RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533902.2

PRSS23-209, Transcript of serine protease 23, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PRSS23, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS23-209ENST00000533902 ADAMTS12P58397 1594 aa28.78■■■□□ 2.2
PRSS23-209ENST00000533902 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.75■■■□□ 2.19
PRSS23-209ENST00000533902 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
PRSS23-209ENST00000533902 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.65■■■□□ 2.18
PRSS23-209ENST00000533902 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.6■■■□□ 2.17
PRSS23-209ENST00000533902 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PRSS23-209ENST00000533902 APLP2Q06481 763 aa28.57■■■□□ 2.16
PRSS23-209ENST00000533902 SAMD9Q5K651 1589 aa28.52■■■□□ 2.16
PRSS23-209ENST00000533902 IQGAP2Q13576 1575 aa28.49■■■□□ 2.15
PRSS23-209ENST00000533902 GRIN2AQ12879 1464 aa28.48■■■□□ 2.15
PRSS23-209ENST00000533902 SYNJ2O15056 1496 aa28.45■■■□□ 2.15
PRSS23-209ENST00000533902 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.44■■■□□ 2.14
PRSS23-209ENST00000533902 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PRSS23-209ENST00000533902 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PRSS23-209ENST00000533902 MAP3K1Q13233 1512 aa28.39■■■□□ 2.14
PRSS23-209ENST00000533902 P3H3Q8IVL6 736 aa28.38■■■□□ 2.13
PRSS23-209ENST00000533902 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.37■■■□□ 2.13
PRSS23-209ENST00000533902 FMN1Q68DA7 1419 aa28.36■■■□□ 2.13
PRSS23-209ENST00000533902 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.34■■■□□ 2.13
PRSS23-209ENST00000533902 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.34■■■□□ 2.13
PRSS23-209ENST00000533902 TIAM1Q13009 1591 aa28.34■■■□□ 2.13
PRSS23-209ENST00000533902 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PRSS23-209ENST00000533902 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.32■■■□□ 2.12
PRSS23-209ENST00000533902 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.31■■■□□ 2.12
PRSS23-209ENST00000533902 CEP170Q5SW79 1584 aa28.3■■■□□ 2.12
PRSS23-209ENST00000533902 NUP160Q12769 1436 aa28.25■■■□□ 2.11
PRSS23-209ENST00000533902 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PRSS23-209ENST00000533902 FBLN2P98095 1184 aa28.2■■■□□ 2.11
PRSS23-209ENST00000533902 KIAA0556O60303 1618 aa28.2■■■□□ 2.1
PRSS23-209ENST00000533902 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.18■■■□□ 2.1
PRSS23-209ENST00000533902 CHD1O14646 1710 aa28.17■■■□□ 2.1
PRSS23-209ENST00000533902 DISP1Q96F81 1524 aa28.16■■■□□ 2.1
PRSS23-209ENST00000533902 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.15■■■□□ 2.1
PRSS23-209ENST00000533902 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PRSS23-209ENST00000533902 HECW1Q76N89 1606 aa28.09■■■□□ 2.09
PRSS23-209ENST00000533902 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
PRSS23-209ENST00000533902 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.03■■■□□ 2.08
PRSS23-209ENST00000533902 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.01■■■□□ 2.07
PRSS23-209ENST00000533902 JPH4Q96JJ6 628 aa28■■■□□ 2.07
PRSS23-209ENST00000533902 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.96■■■□□ 2.07
PRSS23-209ENST00000533902 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PRSS23-209ENST00000533902 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.93■■■□□ 2.06
PRSS23-209ENST00000533902 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.93■■■□□ 2.06
PRSS23-209ENST00000533902 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.91■■■□□ 2.06
PRSS23-209ENST00000533902 SHROOM2Q13796 1616 aa27.9■■■□□ 2.06
PRSS23-209ENST00000533902 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PRSS23-209ENST00000533902 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.89■■■□□ 2.06
PRSS23-209ENST00000533902 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PRSS23-209ENST00000533902 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PRSS23-209ENST00000533902 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PRSS23-209ENST00000533902 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PRSS23-209ENST00000533902 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.83■■■□□ 2.05
PRSS23-209ENST00000533902 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
PRSS23-209ENST00000533902 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.79■■■□□ 2.04
PRSS23-209ENST00000533902 NCOA2Q15596 1464 aa27.78■■■□□ 2.04
PRSS23-209ENST00000533902 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PRSS23-209ENST00000533902 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.78■■■□□ 2.04
PRSS23-209ENST00000533902 ABCA8O94911 1581 aa27.77■■■□□ 2.04
PRSS23-209ENST00000533902 ARHGEF11O15085 1522 aa27.77■■■□□ 2.04
PRSS23-209ENST00000533902 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
PRSS23-209ENST00000533902 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
PRSS23-209ENST00000533902 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.71■■■□□ 2.03
PRSS23-209ENST00000533902 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.69■■■□□ 2.02
PRSS23-209ENST00000533902 PTPRGP23470 1445 aa27.67■■■□□ 2.02
PRSS23-209ENST00000533902 ARID3CA6NKF2 412 aa27.65■■■□□ 2.02
PRSS23-209ENST00000533902 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
PRSS23-209ENST00000533902 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
PRSS23-209ENST00000533902 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.62■■■□□ 2.01
PRSS23-209ENST00000533902 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.6■■■□□ 2.01
PRSS23-209ENST00000533902 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.6■■■□□ 2.01
PRSS23-209ENST00000533902 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
PRSS23-209ENST00000533902 ITGAEP38570 1179 aa27.57■■■□□ 2
PRSS23-209ENST00000533902 ATP10BO94823 1461 aa27.55■■■□□ 2
PRSS23-209ENST00000533902 MIA2Q96PC5 1412 aa27.54■■■□□ 2
PRSS23-209ENST00000533902 UACAQ9BZF9 1416 aa27.54■■■□□ 2
PRSS23-209ENST00000533902 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
PRSS23-209ENST00000533902 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.49■■□□□ 1.99
PRSS23-209ENST00000533902 ABCC2Q92887 1545 aa27.48■■□□□ 1.99
PRSS23-209ENST00000533902 KIF14Q15058 1648 aa27.47■■□□□ 1.99
PRSS23-209ENST00000533902 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.45■■□□□ 1.98
PRSS23-209ENST00000533902 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.43■■□□□ 1.98
PRSS23-209ENST00000533902 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.41■■□□□ 1.98
PRSS23-209ENST00000533902 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.4■■□□□ 1.98
PRSS23-209ENST00000533902 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
PRSS23-209ENST00000533902 OSCARQ8IYS5 282 aa27.37■■□□□ 1.97
PRSS23-209ENST00000533902 PTPRKQ15262 1439 aa27.37■■□□□ 1.97
PRSS23-209ENST00000533902 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.36■■□□□ 1.97
PRSS23-209ENST00000533902 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.36■■□□□ 1.97
PRSS23-209ENST00000533902 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PRSS23-209ENST00000533902 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.34■■□□□ 1.97
PRSS23-209ENST00000533902 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PRSS23-209ENST00000533902 HFM1A2PYH4 1435 aa27.32■■□□□ 1.96
PRSS23-209ENST00000533902 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PRSS23-209ENST00000533902 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.29■■□□□ 1.96
PRSS23-209ENST00000533902 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.28■■□□□ 1.96
PRSS23-209ENST00000533902 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.26■■□□□ 1.95
PRSS23-209ENST00000533902 AKNAQ7Z591 1439 aa27.26■■□□□ 1.95
PRSS23-209ENST00000533902 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
PRSS23-209ENST00000533902 DAPK1P53355 1430 aa27.24■■□□□ 1.95
PRSS23-209ENST00000533902 NAIPQ13075 1403 aa27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms