RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.84■■■□□ 2.21
ALYREF-204ENST00000512673 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
ALYREF-204ENST00000512673 MAPKBP1O60336 1514 aa28.8■■■□□ 2.2
ALYREF-204ENST00000512673 JPH4Q96JJ6 628 aa28.79■■■□□ 2.2
ALYREF-204ENST00000512673 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.75■■■□□ 2.19
ALYREF-204ENST00000512673 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
ALYREF-204ENST00000512673 ADGRL1O94910 1474 aa28.66■■■□□ 2.18
ALYREF-204ENST00000512673 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.64■■■□□ 2.17
ALYREF-204ENST00000512673 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.63■■■□□ 2.17
ALYREF-204ENST00000512673 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.62■■■□□ 2.17
ALYREF-204ENST00000512673 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.52■■■□□ 2.16
ALYREF-204ENST00000512673 TOP2BQ02880 1626 aa28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-204ENST00000512673 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
ALYREF-204ENST00000512673 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
ALYREF-204ENST00000512673 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
ALYREF-204ENST00000512673 ASXL2Q76L83 1435 aa28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-204ENST00000512673 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.31■■■□□ 2.12
ALYREF-204ENST00000512673 PTPRGP23470 1445 aa28.3■■■□□ 2.12
ALYREF-204ENST00000512673 FBXO41Q8TF61 875 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-204ENST00000512673 GLI2P10070 1586 aa28.28■■■□□ 2.12
ALYREF-204ENST00000512673 ABCC2Q92887 1545 aa28.27■■■□□ 2.12
ALYREF-204ENST00000512673 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.24■■■□□ 2.11
ALYREF-204ENST00000512673 CUL7Q14999 1698 aa28.23■■■□□ 2.11
ALYREF-204ENST00000512673 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
ALYREF-204ENST00000512673 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.14■■■□□ 2.1
ALYREF-204ENST00000512673 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
ALYREF-204ENST00000512673 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.13■■■□□ 2.09
ALYREF-204ENST00000512673 IGF1RP08069 1367 aa28.09■■■□□ 2.09
ALYREF-204ENST00000512673 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.08■■■□□ 2.09
ALYREF-204ENST00000512673 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.06■■■□□ 2.08
ALYREF-204ENST00000512673 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.04■■■□□ 2.08
ALYREF-204ENST00000512673 UACAQ9BZF9 1416 aa28.04■■■□□ 2.08
ALYREF-204ENST00000512673 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
ALYREF-204ENST00000512673 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.97■■■□□ 2.07
ALYREF-204ENST00000512673 KIF21BO75037 1637 aa27.96■■■□□ 2.07
ALYREF-204ENST00000512673 KIF27Q86VH2 1401 aa27.93■■■□□ 2.06
ALYREF-204ENST00000512673 IQGAP2Q13576 1575 aa27.92■■■□□ 2.06
ALYREF-204ENST00000512673 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.91■■■□□ 2.06
ALYREF-204ENST00000512673 DISP1Q96F81 1524 aa27.9■■■□□ 2.06
ALYREF-204ENST00000512673 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.88■■■□□ 2.05
ALYREF-204ENST00000512673 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.84■■■□□ 2.05
ALYREF-204ENST00000512673 CD109Q6YHK3 1445 aa27.81■■■□□ 2.04
ALYREF-204ENST00000512673 KCNH8Q96L42 1107 aa27.8■■■□□ 2.04
ALYREF-204ENST00000512673 PTPRMP28827 1452 aa27.79■■■□□ 2.04
ALYREF-204ENST00000512673 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.77■■■□□ 2.04
ALYREF-204ENST00000512673 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.73■■■□□ 2.03
ALYREF-204ENST00000512673 ILDR2Q71H61 639 aa27.71■■■□□ 2.03
ALYREF-204ENST00000512673 KIAA0556O60303 1618 aa27.7■■■□□ 2.03
ALYREF-204ENST00000512673 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.7■■■□□ 2.02
ALYREF-204ENST00000512673 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
ALYREF-204ENST00000512673 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.67■■■□□ 2.02
ALYREF-204ENST00000512673 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-204ENST00000512673 HSPA2P54652 639 aa27.6■■■□□ 2.01
ALYREF-204ENST00000512673 MADDQ8WXG6 1647 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-204ENST00000512673 SOCS7O14512 581 aa27.59■■■□□ 2.01
ALYREF-204ENST00000512673 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.58■■■□□ 2.01
ALYREF-204ENST00000512673 RAPGEF3O95398 923 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-204ENST00000512673 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
ALYREF-204ENST00000512673 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-204ENST00000512673 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-204ENST00000512673 CERKQ8TCT0 537 aa27.54■■■□□ 2
ALYREF-204ENST00000512673 ARID3CA6NKF2 412 aa27.53■■■□□ 2
ALYREF-204ENST00000512673 ABCA8O94911 1581 aa27.51■■□□□ 1.99
ALYREF-204ENST00000512673 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.48■■□□□ 1.99
ALYREF-204ENST00000512673 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
ALYREF-204ENST00000512673 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.39■■□□□ 1.97
ALYREF-204ENST00000512673 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.34■■□□□ 1.97
ALYREF-204ENST00000512673 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.33■■□□□ 1.97
ALYREF-204ENST00000512673 GOLGA3Q08378 1498 aa27.32■■□□□ 1.96
ALYREF-204ENST00000512673 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.31■■□□□ 1.96
ALYREF-204ENST00000512673 ATP10BO94823 1461 aa27.3■■□□□ 1.96
ALYREF-204ENST00000512673 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.28■■□□□ 1.96
ALYREF-204ENST00000512673 NEO1Q92859 1461 aa27.27■■□□□ 1.96
ALYREF-204ENST00000512673 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.26■■□□□ 1.96
ALYREF-204ENST00000512673 P3H3Q8IVL6 736 aa27.23■■□□□ 1.95
ALYREF-204ENST00000512673 MLECQ14165 292 aa27.21■■□□□ 1.95
ALYREF-204ENST00000512673 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.21■■□□□ 1.95
ALYREF-204ENST00000512673 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
ALYREF-204ENST00000512673 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
ALYREF-204ENST00000512673 RICTORQ6R327 1708 aa27.15■■□□□ 1.94
ALYREF-204ENST00000512673 FANCAO15360 1455 aa27.13■■□□□ 1.93
ALYREF-204ENST00000512673 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
ALYREF-204ENST00000512673 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.12■■□□□ 1.93
ALYREF-204ENST00000512673 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.12■■□□□ 1.93
ALYREF-204ENST00000512673 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.11■■□□□ 1.93
ALYREF-204ENST00000512673 AKNAQ7Z591 1439 aa27.09■■□□□ 1.93
ALYREF-204ENST00000512673 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.05■■□□□ 1.92
ALYREF-204ENST00000512673 STRCQ7RTU9 1775 aa27.05■■□□□ 1.92
ALYREF-204ENST00000512673 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
ALYREF-204ENST00000512673 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.05■■□□□ 1.92
ALYREF-204ENST00000512673 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.05■■□□□ 1.92
ALYREF-204ENST00000512673 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
ALYREF-204ENST00000512673 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.02■■□□□ 1.92
ALYREF-204ENST00000512673 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.01■■□□□ 1.92
ALYREF-204ENST00000512673 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.99■■□□□ 1.91
ALYREF-204ENST00000512673 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.98■■□□□ 1.91
ALYREF-204ENST00000512673 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.96■■□□□ 1.91
ALYREF-204ENST00000512673 HECW1Q76N89 1606 aa26.94■■□□□ 1.9
ALYREF-204ENST00000512673 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
ALYREF-204ENST00000512673 PRXQ9BXM0 1461 aa26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.3 ms