RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495695.1

LAMA5-212, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 780 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-212ENST00000495695 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.15■■■■□ 3.22
LAMA5-212ENST00000495695 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.15■■■■□ 3.22
LAMA5-212ENST00000495695 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.09■■■■□ 3.21
LAMA5-212ENST00000495695 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.09■■■■□ 3.21
LAMA5-212ENST00000495695 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.06■■■■□ 3.2
LAMA5-212ENST00000495695 MAPKBP1O60336 1514 aa35.06■■■■□ 3.2
LAMA5-212ENST00000495695 IGF1RP08069 1367 aa35.05■■■■□ 3.2
LAMA5-212ENST00000495695 KIF27Q86VH2 1401 aa35.03■■■■□ 3.2
LAMA5-212ENST00000495695 CUL7Q14999 1698 aa34.95■■■■□ 3.18
LAMA5-212ENST00000495695 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.93■■■■□ 3.18
LAMA5-212ENST00000495695 DIP2BQ9P265 1576 aa34.89■■■■□ 3.18
LAMA5-212ENST00000495695 PTPRGP23470 1445 aa34.82■■■■□ 3.17
LAMA5-212ENST00000495695 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.81■■■■□ 3.16
LAMA5-212ENST00000495695 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.77■■■■□ 3.16
LAMA5-212ENST00000495695 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.73■■■■□ 3.15
LAMA5-212ENST00000495695 KDM6BO15054 1643 aa34.71■■■■□ 3.15
LAMA5-212ENST00000495695 ABCC2Q92887 1545 aa34.65■■■■□ 3.14
LAMA5-212ENST00000495695 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.61■■■■□ 3.13
LAMA5-212ENST00000495695 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
LAMA5-212ENST00000495695 IQGAP2Q13576 1575 aa34.6■■■■□ 3.13
LAMA5-212ENST00000495695 TSPOAP1O95153 1857 aa34.59■■■■□ 3.13
LAMA5-212ENST00000495695 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.58■■■■□ 3.13
LAMA5-212ENST00000495695 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.57■■■■□ 3.12
LAMA5-212ENST00000495695 ASXL2Q76L83 1435 aa34.55■■■■□ 3.12
LAMA5-212ENST00000495695 GLI2P10070 1586 aa34.53■■■■□ 3.12
LAMA5-212ENST00000495695 UACAQ9BZF9 1416 aa34.53■■■■□ 3.12
LAMA5-212ENST00000495695 DISP1Q96F81 1524 aa34.46■■■■□ 3.11
LAMA5-212ENST00000495695 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.44■■■■□ 3.1
LAMA5-212ENST00000495695 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.4■■■■□ 3.1
LAMA5-212ENST00000495695 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.4■■■■□ 3.1
LAMA5-212ENST00000495695 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
LAMA5-212ENST00000495695 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
LAMA5-212ENST00000495695 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.3■■■■□ 3.08
LAMA5-212ENST00000495695 KIAA0556O60303 1618 aa34.26■■■■□ 3.07
LAMA5-212ENST00000495695 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.26■■■■□ 3.07
LAMA5-212ENST00000495695 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
LAMA5-212ENST00000495695 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
LAMA5-212ENST00000495695 ADGRL1O94910 1474 aa34.17■■■■□ 3.06
LAMA5-212ENST00000495695 GOLGA3Q08378 1498 aa34.17■■■■□ 3.06
LAMA5-212ENST00000495695 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.16■■■■□ 3.06
LAMA5-212ENST00000495695 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
LAMA5-212ENST00000495695 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.06■■■■□ 3.04
LAMA5-212ENST00000495695 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.03■■■■□ 3.04
LAMA5-212ENST00000495695 CD109Q6YHK3 1445 aa34.03■■■■□ 3.04
LAMA5-212ENST00000495695 ABCA8O94911 1581 aa34■■■■□ 3.03
LAMA5-212ENST00000495695 KCNH8Q96L42 1107 aa33.99■■■■□ 3.03
LAMA5-212ENST00000495695 PRXQ9BXM0 1461 aa33.97■■■■□ 3.03
LAMA5-212ENST00000495695 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.96■■■■□ 3.03
LAMA5-212ENST00000495695 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
LAMA5-212ENST00000495695 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.8■■■■□ 3
LAMA5-212ENST00000495695 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.79■■■■□ 3
LAMA5-212ENST00000495695 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.78■■■■□ 3
LAMA5-212ENST00000495695 ATP10BO94823 1461 aa33.76■■■□□ 2.99
LAMA5-212ENST00000495695 P3H3Q8IVL6 736 aa33.71■■■□□ 2.99
LAMA5-212ENST00000495695 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.69■■■□□ 2.98
LAMA5-212ENST00000495695 ARID3CA6NKF2 412 aa33.65■■■□□ 2.98
LAMA5-212ENST00000495695 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.64■■■□□ 2.98
LAMA5-212ENST00000495695 SAMD9Q5K651 1589 aa33.6■■■□□ 2.97
LAMA5-212ENST00000495695 KIF21BO75037 1637 aa33.59■■■□□ 2.97
LAMA5-212ENST00000495695 NEO1Q92859 1461 aa33.58■■■□□ 2.97
LAMA5-212ENST00000495695 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
LAMA5-212ENST00000495695 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
LAMA5-212ENST00000495695 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.54■■■□□ 2.96
LAMA5-212ENST00000495695 RAPGEF3O95398 923 aa33.51■■■□□ 2.95
LAMA5-212ENST00000495695 EEA1Q15075 1411 aa33.5■■■□□ 2.95
LAMA5-212ENST00000495695 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.44■■■□□ 2.94
LAMA5-212ENST00000495695 PTPRMP28827 1452 aa33.44■■■□□ 2.94
LAMA5-212ENST00000495695 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
LAMA5-212ENST00000495695 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.43■■■□□ 2.94
LAMA5-212ENST00000495695 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
LAMA5-212ENST00000495695 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.33■■■□□ 2.93
LAMA5-212ENST00000495695 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
LAMA5-212ENST00000495695 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
LAMA5-212ENST00000495695 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.32■■■□□ 2.92
LAMA5-212ENST00000495695 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.31■■■□□ 2.92
LAMA5-212ENST00000495695 FBXO41Q8TF61 875 aa33.3■■■□□ 2.92
LAMA5-212ENST00000495695 AKNAQ7Z591 1439 aa33.28■■■□□ 2.92
LAMA5-212ENST00000495695 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.26■■■□□ 2.91
LAMA5-212ENST00000495695 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.26■■■□□ 2.91
LAMA5-212ENST00000495695 FANCAO15360 1455 aa33.25■■■□□ 2.91
LAMA5-212ENST00000495695 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.22■■■□□ 2.91
LAMA5-212ENST00000495695 MADDQ8WXG6 1647 aa33.2■■■□□ 2.91
LAMA5-212ENST00000495695 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.2■■■□□ 2.91
LAMA5-212ENST00000495695 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.2■■■□□ 2.914e-8■□□□□ 8.6
LAMA5-212ENST00000495695 RICTORQ6R327 1708 aa33.19■■■□□ 2.9
LAMA5-212ENST00000495695 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
LAMA5-212ENST00000495695 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.17■■■□□ 2.9
LAMA5-212ENST00000495695 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.14■■■□□ 2.9
LAMA5-212ENST00000495695 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.12■■■□□ 2.89
LAMA5-212ENST00000495695 PLCH2O75038 1416 aa33.08■■■□□ 2.89
LAMA5-212ENST00000495695 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.08■■■□□ 2.89
LAMA5-212ENST00000495695 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.07■■■□□ 2.89
LAMA5-212ENST00000495695 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
LAMA5-212ENST00000495695 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
LAMA5-212ENST00000495695 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.02■■■□□ 2.88
LAMA5-212ENST00000495695 FMN1Q68DA7 1419 aa33.02■■■□□ 2.88
LAMA5-212ENST00000495695 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.02■■■□□ 2.88
LAMA5-212ENST00000495695 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.01■■■□□ 2.87
LAMA5-212ENST00000495695 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
LAMA5-212ENST00000495695 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms