00000578916 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRM-210ENST00000578916 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRM-210ENST00000578916 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
PTPRM-210ENST00000578916 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRM-210ENST00000578916 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRM-210ENST00000578916 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRM-210ENST00000578916 HECW1Q76N89 1606 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRM-210ENST00000578916 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRM-210ENST00000578916 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.32■□□□□ 0.04
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