RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.59■■■□□ 2.81
PTPRN-217ENST00000489650 IGF1RP08069 1367 aa32.5■■■□□ 2.79
PTPRN-217ENST00000489650 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.47■■■□□ 2.79
PTPRN-217ENST00000489650 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.45■■■□□ 2.79
PTPRN-217ENST00000489650 KIF27Q86VH2 1401 aa32.44■■■□□ 2.78
PTPRN-217ENST00000489650 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.41■■■□□ 2.78
PTPRN-217ENST00000489650 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.4■■■□□ 2.78
PTPRN-217ENST00000489650 CUL7Q14999 1698 aa32.38■■■□□ 2.77
PTPRN-217ENST00000489650 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.37■■■□□ 2.77
PTPRN-217ENST00000489650 MAPKBP1O60336 1514 aa32.33■■■□□ 2.77
PTPRN-217ENST00000489650 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
PTPRN-217ENST00000489650 DIP2BQ9P265 1576 aa32.29■■■□□ 2.76
PTPRN-217ENST00000489650 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.28■■■□□ 2.76
PTPRN-217ENST00000489650 PTPRGP23470 1445 aa32.2■■■□□ 2.75
PTPRN-217ENST00000489650 TSPOAP1O95153 1857 aa32.19■■■□□ 2.74
PTPRN-217ENST00000489650 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.11■■■□□ 2.73
PTPRN-217ENST00000489650 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.11■■■□□ 2.73
PTPRN-217ENST00000489650 KDM6BO15054 1643 aa32.08■■■□□ 2.73
PTPRN-217ENST00000489650 IQGAP2Q13576 1575 aa32.07■■■□□ 2.72
PTPRN-217ENST00000489650 ABCC2Q92887 1545 aa32.02■■■□□ 2.72
PTPRN-217ENST00000489650 DISP1Q96F81 1524 aa31.97■■■□□ 2.71
PTPRN-217ENST00000489650 ASXL2Q76L83 1435 aa31.97■■■□□ 2.71
PTPRN-217ENST00000489650 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.94■■■□□ 2.7
PTPRN-217ENST00000489650 UACAQ9BZF9 1416 aa31.93■■■□□ 2.7
PTPRN-217ENST00000489650 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.93■■■□□ 2.7
PTPRN-217ENST00000489650 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.91■■■□□ 2.7
PTPRN-217ENST00000489650 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.91■■■□□ 2.7
PTPRN-217ENST00000489650 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
PTPRN-217ENST00000489650 GLI2P10070 1586 aa31.86■■■□□ 2.69
PTPRN-217ENST00000489650 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.85■■■□□ 2.69
PTPRN-217ENST00000489650 KIAA0556O60303 1618 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRN-217ENST00000489650 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.8■■■□□ 2.68
PTPRN-217ENST00000489650 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
PTPRN-217ENST00000489650 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
PTPRN-217ENST00000489650 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.71■■■□□ 2.67
PTPRN-217ENST00000489650 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
PTPRN-217ENST00000489650 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.7■■■□□ 2.66
PTPRN-217ENST00000489650 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.59■■■□□ 2.65
PTPRN-217ENST00000489650 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.59■■■□□ 2.65
PTPRN-217ENST00000489650 ADGRL1O94910 1474 aa31.58■■■□□ 2.65
PTPRN-217ENST00000489650 KCNH8Q96L42 1107 aa31.57■■■□□ 2.64
PTPRN-217ENST00000489650 GOLGA3Q08378 1498 aa31.57■■■□□ 2.64
PTPRN-217ENST00000489650 PRXQ9BXM0 1461 aa31.53■■■□□ 2.64
PTPRN-217ENST00000489650 ABCA8O94911 1581 aa31.52■■■□□ 2.64
PTPRN-217ENST00000489650 P3H3Q8IVL6 736 aa31.47■■■□□ 2.63
PTPRN-217ENST00000489650 CD109Q6YHK3 1445 aa31.47■■■□□ 2.63
PTPRN-217ENST00000489650 ARID3CA6NKF2 412 aa31.44■■■□□ 2.62
PTPRN-217ENST00000489650 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.42■■■□□ 2.62
PTPRN-217ENST00000489650 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.39■■■□□ 2.62
PTPRN-217ENST00000489650 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
PTPRN-217ENST00000489650 ATP10BO94823 1461 aa31.3■■■□□ 2.6
PTPRN-217ENST00000489650 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.3■■■□□ 2.6
PTPRN-217ENST00000489650 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
PTPRN-217ENST00000489650 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
PTPRN-217ENST00000489650 SAMD9Q5K651 1589 aa31.21■■■□□ 2.59
PTPRN-217ENST00000489650 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.21■■■□□ 2.59
PTPRN-217ENST00000489650 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
PTPRN-217ENST00000489650 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
PTPRN-217ENST00000489650 KIF21BO75037 1637 aa31.19■■■□□ 2.58
PTPRN-217ENST00000489650 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.16■■■□□ 2.58
PTPRN-217ENST00000489650 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.16■■■□□ 2.58
PTPRN-217ENST00000489650 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.14■■■□□ 2.58
PTPRN-217ENST00000489650 RAPGEF3O95398 923 aa31.09■■■□□ 2.57
PTPRN-217ENST00000489650 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.05■■■□□ 2.56
PTPRN-217ENST00000489650 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PTPRN-217ENST00000489650 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.04■■■□□ 2.56
PTPRN-217ENST00000489650 EEA1Q15075 1411 aa30.99■■■□□ 2.55
PTPRN-217ENST00000489650 NEO1Q92859 1461 aa30.99■■■□□ 2.55
PTPRN-217ENST00000489650 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.94■■■□□ 2.54
PTPRN-217ENST00000489650 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.92■■■□□ 2.54
PTPRN-217ENST00000489650 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.91■■■□□ 2.54
PTPRN-217ENST00000489650 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
PTPRN-217ENST00000489650 PTPRMP28827 1452 aa30.88■■■□□ 2.53
PTPRN-217ENST00000489650 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.87■■■□□ 2.53
PTPRN-217ENST00000489650 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.83■■■□□ 2.53
PTPRN-217ENST00000489650 AKNAQ7Z591 1439 aa30.82■■■□□ 2.52
PTPRN-217ENST00000489650 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.82■■■□□ 2.52
PTPRN-217ENST00000489650 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.81■■■□□ 2.52
PTPRN-217ENST00000489650 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
PTPRN-217ENST00000489650 MADDQ8WXG6 1647 aa30.79■■■□□ 2.52
PTPRN-217ENST00000489650 RICTORQ6R327 1708 aa30.78■■■□□ 2.52
PTPRN-217ENST00000489650 FANCAO15360 1455 aa30.78■■■□□ 2.52
PTPRN-217ENST00000489650 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.77■■■□□ 2.52
PTPRN-217ENST00000489650 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
PTPRN-217ENST00000489650 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
PTPRN-217ENST00000489650 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.73■■■□□ 2.51
PTPRN-217ENST00000489650 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.72■■■□□ 2.51
PTPRN-217ENST00000489650 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
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PTPRN-217ENST00000489650 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.65■■■□□ 2.5
PTPRN-217ENST00000489650 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.63■■■□□ 2.49
PTPRN-217ENST00000489650 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.62■■■□□ 2.49
PTPRN-217ENST00000489650 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.62■■■□□ 2.49
PTPRN-217ENST00000489650 PLCH2O75038 1416 aa30.61■■■□□ 2.49
PTPRN-217ENST00000489650 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
PTPRN-217ENST00000489650 MLECQ14165 292 aa30.6■■■□□ 2.49
PTPRN-217ENST00000489650 HECW1Q76N89 1606 aa30.6■■■□□ 2.49
PTPRN-217ENST00000489650 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.6■■■□□ 2.49
PTPRN-217ENST00000489650 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.59■■■□□ 2.49
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