RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.97■■■□□ 2.71
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TSPAN3-204ENST00000558394 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.83■■■□□ 2.69
TSPAN3-204ENST00000558394 MAPKBP1O60336 1514 aa31.8■■■□□ 2.68
TSPAN3-204ENST00000558394 DIP2BQ9P265 1576 aa31.75■■■□□ 2.67
TSPAN3-204ENST00000558394 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.72■■■□□ 2.67
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TSPAN3-204ENST00000558394 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.63■■■□□ 2.65
TSPAN3-204ENST00000558394 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.56■■■□□ 2.64
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TSPAN3-204ENST00000558394 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.41■■■□□ 2.62
TSPAN3-204ENST00000558394 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.38■■■□□ 2.61
TSPAN3-204ENST00000558394 ABCC2Q92887 1545 aa31.37■■■□□ 2.61
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TSPAN3-204ENST00000558394 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPAN3-204ENST00000558394 ASXL2Q76L83 1435 aa31.32■■■□□ 2.61
TSPAN3-204ENST00000558394 GLI2P10070 1586 aa31.28■■■□□ 2.6
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TSPAN3-204ENST00000558394 UACAQ9BZF9 1416 aa31.22■■■□□ 2.59
TSPAN3-204ENST00000558394 ADGRL1O94910 1474 aa31.21■■■□□ 2.59
TSPAN3-204ENST00000558394 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.14■■■□□ 2.57
TSPAN3-204ENST00000558394 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
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TSPAN3-204ENST00000558394 DISP1Q96F81 1524 aa31.09■■■□□ 2.57
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TSPAN3-204ENST00000558394 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
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TSPAN3-204ENST00000558394 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.01■■■□□ 2.55
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TSPAN3-204ENST00000558394 KIAA0556O60303 1618 aa30.96■■■□□ 2.55
TSPAN3-204ENST00000558394 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.93■■■□□ 2.54
TSPAN3-204ENST00000558394 CD109Q6YHK3 1445 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPAN3-204ENST00000558394 KCNH8Q96L42 1107 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPAN3-204ENST00000558394 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.81■■■□□ 2.52
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TSPAN3-204ENST00000558394 KIF21BO75037 1637 aa30.65■■■□□ 2.5
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TSPAN3-204ENST00000558394 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.31■■■□□ 2.44
TSPAN3-204ENST00000558394 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.31■■■□□ 2.44
TSPAN3-204ENST00000558394 MADDQ8WXG6 1647 aa30.27■■■□□ 2.44
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TSPAN3-204ENST00000558394 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.16■■■□□ 2.42
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TSPAN3-204ENST00000558394 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.94■■■□□ 2.38
TSPAN3-204ENST00000558394 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.94■■■□□ 2.38
TSPAN3-204ENST00000558394 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.93■■■□□ 2.38
TSPAN3-204ENST00000558394 EEA1Q15075 1411 aa29.92■■■□□ 2.38
TSPAN3-204ENST00000558394 CERKQ8TCT0 537 aa29.92■■■□□ 2.38
TSPAN3-204ENST00000558394 HECW1Q76N89 1606 aa29.89■■■□□ 2.38
TSPAN3-204ENST00000558394 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.88■■■□□ 2.37
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