RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		30.5	■■■□□ 2.47
RNPS1-222	ENST00000567147	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.49	■■■□□ 2.47
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		30.44	■■■□□ 2.46
RNPS1-222	ENST00000567147	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	30.43	■■■□□ 2.46
RNPS1-222	ENST00000567147	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		30.4	■■■□□ 2.46
RNPS1-222	ENST00000567147	DIP2B	Q9P265	1576 aa		30.38	■■■□□ 2.45
RNPS1-222	ENST00000567147	MAPKBP1	O60336	1514 aa		30.37	■■■□□ 2.45
RNPS1-222	ENST00000567147	TSPOAP1	O95153	1857 aa		30.31	■■■□□ 2.44
RNPS1-222	ENST00000567147	KDM6B	O15054	1643 aa		30.27	■■■□□ 2.44
RNPS1-222	ENST00000567147	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		30.23	■■■□□ 2.43
RNPS1-222	ENST00000567147	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		30.22	■■■□□ 2.43
RNPS1-222	ENST00000567147	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	30.21	■■■□□ 2.43
RNPS1-222	ENST00000567147	IGF1R	P08069	1367 aa		30.18	■■■□□ 2.42
RNPS1-222	ENST00000567147	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.14	■■■□□ 2.42
RNPS1-222	ENST00000567147	CUL7	Q14999	1698 aa		30.14	■■■□□ 2.41
RNPS1-222	ENST00000567147	PTPRG	P23470	1445 aa		30.09	■■■□□ 2.41
RNPS1-222	ENST00000567147	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.98	■■■□□ 2.39
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.97	■■■□□ 2.39
RNPS1-222	ENST00000567147	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.97	■■■□□ 2.39
RNPS1-222	ENST00000567147	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
RNPS1-222	ENST00000567147	ASXL2	Q76L83	1435 aa		29.96	■■■□□ 2.39
RNPS1-222	ENST00000567147	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.95	■■■□□ 2.38
RNPS1-222	ENST00000567147	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.9	■■■□□ 2.38
RNPS1-222	ENST00000567147	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		29.89	■■■□□ 2.38
RNPS1-222	ENST00000567147	GLI2	P10070	1586 aa		29.88	■■■□□ 2.37
RNPS1-222	ENST00000567147	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
RNPS1-222	ENST00000567147	ADGRL1	O94910	1474 aa		29.85	■■■□□ 2.37
RNPS1-222	ENST00000567147	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.83	■■■□□ 2.37
RNPS1-222	ENST00000567147	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		29.82	■■■□□ 2.36
RNPS1-222	ENST00000567147	DISP1	Q96F81	1524 aa		29.81	■■■□□ 2.36
RNPS1-222	ENST00000567147	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
RNPS1-222	ENST00000567147	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.36
RNPS1-222	ENST00000567147	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RNPS1-222	ENST00000567147	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
RNPS1-222	ENST00000567147	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		29.72	■■■□□ 2.35
RNPS1-222	ENST00000567147	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.66	■■■□□ 2.34
RNPS1-222	ENST00000567147	KIAA0556	O60303	1618 aa		29.65	■■■□□ 2.34
RNPS1-222	ENST00000567147	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		29.65	■■■□□ 2.34
RNPS1-222	ENST00000567147	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.65	■■■□□ 2.34
RNPS1-222	ENST00000567147	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		29.62	■■■□□ 2.33
RNPS1-222	ENST00000567147	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		29.55	■■■□□ 2.32
RNPS1-222	ENST00000567147	KCNH8	Q96L42	1107 aa		29.5	■■■□□ 2.31
RNPS1-222	ENST00000567147	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.47	■■■□□ 2.31
RNPS1-222	ENST00000567147	CD109	Q6YHK3	1445 aa		29.45	■■■□□ 2.31
RNPS1-222	ENST00000567147	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.44	■■■□□ 2.3
RNPS1-222	ENST00000567147	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		29.43	■■■□□ 2.3
RNPS1-222	ENST00000567147	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.42	■■■□□ 2.3
RNPS1-222	ENST00000567147	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		29.4	■■■□□ 2.3
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCA8	O94911	1581 aa		29.4	■■■□□ 2.3
RNPS1-222	ENST00000567147	KIF21B	O75037	1637 aa		29.38	■■■□□ 2.29
RNPS1-222	ENST00000567147	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.36	■■■□□ 2.29
RNPS1-222	ENST00000567147	ARID3C	A6NKF2	412 aa		29.35	■■■□□ 2.29
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
RNPS1-222	ENST00000567147	EEA1	Q15075	1411 aa		29.25	■■■□□ 2.27
RNPS1-222	ENST00000567147	P3H3	Q8IVL6	736 aa		29.24	■■■□□ 2.27
RNPS1-222	ENST00000567147	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.22	■■■□□ 2.27
RNPS1-222	ENST00000567147	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		29.2	■■■□□ 2.26
RNPS1-222	ENST00000567147	ATP10B	O94823	1461 aa		29.17	■■■□□ 2.26
RNPS1-222	ENST00000567147	RAPGEF3	O95398	923 aa		29.12	■■■□□ 2.25
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		29.11	■■■□□ 2.25
RNPS1-222	ENST00000567147	PTPRM	P28827	1452 aa		29.1	■■■□□ 2.25
RNPS1-222	ENST00000567147	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		29.09	■■■□□ 2.25
RNPS1-222	ENST00000567147	FBXO41	Q8TF61	875 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RNPS1-222	ENST00000567147	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
RNPS1-222	ENST00000567147	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
RNPS1-222	ENST00000567147	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
RNPS1-222	ENST00000567147	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RNPS1-222	ENST00000567147	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
RNPS1-222	ENST00000567147	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		29	■■■□□ 2.23
RNPS1-222	ENST00000567147	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		29	■■■□□ 2.23
RNPS1-222	ENST00000567147	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RNPS1-222	ENST00000567147	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RNPS1-222	ENST00000567147	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RNPS1-222	ENST00000567147	NEO1	Q92859	1461 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RNPS1-222	ENST00000567147	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RNPS1-222	ENST00000567147	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RNPS1-222	ENST00000567147	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
RNPS1-222	ENST00000567147	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
RNPS1-222	ENST00000567147	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
RNPS1-222	ENST00000567147	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RNPS1-222	ENST00000567147	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RNPS1-222	ENST00000567147	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RNPS1-222	ENST00000567147	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RNPS1-222	ENST00000567147	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RNPS1-222	ENST00000567147	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
RNPS1-222	ENST00000567147	HSPA2	P54652	639 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RNPS1-222	ENST00000567147	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RNPS1-222	ENST00000567147	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RNPS1-222	ENST00000567147	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RNPS1-222	ENST00000567147	FANCA	O15360	1455 aa		28.76	■■■□□ 2.19
RNPS1-222	ENST00000567147	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	28.74	■■■□□ 2.19	2e-7	■■■□□ 19.1
RNPS1-222	ENST00000567147	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RNPS1-222	ENST00000567147	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		28.71	■■■□□ 2.19
RNPS1-222	ENST00000567147	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		28.7	■■■□□ 2.19
RNPS1-222	ENST00000567147	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.7	■■■□□ 2.19
RNPS1-222	ENST00000567147	MLEC	Q14165	292 aa		28.7	■■■□□ 2.18
RNPS1-222	ENST00000567147	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RNPS1-222	ENST00000567147	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RNPS1-222	ENST00000567147	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RNPS1-222	ENST00000567147	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.62	■■■□□ 2.17

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