RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527197.5

PUF60-209, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUF60, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-209ENST00000527197 ADAMTS12P58397 1594 aa22.81■■□□□ 1.24
PUF60-209ENST00000527197 GRIN2AQ12879 1464 aa22.81■■□□□ 1.24
PUF60-209ENST00000527197 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PUF60-209ENST00000527197 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.74■■□□□ 1.23
PUF60-209ENST00000527197 CEP170Q5SW79 1584 aa22.73■■□□□ 1.23
PUF60-209ENST00000527197 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.73■■□□□ 1.23
PUF60-209ENST00000527197 NUP160Q12769 1436 aa22.72■■□□□ 1.23
PUF60-209ENST00000527197 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.69■■□□□ 1.22
PUF60-209ENST00000527197 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PUF60-209ENST00000527197 HRCP23327 699 aa22.67■■□□□ 1.22
PUF60-209ENST00000527197 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.66■■□□□ 1.22
PUF60-209ENST00000527197 KIF27Q86VH2 1401 aa22.66■■□□□ 1.22
PUF60-209ENST00000527197 PRXQ9BXM0 1461 aa22.62■■□□□ 1.21
PUF60-209ENST00000527197 SHROOM2Q13796 1616 aa22.61■■□□□ 1.21
PUF60-209ENST00000527197 CLIP1P30622 1438 aa22.54■■□□□ 1.2
PUF60-209ENST00000527197 JPH4Q96JJ6 628 aa22.51■■□□□ 1.19
PUF60-209ENST00000527197 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PUF60-209ENST00000527197 IGF1RP08069 1367 aa22.48■■□□□ 1.19
PUF60-209ENST00000527197 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.42■■□□□ 1.18
PUF60-209ENST00000527197 CUL7Q14999 1698 aa22.42■■□□□ 1.18
PUF60-209ENST00000527197 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PUF60-209ENST00000527197 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.37■■□□□ 1.17
PUF60-209ENST00000527197 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.34■■□□□ 1.17
PUF60-209ENST00000527197 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-209ENST00000527197 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-209ENST00000527197 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
PUF60-209ENST00000527197 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 MAPKBP1O60336 1514 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 IQGAP2Q13576 1575 aa22.17■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 PTPRGP23470 1445 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.14■■□□□ 1.14
PUF60-209ENST00000527197 APLP2Q06481 763 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-209ENST00000527197 DIP2BQ9P265 1576 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-209ENST00000527197 DISP1Q96F81 1524 aa22.07■■□□□ 1.12
PUF60-209ENST00000527197 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.06■■□□□ 1.12
PUF60-209ENST00000527197 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PUF60-209ENST00000527197 ABCC2Q92887 1545 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-209ENST00000527197 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.02■■□□□ 1.12
PUF60-209ENST00000527197 TSPOAP1O95153 1857 aa22■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 UACAQ9BZF9 1416 aa21.99■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 KIAA0556O60303 1618 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 MAP3K1Q13233 1512 aa21.98■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.97■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 ASXL2Q76L83 1435 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 TIAM1Q13009 1591 aa21.96■■□□□ 1.11
PUF60-209ENST00000527197 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PUF60-209ENST00000527197 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.92■■□□□ 1.1
PUF60-209ENST00000527197 SAMD9Q5K651 1589 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-209ENST00000527197 KDM6BO15054 1643 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-209ENST00000527197 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-209ENST00000527197 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 GLI2P10070 1586 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.85■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PUF60-209ENST00000527197 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PUF60-209ENST00000527197 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PUF60-209ENST00000527197 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.79■■□□□ 1.08
PUF60-209ENST00000527197 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.78■■□□□ 1.08
PUF60-209ENST00000527197 FMN1Q68DA7 1419 aa21.78■■□□□ 1.08
PUF60-209ENST00000527197 ABCA8O94911 1581 aa21.77■■□□□ 1.08
PUF60-209ENST00000527197 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.76■■□□□ 1.07
PUF60-209ENST00000527197 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PUF60-209ENST00000527197 P3H3Q8IVL6 736 aa21.74■■□□□ 1.07
PUF60-209ENST00000527197 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.74■■□□□ 1.07
PUF60-209ENST00000527197 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.7■■□□□ 1.06
PUF60-209ENST00000527197 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.69■■□□□ 1.06
PUF60-209ENST00000527197 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PUF60-209ENST00000527197 KCNH8Q96L42 1107 aa21.68■■□□□ 1.06
PUF60-209ENST00000527197 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.68■■□□□ 1.06
PUF60-209ENST00000527197 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.67■■□□□ 1.06
PUF60-209ENST00000527197 ARID3CA6NKF2 412 aa21.66■■□□□ 1.06
PUF60-209ENST00000527197 HECW1Q76N89 1606 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-209ENST00000527197 CD109Q6YHK3 1445 aa21.61■■□□□ 1.05
PUF60-209ENST00000527197 ATP10BO94823 1461 aa21.6■■□□□ 1.05
PUF60-209ENST00000527197 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-209ENST00000527197 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.57■■□□□ 1.04
PUF60-209ENST00000527197 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-209ENST00000527197 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-209ENST00000527197 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PUF60-209ENST00000527197 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.56■■□□□ 1.04
PUF60-209ENST00000527197 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PUF60-209ENST00000527197 ADGRL1O94910 1474 aa21.51■■□□□ 1.03
PUF60-209ENST00000527197 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.48■■□□□ 1.03
PUF60-209ENST00000527197 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PUF60-209ENST00000527197 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 17.2
PUF60-209ENST00000527197 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.46■■□□□ 1.03
PUF60-209ENST00000527197 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PUF60-209ENST00000527197 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.44■■□□□ 1.02
PUF60-209ENST00000527197 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms