RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576513.2

SLC12A4-218, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SLC12A4, Length 412 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-218ENST00000576513 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
SLC12A4-218ENST00000576513 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.42■■□□□ 1.18
SLC12A4-218ENST00000576513 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.4■■□□□ 1.18
SLC12A4-218ENST00000576513 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC12A4-218ENST00000576513 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4-218ENST00000576513 KIF27Q86VH2 1401 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4-218ENST00000576513 MAPKBP1O60336 1514 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4-218ENST00000576513 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4-218ENST00000576513 IGF1RP08069 1367 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC12A4-218ENST00000576513 CUL7Q14999 1698 aa22.27■■□□□ 1.16
SLC12A4-218ENST00000576513 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4-218ENST00000576513 DIP2BQ9P265 1576 aa22.24■■□□□ 1.15
SLC12A4-218ENST00000576513 PTPRGP23470 1445 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC12A4-218ENST00000576513 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4-218ENST00000576513 KDM6BO15054 1643 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC12A4-218ENST00000576513 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC12A4-218ENST00000576513 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SLC12A4-218ENST00000576513 TSPOAP1O95153 1857 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC12A4-218ENST00000576513 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC12A4-218ENST00000576513 EEA1Q15075 1411 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-218ENST00000576513 ABCC2Q92887 1545 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-218ENST00000576513 IQGAP2Q13576 1575 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-218ENST00000576513 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4-218ENST00000576513 ASXL2Q76L83 1435 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4-218ENST00000576513 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.01■■□□□ 1.11
SLC12A4-218ENST00000576513 UACAQ9BZF9 1416 aa21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4-218ENST00000576513 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.99■■□□□ 1.11
SLC12A4-218ENST00000576513 GLI2P10070 1586 aa21.97■■□□□ 1.11
SLC12A4-218ENST00000576513 DISP1Q96F81 1524 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4-218ENST00000576513 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC12A4-218ENST00000576513 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SLC12A4-218ENST00000576513 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC12A4-218ENST00000576513 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC12A4-218ENST00000576513 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC12A4-218ENST00000576513 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4-218ENST00000576513 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC12A4-218ENST00000576513 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC12A4-218ENST00000576513 KIAA0556O60303 1618 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC12A4-218ENST00000576513 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC12A4-218ENST00000576513 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4-218ENST00000576513 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC12A4-218ENST00000576513 ADGRL1O94910 1474 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC12A4-218ENST00000576513 GOLGA3Q08378 1498 aa21.77■■□□□ 1.08
SLC12A4-218ENST00000576513 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.77■■□□□ 1.07
SLC12A4-218ENST00000576513 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SLC12A4-218ENST00000576513 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.74■■□□□ 1.07
SLC12A4-218ENST00000576513 KIF21BO75037 1637 aa21.73■■□□□ 1.07
SLC12A4-218ENST00000576513 KCNH8Q96L42 1107 aa21.7■■□□□ 1.06
SLC12A4-218ENST00000576513 CD109Q6YHK3 1445 aa21.69■■□□□ 1.06
SLC12A4-218ENST00000576513 PRXQ9BXM0 1461 aa21.66■■□□□ 1.06
SLC12A4-218ENST00000576513 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.66■■□□□ 1.06
SLC12A4-218ENST00000576513 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4-218ENST00000576513 ABCA8O94911 1581 aa21.65■■□□□ 1.06
SLC12A4-218ENST00000576513 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SLC12A4-218ENST00000576513 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.57■■□□□ 1.04
SLC12A4-218ENST00000576513 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SLC12A4-218ENST00000576513 ARID3CA6NKF2 412 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4-218ENST00000576513 P3H3Q8IVL6 736 aa21.52■■□□□ 1.04
SLC12A4-218ENST00000576513 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4-218ENST00000576513 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.5■■□□□ 1.03
SLC12A4-218ENST00000576513 ATP10BO94823 1461 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4-218ENST00000576513 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.48■■□□□ 1.03
SLC12A4-218ENST00000576513 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4-218ENST00000576513 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SLC12A4-218ENST00000576513 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.43■■□□□ 1.02
SLC12A4-218ENST00000576513 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4-218ENST00000576513 SAMD9Q5K651 1589 aa21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4-218ENST00000576513 NEO1Q92859 1461 aa21.39■■□□□ 1.01
SLC12A4-218ENST00000576513 CEP162Q5TB80 1403 aa21.38■■□□□ 1.01
SLC12A4-218ENST00000576513 RAPGEF3O95398 923 aa21.37■■□□□ 1.01
SLC12A4-218ENST00000576513 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SLC12A4-218ENST00000576513 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.33■■□□□ 1.01
SLC12A4-218ENST00000576513 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SLC12A4-218ENST00000576513 PTPRMP28827 1452 aa21.31■■□□□ 1
SLC12A4-218ENST00000576513 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.29■■□□□ 1
SLC12A4-218ENST00000576513 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SLC12A4-218ENST00000576513 CLIP1P30622 1438 aa21.29■■□□□ 1
SLC12A4-218ENST00000576513 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 FBXO41Q8TF61 875 aa21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 AKNAQ7Z591 1439 aa21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 FANCAO15360 1455 aa21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 MADDQ8WXG6 1647 aa21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 RICTORQ6R327 1708 aa21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.14■□□□□ 0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.1■□□□□ 0.97
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SLC12A4-218ENST00000576513 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.09■□□□□ 0.97
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