RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550703.6

TCTN1-223, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2 BASIC

Gene TCTN1, Length 2,149 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-223	ENST00000550703	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TCTN1-223	ENST00000550703	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TCTN1-223	ENST00000550703	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TCTN1-223	ENST00000550703	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TCTN1-223	ENST00000550703	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TCTN1-223	ENST00000550703	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TCTN1-223	ENST00000550703	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TCTN1-223	ENST00000550703	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TCTN1-223	ENST00000550703	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TCTN1-223	ENST00000550703	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TCTN1-223	ENST00000550703	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
TCTN1-223	ENST00000550703	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
TCTN1-223	ENST00000550703	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TCTN1-223	ENST00000550703	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
TCTN1-223	ENST00000550703	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.64	■■■□□ 2.18
TCTN1-223	ENST00000550703	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.17
TCTN1-223	ENST00000550703	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TCTN1-223	ENST00000550703	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
TCTN1-223	ENST00000550703	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TCTN1-223	ENST00000550703	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCTN1-223	ENST00000550703	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCTN1-223	ENST00000550703	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TCTN1-223	ENST00000550703	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.54	■■■□□ 2.16
TCTN1-223	ENST00000550703	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TCTN1-223	ENST00000550703	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
TCTN1-223	ENST00000550703	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.52	■■■□□ 2.16
TCTN1-223	ENST00000550703	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TCTN1-223	ENST00000550703	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.43	■■■□□ 2.14
TCTN1-223	ENST00000550703	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TCTN1-223	ENST00000550703	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
TCTN1-223	ENST00000550703	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TCTN1-223	ENST00000550703	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TCTN1-223	ENST00000550703	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.35	■■■□□ 2.13
TCTN1-223	ENST00000550703	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.33	■■■□□ 2.13
TCTN1-223	ENST00000550703	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
TCTN1-223	ENST00000550703	FBLN2	P98095	1184 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TCTN1-223	ENST00000550703	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TCTN1-223	ENST00000550703	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TCTN1-223	ENST00000550703	ITGAE	P38570	1179 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TCTN1-223	ENST00000550703	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TCTN1-223	ENST00000550703	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TCTN1-223	ENST00000550703	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TCTN1-223	ENST00000550703	NUP160	Q12769	1436 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TCTN1-223	ENST00000550703	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
TCTN1-223	ENST00000550703	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TCTN1-223	ENST00000550703	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TCTN1-223	ENST00000550703	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
TCTN1-223	ENST00000550703	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TCTN1-223	ENST00000550703	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
TCTN1-223	ENST00000550703	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TCTN1-223	ENST00000550703	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
TCTN1-223	ENST00000550703	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.08	■■■□□ 2.09
TCTN1-223	ENST00000550703	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
TCTN1-223	ENST00000550703	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TCTN1-223	ENST00000550703	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TCTN1-223	ENST00000550703	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.03	■■■□□ 2.08
TCTN1-223	ENST00000550703	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.02	■■■□□ 2.08
TCTN1-223	ENST00000550703	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TCTN1-223	ENST00000550703	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28	■■■□□ 2.07
TCTN1-223	ENST00000550703	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
TCTN1-223	ENST00000550703	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		28	■■■□□ 2.07
TCTN1-223	ENST00000550703	CHD1	O14646	1710 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TCTN1-223	ENST00000550703	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCTN1-223	ENST00000550703	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCTN1-223	ENST00000550703	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCTN1-223	ENST00000550703	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCTN1-223	ENST00000550703	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TCTN1-223	ENST00000550703	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TCTN1-223	ENST00000550703	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TCTN1-223	ENST00000550703	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TCTN1-223	ENST00000550703	ABCA8	O94911	1581 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TCTN1-223	ENST00000550703	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TCTN1-223	ENST00000550703	MAPKBP1	O60336	1514 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TCTN1-223	ENST00000550703	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TCTN1-223	ENST00000550703	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TCTN1-223	ENST00000550703	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TCTN1-223	ENST00000550703	HFM1	A2PYH4	1435 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TCTN1-223	ENST00000550703	PTPRG	P23470	1445 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TCTN1-223	ENST00000550703	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TCTN1-223	ENST00000550703	ATP10B	O94823	1461 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TCTN1-223	ENST00000550703	NAIP	Q13075	1403 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TCTN1-223	ENST00000550703	KIF14	Q15058	1648 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TCTN1-223	ENST00000550703	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TCTN1-223	ENST00000550703	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TCTN1-223	ENST00000550703	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TCTN1-223	ENST00000550703	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TCTN1-223	ENST00000550703	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCTN1-223	ENST00000550703	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCTN1-223	ENST00000550703	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TCTN1-223	ENST00000550703	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.57	■■■□□ 2
TCTN1-223	ENST00000550703	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
TCTN1-223	ENST00000550703	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.55	■■■□□ 2
TCTN1-223	ENST00000550703	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.55	■■■□□ 2
TCTN1-223	ENST00000550703	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		27.55	■■■□□ 2
TCTN1-223	ENST00000550703	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
TCTN1-223	ENST00000550703	DAPK1	P53355	1430 aa		27.53	■■■□□ 2
TCTN1-223	ENST00000550703	UACA	Q9BZF9	1416 aa		27.53	■■■□□ 2
TCTN1-223	ENST00000550703	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
TCTN1-223	ENST00000550703	ABCC5	O15440	1437 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TCTN1-223	ENST00000550703	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.5	■■□□□ 1.99

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