RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 ADAMTS12P58397 1594 aa22.33■■□□□ 1.16
SSR4-211ENST00000486204 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SSR4-211ENST00000486204 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.3■■□□□ 1.16
SSR4-211ENST00000486204 JPH4Q96JJ6 628 aa22.29■■□□□ 1.16
SSR4-211ENST00000486204 KDM6BO15054 1643 aa22.24■■□□□ 1.15
SSR4-211ENST00000486204 MAPKBP1O60336 1514 aa22.22■■□□□ 1.15
SSR4-211ENST00000486204 DIP2BQ9P265 1576 aa22.21■■□□□ 1.15
SSR4-211ENST00000486204 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.14■■□□□ 1.13
SSR4-211ENST00000486204 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.09■■□□□ 1.13
SSR4-211ENST00000486204 TSPOAP1O95153 1857 aa22.09■■□□□ 1.13
SSR4-211ENST00000486204 KIF27Q86VH2 1401 aa22.05■■□□□ 1.12
SSR4-211ENST00000486204 CUL7Q14999 1698 aa22.03■■□□□ 1.12
SSR4-211ENST00000486204 ADGRL1O94910 1474 aa22.03■■□□□ 1.12
SSR4-211ENST00000486204 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.02■■□□□ 1.12
SSR4-211ENST00000486204 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.94■■□□□ 1.1
SSR4-211ENST00000486204 IGF1RP08069 1367 aa21.93■■□□□ 1.1
SSR4-211ENST00000486204 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.9■■□□□ 1.1
SSR4-211ENST00000486204 PTPRGP23470 1445 aa21.89■■□□□ 1.09
SSR4-211ENST00000486204 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SSR4-211ENST00000486204 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.85■■□□□ 1.09
SSR4-211ENST00000486204 ASXL2Q76L83 1435 aa21.84■■□□□ 1.09
SSR4-211ENST00000486204 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.83■■□□□ 1.09
SSR4-211ENST00000486204 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SSR4-211ENST00000486204 GLI2P10070 1586 aa21.83■■□□□ 1.09
SSR4-211ENST00000486204 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SSR4-211ENST00000486204 ABCC2Q92887 1545 aa21.82■■□□□ 1.08
SSR4-211ENST00000486204 FBXO41Q8TF61 875 aa21.81■■□□□ 1.08
SSR4-211ENST00000486204 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.79■■□□□ 1.08
SSR4-211ENST00000486204 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.76■■□□□ 1.07
SSR4-211ENST00000486204 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.73■■□□□ 1.07
SSR4-211ENST00000486204 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.72■■□□□ 1.07
SSR4-211ENST00000486204 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.72■■□□□ 1.07
SSR4-211ENST00000486204 EEA1Q15075 1411 aa21.72■■□□□ 1.07
SSR4-211ENST00000486204 PRXQ9BXM0 1461 aa21.71■■□□□ 1.07
SSR4-211ENST00000486204 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.71■■□□□ 1.07
SSR4-211ENST00000486204 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.7■■□□□ 1.06
SSR4-211ENST00000486204 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SSR4-211ENST00000486204 UACAQ9BZF9 1416 aa21.67■■□□□ 1.06
SSR4-211ENST00000486204 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.66■■□□□ 1.06
SSR4-211ENST00000486204 IQGAP2Q13576 1575 aa21.63■■□□□ 1.05
SSR4-211ENST00000486204 KIF21BO75037 1637 aa21.62■■□□□ 1.05
SSR4-211ENST00000486204 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.6■■□□□ 1.05
SSR4-211ENST00000486204 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.59■■□□□ 1.05
SSR4-211ENST00000486204 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SSR4-211ENST00000486204 DISP1Q96F81 1524 aa21.51■■□□□ 1.03
SSR4-211ENST00000486204 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SSR4-211ENST00000486204 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.5■■□□□ 1.03
SSR4-211ENST00000486204 CD109Q6YHK3 1445 aa21.48■■□□□ 1.03
SSR4-211ENST00000486204 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.48■■□□□ 1.03
SSR4-211ENST00000486204 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.46■■□□□ 1.03
SSR4-211ENST00000486204 KCNH8Q96L42 1107 aa21.46■■□□□ 1.03
SSR4-211ENST00000486204 KIAA0556O60303 1618 aa21.45■■□□□ 1.02
SSR4-211ENST00000486204 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.43■■□□□ 1.02
SSR4-211ENST00000486204 PTPRMP28827 1452 aa21.39■■□□□ 1.02
SSR4-211ENST00000486204 GOLGA3Q08378 1498 aa21.39■■□□□ 1.01
SSR4-211ENST00000486204 SAMD9Q5K651 1589 aa21.38■■□□□ 1.01
SSR4-211ENST00000486204 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.37■■□□□ 1.01
SSR4-211ENST00000486204 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.32■■□□□ 1
SSR4-211ENST00000486204 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.31■■□□□ 1
SSR4-211ENST00000486204 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
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SSR4-211ENST00000486204 SOCS7O14512 581 aa21.24■□□□□ 0.99
SSR4-211ENST00000486204 ILDR2Q71H61 639 aa21.24■□□□□ 0.99
SSR4-211ENST00000486204 CERKQ8TCT0 537 aa21.24■□□□□ 0.99
SSR4-211ENST00000486204 RAPGEF3O95398 923 aa21.23■□□□□ 0.99
SSR4-211ENST00000486204 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.23■□□□□ 0.99
SSR4-211ENST00000486204 ABCA8O94911 1581 aa21.22■□□□□ 0.99
SSR4-211ENST00000486204 HSPA2P54652 639 aa21.21■□□□□ 0.99
SSR4-211ENST00000486204 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.2■□□□□ 0.98
SSR4-211ENST00000486204 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.2■□□□□ 0.98
SSR4-211ENST00000486204 MADDQ8WXG6 1647 aa21.18■□□□□ 0.98
SSR4-211ENST00000486204 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.18■□□□□ 0.98
SSR4-211ENST00000486204 ARID3CA6NKF2 412 aa21.16■□□□□ 0.98
SSR4-211ENST00000486204 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SSR4-211ENST00000486204 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.13■□□□□ 0.97
SSR4-211ENST00000486204 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.13■□□□□ 0.97
SSR4-211ENST00000486204 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.12■□□□□ 0.97
SSR4-211ENST00000486204 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.12■□□□□ 0.97
SSR4-211ENST00000486204 P3H3Q8IVL6 736 aa21.1■□□□□ 0.97
SSR4-211ENST00000486204 NEO1Q92859 1461 aa21.09■□□□□ 0.97
SSR4-211ENST00000486204 ATP10BO94823 1461 aa21.08■□□□□ 0.97
SSR4-211ENST00000486204 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
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SSR4-211ENST00000486204 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.07■□□□□ 0.96
SSR4-211ENST00000486204 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.03■□□□□ 0.96
SSR4-211ENST00000486204 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.01■□□□□ 0.95
SSR4-211ENST00000486204 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.99■□□□□ 0.95
SSR4-211ENST00000486204 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SSR4-211ENST00000486204 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SSR4-211ENST00000486204 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SSR4-211ENST00000486204 CLIP1P30622 1438 aa20.97■□□□□ 0.95
SSR4-211ENST00000486204 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.97■□□□□ 0.95
SSR4-211ENST00000486204 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SSR4-211ENST00000486204 HECW1Q76N89 1606 aa20.95■□□□□ 0.94
SSR4-211ENST00000486204 FMN1Q68DA7 1419 aa20.95■□□□□ 0.94
SSR4-211ENST00000486204 FANCAO15360 1455 aa20.94■□□□□ 0.94
SSR4-211ENST00000486204 MLECQ14165 292 aa20.94■□□□□ 0.94
SSR4-211ENST00000486204 AKNAQ7Z591 1439 aa20.94■□□□□ 0.94
SSR4-211ENST00000486204 CEP162Q5TB80 1403 aa20.93■□□□□ 0.94
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