RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.45■□□□□ 0.38
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PTPRK-216ENST00000524481 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.95■□□□□ 0.3
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PTPRK-216ENST00000524481 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRK-216ENST00000524481 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRK-216ENST00000524481 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRK-216ENST00000524481 PTPRKQ15262 1439 aa16.89■□□□□ 0.3
PTPRK-216ENST00000524481 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.89■□□□□ 0.3
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PTPRK-216ENST00000524481 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
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PTPRK-216ENST00000524481 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRK-216ENST00000524481 MAP3K1Q13233 1512 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRK-216ENST00000524481 DISP1Q96F81 1524 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRK-216ENST00000524481 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRK-216ENST00000524481 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRK-216ENST00000524481 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRK-216ENST00000524481 SAMD9Q5K651 1589 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRK-216ENST00000524481 TONSLQ96HA7 1378 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRK-216ENST00000524481 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.285e-7■■□□□ 13.3
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PTPRK-216ENST00000524481 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRK-216ENST00000524481 CEP170Q5SW79 1584 aa16.81■□□□□ 0.28
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PTPRK-216ENST00000524481 TSPY10P0CW01 314 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRK-216ENST00000524481 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRK-216ENST00000524481 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PTPRK-216ENST00000524481 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.79■□□□□ 0.28
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PTPRK-216ENST00000524481 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRK-216ENST00000524481 HECW1Q76N89 1606 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRK-216ENST00000524481 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRK-216ENST00000524481 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRK-216ENST00000524481 KIAA0556O60303 1618 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRK-216ENST00000524481 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRK-216ENST00000524481 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRK-216ENST00000524481 NAIPQ13075 1403 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRK-216ENST00000524481 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRK-216ENST00000524481 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRK-216ENST00000524481 NUP160Q12769 1436 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRK-216ENST00000524481 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRK-216ENST00000524481 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
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