RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR29	P0C7W0	189 aa		7.77	□□□□□ -1.17
ATXN3-212	ENST00000515746	KLHL34	Q8N239	644 aa		7.77	□□□□□ -1.17
ATXN3-212	ENST00000515746	PITPNM1	O00562	1244 aa		7.76	□□□□□ -1.17
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHG5	O94827	1062 aa		7.75	□□□□□ -1.17
ATXN3-212	ENST00000515746	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
ATXN3-212	ENST00000515746	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
ATXN3-212	ENST00000515746	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	7.71	□□□□□ -1.17
ATXN3-212	ENST00000515746	WIZ	O95785	1651 aa		7.71	□□□□□ -1.18
ATXN3-212	ENST00000515746	SPOCK2	Q92563	424 aa		7.7	□□□□□ -1.18
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
ATXN3-212	ENST00000515746	CREBZF	Q9NS37	354 aa		7.68	□□□□□ -1.18
ATXN3-212	ENST00000515746	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
ATXN3-212	ENST00000515746	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		7.64	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		7.62	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		7.62	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	SMARCA2	P51531	1590 aa		7.62	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP162	Q5TB80	1403 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	CHADL	Q6NUI6	762 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	EEA1	Q15075	1411 aa		7.61	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	SMARCA4	P51532	1647 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	PKD2	Q13563	968 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	7.59	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCC8	Q09428	1581 aa		7.59	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	SOGA1	O94964	1423 aa		7.58	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	HAX1	O00165	279 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	7.57	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	NUBP1	P53384	320 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	NEUROD1	Q13562	356 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	EVX2	Q03828	476 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	GSE1	Q14687	1217 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA3	Q08378	1498 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		7.52	□□□□□ -1.2
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM212A	Q96EL1	285 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ATXN3-212	ENST00000515746	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATXN3-212	ENST00000515746	RASEF	Q8IZ41	740 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ATXN3-212	ENST00000515746	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF21B	O75037	1637 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ATXN3-212	ENST00000515746	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ATXN3-212	ENST00000515746	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	SYNJ1	O43426	1573 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	RGL2	O15211	777 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	LHX8	Q68G74	356 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	CLIP1	P30622	1438 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	PYGB	P11216	843 aa		7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
ATXN3-212	ENST00000515746	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		7.39	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	MYT1	Q01538	1121 aa		7.38	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		7.37	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	PRX	Q9BXM0	1461 aa		7.36	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	TOP2B	Q02880	1626 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		7.35	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	CUX2	O14529	1486 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	ARAP1	Q96P48	1450 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF12	Q96FN5	646 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP3K13	O43283	966 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	PHF12	Q96QT6	1004 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	CUX1	P39880	1505 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.7 ms