RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511669.1

CXCL3-204, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL3, Length 1,641 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-204ENST00000511669 GRIN2BQ13224 1484 aa25.22■■□□□ 1.63
CXCL3-204ENST00000511669 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CXCL3-204ENST00000511669 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CXCL3-204ENST00000511669 ADAMTS12P58397 1594 aa25.15■■□□□ 1.62
CXCL3-204ENST00000511669 MAP3K1Q13233 1512 aa25.13■■□□□ 1.61
CXCL3-204ENST00000511669 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.613e-7■■■■■ 36.6
CXCL3-204ENST00000511669 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CXCL3-204ENST00000511669 FMN1Q68DA7 1419 aa25.05■■□□□ 1.6
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CXCL3-204ENST00000511669 SAMD9Q5K651 1589 aa25.03■■□□□ 1.6
CXCL3-204ENST00000511669 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.02■■□□□ 1.6
CXCL3-204ENST00000511669 TIAM1Q13009 1591 aa25.01■■□□□ 1.59
CXCL3-204ENST00000511669 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CXCL3-204ENST00000511669 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.99■■□□□ 1.59
CXCL3-204ENST00000511669 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CXCL3-204ENST00000511669 IQGAP2Q13576 1575 aa24.98■■□□□ 1.59
CXCL3-204ENST00000511669 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.98■■□□□ 1.59
CXCL3-204ENST00000511669 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.96■■□□□ 1.59
CXCL3-204ENST00000511669 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.95■■□□□ 1.58
CXCL3-204ENST00000511669 P3H3Q8IVL6 736 aa24.94■■□□□ 1.58
CXCL3-204ENST00000511669 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CXCL3-204ENST00000511669 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CXCL3-204ENST00000511669 GRIN2AQ12879 1464 aa24.88■■□□□ 1.57
CXCL3-204ENST00000511669 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.88■■□□□ 1.57
CXCL3-204ENST00000511669 SYNJ2O15056 1496 aa24.86■■□□□ 1.57
CXCL3-204ENST00000511669 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.86■■□□□ 1.57
CXCL3-204ENST00000511669 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CXCL3-204ENST00000511669 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.84■■□□□ 1.57
CXCL3-204ENST00000511669 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CXCL3-204ENST00000511669 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CXCL3-204ENST00000511669 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CXCL3-204ENST00000511669 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CXCL3-204ENST00000511669 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.77■■□□□ 1.56
CXCL3-204ENST00000511669 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.76■■□□□ 1.55
CXCL3-204ENST00000511669 HECW1Q76N89 1606 aa24.75■■□□□ 1.55
CXCL3-204ENST00000511669 KIAA0556O60303 1618 aa24.7■■□□□ 1.54
CXCL3-204ENST00000511669 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.68■■□□□ 1.54
CXCL3-204ENST00000511669 NUP160Q12769 1436 aa24.66■■□□□ 1.54
CXCL3-204ENST00000511669 CEP170Q5SW79 1584 aa24.66■■□□□ 1.54
CXCL3-204ENST00000511669 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.65■■□□□ 1.54
CXCL3-204ENST00000511669 FBLN2P98095 1184 aa24.64■■□□□ 1.53
CXCL3-204ENST00000511669 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.62■■□□□ 1.53
CXCL3-204ENST00000511669 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CXCL3-204ENST00000511669 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.62■■□□□ 1.53
CXCL3-204ENST00000511669 DISP1Q96F81 1524 aa24.61■■□□□ 1.53
CXCL3-204ENST00000511669 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.59■■□□□ 1.53
CXCL3-204ENST00000511669 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
CXCL3-204ENST00000511669 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CXCL3-204ENST00000511669 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.53■■□□□ 1.52
CXCL3-204ENST00000511669 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.51■■□□□ 1.51
CXCL3-204ENST00000511669 JPH4Q96JJ6 628 aa24.5■■□□□ 1.51
CXCL3-204ENST00000511669 NCOA2Q15596 1464 aa24.49■■□□□ 1.51
CXCL3-204ENST00000511669 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CXCL3-204ENST00000511669 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.48■■□□□ 1.51
CXCL3-204ENST00000511669 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.46■■□□□ 1.51
CXCL3-204ENST00000511669 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CXCL3-204ENST00000511669 CHD1O14646 1710 aa24.46■■□□□ 1.51
CXCL3-204ENST00000511669 ITGAEP38570 1179 aa24.43■■□□□ 1.5
CXCL3-204ENST00000511669 ARHGEF11O15085 1522 aa24.42■■□□□ 1.5
CXCL3-204ENST00000511669 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CXCL3-204ENST00000511669 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CXCL3-204ENST00000511669 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.38■■□□□ 1.49
CXCL3-204ENST00000511669 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.38■■□□□ 1.49
CXCL3-204ENST00000511669 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.35■■□□□ 1.49
CXCL3-204ENST00000511669 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CXCL3-204ENST00000511669 MIA2Q96PC5 1412 aa24.34■■□□□ 1.49
CXCL3-204ENST00000511669 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.31■■□□□ 1.48
CXCL3-204ENST00000511669 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CXCL3-204ENST00000511669 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CXCL3-204ENST00000511669 SHROOM2Q13796 1616 aa24.29■■□□□ 1.48
CXCL3-204ENST00000511669 ABCA8O94911 1581 aa24.29■■□□□ 1.48
CXCL3-204ENST00000511669 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.29■■□□□ 1.48
CXCL3-204ENST00000511669 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CXCL3-204ENST00000511669 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.24■■□□□ 1.47
CXCL3-204ENST00000511669 PTPRGP23470 1445 aa24.23■■□□□ 1.47
CXCL3-204ENST00000511669 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.23■■□□□ 1.47
CXCL3-204ENST00000511669 ARID3CA6NKF2 412 aa24.22■■□□□ 1.47
CXCL3-204ENST00000511669 HFM1A2PYH4 1435 aa24.18■■□□□ 1.46
CXCL3-204ENST00000511669 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CXCL3-204ENST00000511669 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.15■■□□□ 1.46
CXCL3-204ENST00000511669 AKNAQ7Z591 1439 aa24.15■■□□□ 1.46
CXCL3-204ENST00000511669 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.15■■□□□ 1.46
CXCL3-204ENST00000511669 KIF14Q15058 1648 aa24.14■■□□□ 1.46
CXCL3-204ENST00000511669 ATP10BO94823 1461 aa24.11■■□□□ 1.45
CXCL3-204ENST00000511669 UACAQ9BZF9 1416 aa24.11■■□□□ 1.45
CXCL3-204ENST00000511669 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.1■■□□□ 1.45
CXCL3-204ENST00000511669 PTPRKQ15262 1439 aa24.07■■□□□ 1.44
CXCL3-204ENST00000511669 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CXCL3-204ENST00000511669 NAIPQ13075 1403 aa24.06■■□□□ 1.44
CXCL3-204ENST00000511669 MAPKBP1O60336 1514 aa24.04■■□□□ 1.44
CXCL3-204ENST00000511669 ABCC2Q92887 1545 aa24.04■■□□□ 1.44
CXCL3-204ENST00000511669 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CXCL3-204ENST00000511669 ROCK1Q13464 1354 aa24.02■■□□□ 1.44
CXCL3-204ENST00000511669 DAPK1P53355 1430 aa24.02■■□□□ 1.44
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CXCL3-204ENST00000511669 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CXCL3-204ENST00000511669 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24■■□□□ 1.43
CXCL3-204ENST00000511669 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.99■■□□□ 1.43
CXCL3-204ENST00000511669 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.97■■□□□ 1.43
CXCL3-204ENST00000511669 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.97■■□□□ 1.43
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