RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TIAM1Q13009 1591 aa32.13■■■□□ 2.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.04■■■□□ 2.72
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR62O43379 1518 aa32.02■■■□□ 2.72
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PBRM1Q86U86 1689 aa32.02■■■□□ 2.72
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.01■■■□□ 2.72
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.01■■■□□ 2.72
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.01■■■□□ 2.71
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.98■■■□□ 2.71
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFT140Q96RY7 1462 aa31.98■■■□□ 2.71
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.97■■■□□ 2.71
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FMN1Q68DA7 1419 aa31.97■■■□□ 2.71
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 P3H3Q8IVL6 736 aa31.96■■■□□ 2.71
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.95■■■□□ 2.71
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SAMD9Q5K651 1589 aa31.95■■■□□ 2.7
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRIN2BQ13224 1484 aa31.92■■■□□ 2.7
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAMTS12P58397 1594 aa31.9■■■□□ 2.7
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERCC6Q03468 1493 aa31.83■■■□□ 2.69
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.8■■■□□ 2.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.77■■■□□ 2.68
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IQGAP2Q13576 1575 aa31.74■■■□□ 2.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.71■■■□□ 2.67
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.61■■■□□ 2.654e-7■■■□□ 15.3
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.6■■■□□ 2.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.58■■■□□ 2.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.57■■■□□ 2.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITGAEP38570 1179 aa31.56■■■□□ 2.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.55■■■□□ 2.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.54■■■□□ 2.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRIN2AQ12879 1464 aa31.53■■■□□ 2.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HECW1Q76N89 1606 aa31.53■■■□□ 2.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.52■■■□□ 2.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.48■■■□□ 2.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.47■■■□□ 2.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.47■■■□□ 2.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYNJ2O15056 1496 aa31.43■■■□□ 2.62
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NCOA2Q15596 1464 aa31.42■■■□□ 2.62
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIAA0556O60303 1618 aa31.4■■■□□ 2.62
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.38■■■□□ 2.61
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DISP1Q96F81 1524 aa31.35■■■□□ 2.61
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGEF11O15085 1522 aa31.34■■■□□ 2.61
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.29■■■□□ 2.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CEP170Q5SW79 1584 aa31.28■■■□□ 2.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUP160Q12769 1436 aa31.25■■■□□ 2.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.22■■■□□ 2.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAPKBP1O60336 1514 aa31.21■■■□□ 2.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.21■■■□□ 2.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.17■■■□□ 2.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBLN2P98095 1184 aa31.16■■■□□ 2.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HFM1A2PYH4 1435 aa31.15■■■□□ 2.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MIA2Q96PC5 1412 aa31.15■■■□□ 2.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPRKQ15262 1439 aa31.09■■■□□ 2.57
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 JPH4Q96JJ6 628 aa31.07■■■□□ 2.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NAIPQ13075 1403 aa31.02■■■□□ 2.56
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.01■■■□□ 2.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AKNAQ7Z591 1439 aa31■■■□□ 2.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARID3CA6NKF2 412 aa31■■■□□ 2.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UACAQ9BZF9 1416 aa30.99■■■□□ 2.55
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.95■■■□□ 2.54
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.94■■■□□ 2.54
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABCA8O94911 1581 aa30.88■■■□□ 2.53
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.88■■■□□ 2.53
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.84■■■□□ 2.53
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.84■■■□□ 2.53
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEUROD1Q13562 356 aa30.83■■■□□ 2.53
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ROCK1Q13464 1354 aa30.81■■■□□ 2.52
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DAPK1P53355 1430 aa30.8■■■□□ 2.52
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHD1O14646 1710 aa30.8■■■□□ 2.52
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.79■■■□□ 2.52
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.78■■■□□ 2.52
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABCC5O15440 1437 aa30.74■■■□□ 2.51
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MIER1Q8N108 512 aa30.73■■■□□ 2.51
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPRGP23470 1445 aa30.73■■■□□ 2.51
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIF14Q15058 1648 aa30.72■■■□□ 2.51
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP10BO94823 1461 aa30.72■■■□□ 2.51
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