RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRU-209ENST00000526080 JPH4Q96JJ6 628 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRU-209ENST00000526080 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRU-209ENST00000526080 DIP2BQ9P265 1576 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRU-209ENST00000526080 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRU-209ENST00000526080 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRU-209ENST00000526080 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRU-209ENST00000526080 KDM6BO15054 1643 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRU-209ENST00000526080 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
PTPRU-209ENST00000526080 CUL7Q14999 1698 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRU-209ENST00000526080 IGF1RP08069 1367 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRU-209ENST00000526080 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRU-209ENST00000526080 TSPOAP1O95153 1857 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRU-209ENST00000526080 KIF27Q86VH2 1401 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRU-209ENST00000526080 ABCC2Q92887 1545 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRU-209ENST00000526080 PTPRGP23470 1445 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRU-209ENST00000526080 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PTPRU-209ENST00000526080 GLI2P10070 1586 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRU-209ENST00000526080 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRU-209ENST00000526080 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRU-209ENST00000526080 ASXL2Q76L83 1435 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRU-209ENST00000526080 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRU-209ENST00000526080 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRU-209ENST00000526080 IQGAP2Q13576 1575 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRU-209ENST00000526080 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRU-209ENST00000526080 DISP1Q96F81 1524 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRU-209ENST00000526080 UACAQ9BZF9 1416 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRU-209ENST00000526080 ADGRL1O94910 1474 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRU-209ENST00000526080 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRU-209ENST00000526080 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRU-209ENST00000526080 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRU-209ENST00000526080 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRU-209ENST00000526080 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PTPRU-209ENST00000526080 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRU-209ENST00000526080 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRU-209ENST00000526080 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PTPRU-209ENST00000526080 KIAA0556O60303 1618 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRU-209ENST00000526080 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRU-209ENST00000526080 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRU-209ENST00000526080 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRU-209ENST00000526080 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRU-209ENST00000526080 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRU-209ENST00000526080 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRU-209ENST00000526080 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRU-209ENST00000526080 ABCA8O94911 1581 aa24.14■■□□□ 1.45
PTPRU-209ENST00000526080 CD109Q6YHK3 1445 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRU-209ENST00000526080 GOLGA3Q08378 1498 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRU-209ENST00000526080 KIF21BO75037 1637 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRU-209ENST00000526080 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24■■□□□ 1.43
PTPRU-209ENST00000526080 PRXQ9BXM0 1461 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-209ENST00000526080 KCNH8Q96L42 1107 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRU-209ENST00000526080 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRU-209ENST00000526080 ATP10BO94823 1461 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRU-209ENST00000526080 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRU-209ENST00000526080 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRU-209ENST00000526080 PTPRMP28827 1452 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRU-209ENST00000526080 SAMD9Q5K651 1589 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRU-209ENST00000526080 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRU-209ENST00000526080 NEO1Q92859 1461 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRU-209ENST00000526080 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRU-209ENST00000526080 FBXO41Q8TF61 875 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRU-209ENST00000526080 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRU-209ENST00000526080 ARID3CA6NKF2 412 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRU-209ENST00000526080 MADDQ8WXG6 1647 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRU-209ENST00000526080 RAPGEF3O95398 923 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRU-209ENST00000526080 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRU-209ENST00000526080 P3H3Q8IVL6 736 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRU-209ENST00000526080 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRU-209ENST00000526080 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRU-209ENST00000526080 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRU-209ENST00000526080 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRU-209ENST00000526080 RICTORQ6R327 1708 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRU-209ENST00000526080 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-209ENST00000526080 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-209ENST00000526080 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-209ENST00000526080 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-209ENST00000526080 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-209ENST00000526080 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-209ENST00000526080 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-209ENST00000526080 AKNAQ7Z591 1439 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-209ENST00000526080 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-209ENST00000526080 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRU-209ENST00000526080 FANCAO15360 1455 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRU-209ENST00000526080 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-209ENST00000526080 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-209ENST00000526080 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRU-209ENST00000526080 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-209ENST00000526080 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-209ENST00000526080 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRU-209ENST00000526080 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-209ENST00000526080 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-209ENST00000526080 EEA1Q15075 1411 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-209ENST00000526080 HECW1Q76N89 1606 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-209ENST00000526080 HSPA2P54652 639 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-209ENST00000526080 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-209ENST00000526080 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PTPRU-209ENST00000526080 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRU-209ENST00000526080 PLCH2O75038 1416 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRU-209ENST00000526080 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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