RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489517.1

PRRT4-204, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene PRRT4, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-204ENST00000489517 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.92■■■■■ 4.46
PRRT4-204ENST00000489517 ADAMTS12P58397 1594 aa42.87■■■■■ 4.45
PRRT4-204ENST00000489517 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
PRRT4-204ENST00000489517 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
PRRT4-204ENST00000489517 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.78■■■■■ 4.44
PRRT4-204ENST00000489517 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.7■■■■■ 4.43
PRRT4-204ENST00000489517 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
PRRT4-204ENST00000489517 P3H3Q8IVL6 736 aa42.6■■■■■ 4.41
PRRT4-204ENST00000489517 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.54■■■■■ 4.4
PRRT4-204ENST00000489517 GRIN2AQ12879 1464 aa42.5■■■■■ 4.39
PRRT4-204ENST00000489517 IQGAP2Q13576 1575 aa42.49■■■■■ 4.39
PRRT4-204ENST00000489517 SAMD9Q5K651 1589 aa42.49■■■■■ 4.39
PRRT4-204ENST00000489517 SYNJ2O15056 1496 aa42.47■■■■■ 4.39
PRRT4-204ENST00000489517 HRCP23327 699 aa42.47■■■■■ 4.39
PRRT4-204ENST00000489517 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
PRRT4-204ENST00000489517 FMN1Q68DA7 1419 aa42.45■■■■■ 4.39
PRRT4-204ENST00000489517 MAP3K1Q13233 1512 aa42.41■■■■■ 4.38
PRRT4-204ENST00000489517 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.38■■■■■ 4.37
PRRT4-204ENST00000489517 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
PRRT4-204ENST00000489517 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.35■■■■■ 4.37
PRRT4-204ENST00000489517 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.35■■■■■ 4.37
PRRT4-204ENST00000489517 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
PRRT4-204ENST00000489517 FBLN2P98095 1184 aa42.32■■■■■ 4.36
PRRT4-204ENST00000489517 TIAM1Q13009 1591 aa42.31■■■■■ 4.36
PRRT4-204ENST00000489517 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
PRRT4-204ENST00000489517 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.28■■■■■ 4.36
PRRT4-204ENST00000489517 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.17■■■■■ 4.34
PRRT4-204ENST00000489517 CEP170Q5SW79 1584 aa42.16■■■■■ 4.34
PRRT4-204ENST00000489517 NUP160Q12769 1436 aa42.15■■■■■ 4.34
PRRT4-204ENST00000489517 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.14■■■■■ 4.34
PRRT4-204ENST00000489517 KIAA0556O60303 1618 aa42.03■■■■■ 4.32
PRRT4-204ENST00000489517 DISP1Q96F81 1524 aa42.01■■■■■ 4.32
PRRT4-204ENST00000489517 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
PRRT4-204ENST00000489517 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
PRRT4-204ENST00000489517 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.93■■■■■ 4.3
PRRT4-204ENST00000489517 HECW1Q76N89 1606 aa41.93■■■■■ 4.3
PRRT4-204ENST00000489517 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
PRRT4-204ENST00000489517 JPH4Q96JJ6 628 aa41.92■■■■■ 4.3
PRRT4-204ENST00000489517 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.91■■■■■ 4.3
PRRT4-204ENST00000489517 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.86■■■■■ 4.29
PRRT4-204ENST00000489517 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.86■■■■■ 4.29
PRRT4-204ENST00000489517 CHD1O14646 1710 aa41.83■■■■■ 4.29
PRRT4-204ENST00000489517 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.79■■■■■ 4.28
PRRT4-204ENST00000489517 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
PRRT4-204ENST00000489517 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
PRRT4-204ENST00000489517 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.75■■■■■ 4.27
PRRT4-204ENST00000489517 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
PRRT4-204ENST00000489517 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.72■■■■■ 4.27
PRRT4-204ENST00000489517 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.67■■■■■ 4.26
PRRT4-204ENST00000489517 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
PRRT4-204ENST00000489517 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
PRRT4-204ENST00000489517 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
PRRT4-204ENST00000489517 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
PRRT4-204ENST00000489517 NCOA2Q15596 1464 aa41.56■■■■■ 4.24
PRRT4-204ENST00000489517 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
PRRT4-204ENST00000489517 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
PRRT4-204ENST00000489517 ARID3CA6NKF2 412 aa41.51■■■■■ 4.24
PRRT4-204ENST00000489517 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.51■■■■■ 4.24
PRRT4-204ENST00000489517 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.5■■■■■ 4.23
PRRT4-204ENST00000489517 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.23
PRRT4-204ENST00000489517 ITGAEP38570 1179 aa41.48■■■■■ 4.23
PRRT4-204ENST00000489517 SHROOM2Q13796 1616 aa41.48■■■■■ 4.23
PRRT4-204ENST00000489517 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.47■■■■■ 4.23
PRRT4-204ENST00000489517 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.45■■■■■ 4.23
PRRT4-204ENST00000489517 PTPRGP23470 1445 aa41.43■■■■■ 4.22
PRRT4-204ENST00000489517 ARHGEF11O15085 1522 aa41.42■■■■■ 4.22
PRRT4-204ENST00000489517 ABCA8O94911 1581 aa41.39■■■■■ 4.22
PRRT4-204ENST00000489517 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.36■■■■■ 4.21
PRRT4-204ENST00000489517 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
PRRT4-204ENST00000489517 MIA2Q96PC5 1412 aa41.21■■■■■ 4.19
PRRT4-204ENST00000489517 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.19■■■■■ 4.19
PRRT4-204ENST00000489517 UACAQ9BZF9 1416 aa41.17■■■■■ 4.18
PRRT4-204ENST00000489517 ATP10BO94823 1461 aa41.16■■■■■ 4.18
PRRT4-204ENST00000489517 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.16■■■■■ 4.18
PRRT4-204ENST00000489517 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.15■■■■■ 4.18
PRRT4-204ENST00000489517 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
PRRT4-204ENST00000489517 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.13■■■■■ 4.18
PRRT4-204ENST00000489517 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.09■■■■■ 4.17
PRRT4-204ENST00000489517 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.07■■■■■ 4.16
PRRT4-204ENST00000489517 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.05■■■■■ 4.16
PRRT4-204ENST00000489517 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
PRRT4-204ENST00000489517 ABCC2Q92887 1545 aa41■■■■■ 4.15
PRRT4-204ENST00000489517 OSCARQ8IYS5 282 aa40.97■■■■■ 4.15
PRRT4-204ENST00000489517 KIF14Q15058 1648 aa40.96■■■■■ 4.15
PRRT4-204ENST00000489517 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.94■■■■■ 4.14
PRRT4-204ENST00000489517 PTPRKQ15262 1439 aa40.93■■■■■ 4.14
PRRT4-204ENST00000489517 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
PRRT4-204ENST00000489517 HFM1A2PYH4 1435 aa40.89■■■■■ 4.14
PRRT4-204ENST00000489517 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
PRRT4-204ENST00000489517 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.88■■■■■ 4.13
PRRT4-204ENST00000489517 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.81■■■■■ 4.12
PRRT4-204ENST00000489517 NAIPQ13075 1403 aa40.75■■■■■ 4.11
PRRT4-204ENST00000489517 AKNAQ7Z591 1439 aa40.75■■■■■ 4.11
PRRT4-204ENST00000489517 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.75■■■■■ 4.11
PRRT4-204ENST00000489517 DAPK1P53355 1430 aa40.75■■■■■ 4.11
PRRT4-204ENST00000489517 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
PRRT4-204ENST00000489517 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.74■■■■■ 4.11
PRRT4-204ENST00000489517 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
PRRT4-204ENST00000489517 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
PRRT4-204ENST00000489517 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.71■■■■■ 4.11
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