RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DIP2BQ9P265 1576 aa18.94■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPOAP1O95153 1857 aa18.93■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAPKBP1O60336 1514 aa18.9■□□□□ 0.62
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRL1O94910 1474 aa18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.82■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXO41Q8TF61 875 aa18.77■□□□□ 0.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASXL2Q76L83 1435 aa18.61■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPRGP23470 1445 aa18.6■□□□□ 0.57
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOP2BQ02880 1626 aa18.58■□□□□ 0.56
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.55■□□□□ 0.56
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCC2Q92887 1545 aa18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLI2P10070 1586 aa18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CUL7Q14999 1698 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNIKQ9UKE5 1360 aa18.46■□□□□ 0.55
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ILDR2Q71H61 639 aa18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UACAQ9BZF9 1416 aa18.4■□□□□ 0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGF1RP08069 1367 aa18.39■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.37■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOCS7O14512 581 aa18.35■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF21BO75037 1637 aa18.34■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.33■□□□□ 0.53
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNH8Q96L42 1107 aa18.33■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.31■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPRMP28827 1452 aa18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD109Q6YHK3 1445 aa18.29■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF27Q86VH2 1401 aa18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.27■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IQGAP2Q13576 1575 aa18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DISP1Q96F81 1524 aa18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPA2P54652 639 aa18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CERKQ8TCT0 537 aa18.23■□□□□ 0.51
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.21■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.14■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARID3CA6NKF2 412 aa18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MADDQ8WXG6 1647 aa18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA0556O60303 1618 aa18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.08■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCA8O94911 1581 aa17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MLECQ14165 292 aa17.96■□□□□ 0.47
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.95■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P3H3Q8IVL6 736 aa17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa17.9■□□□□ 0.46
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA3Q08378 1498 aa17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEO1Q92859 1461 aa17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP10BO94823 1461 aa17.88■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17.87■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.86■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.85■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FANCAO15360 1455 aa17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKNAQ7Z591 1439 aa17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa17.75■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STRCQ7RTU9 1775 aa17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RICTORQ6R327 1708 aa17.74■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.73■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBAP1LF5GYI3 381 aa17.67■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.66■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPRTO14522 1441 aa17.65■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
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