RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483972.1

LTB-213, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 5

Gene LTB, Length 738 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-213ENST00000483972 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.42
LTB-213ENST00000483972 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.42■■■■□ 3.42
LTB-213ENST00000483972 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.3■■■■□ 3.4
LTB-213ENST00000483972 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.24■■■■□ 3.39
LTB-213ENST00000483972 MAPKBP1O60336 1514 aa36.21■■■■□ 3.39
LTB-213ENST00000483972 DIP2BQ9P265 1576 aa36.19■■■■□ 3.38
LTB-213ENST00000483972 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.14■■■■□ 3.38
LTB-213ENST00000483972 KDM6BO15054 1643 aa36.12■■■■□ 3.37
LTB-213ENST00000483972 TSPOAP1O95153 1857 aa36.05■■■■□ 3.36
LTB-213ENST00000483972 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.03■■■■□ 3.36
LTB-213ENST00000483972 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36■■■■□ 3.35
LTB-213ENST00000483972 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
LTB-213ENST00000483972 PTPRGP23470 1445 aa35.87■■■■□ 3.33
LTB-213ENST00000483972 IGF1RP08069 1367 aa35.87■■■■□ 3.33
LTB-213ENST00000483972 CUL7Q14999 1698 aa35.85■■■■□ 3.33
LTB-213ENST00000483972 KIF27Q86VH2 1401 aa35.85■■■■□ 3.33
LTB-213ENST00000483972 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.75■■■■□ 3.31
LTB-213ENST00000483972 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
LTB-213ENST00000483972 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.73■■■■□ 3.31
LTB-213ENST00000483972 ABCC2Q92887 1545 aa35.73■■■■□ 3.31
LTB-213ENST00000483972 ASXL2Q76L83 1435 aa35.7■■■■□ 3.31
LTB-213ENST00000483972 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.68■■■■□ 3.3
LTB-213ENST00000483972 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.67■■■■□ 3.3
LTB-213ENST00000483972 ADGRL1O94910 1474 aa35.62■■■■□ 3.29
LTB-213ENST00000483972 GLI2P10070 1586 aa35.6■■■■□ 3.29
LTB-213ENST00000483972 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
LTB-213ENST00000483972 IQGAP2Q13576 1575 aa35.58■■■■□ 3.29
LTB-213ENST00000483972 UACAQ9BZF9 1416 aa35.55■■■■□ 3.28
LTB-213ENST00000483972 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.53■■■■□ 3.28
LTB-213ENST00000483972 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
LTB-213ENST00000483972 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.44■■■■□ 3.26
LTB-213ENST00000483972 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
LTB-213ENST00000483972 DISP1Q96F81 1524 aa35.42■■■■□ 3.26
LTB-213ENST00000483972 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.39■■■■□ 3.26
LTB-213ENST00000483972 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.38■■■■□ 3.25
LTB-213ENST00000483972 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
LTB-213ENST00000483972 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.34■■■■□ 3.25
LTB-213ENST00000483972 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.27■■■■□ 3.24
LTB-213ENST00000483972 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.26■■■■□ 3.23
LTB-213ENST00000483972 KIAA0556O60303 1618 aa35.25■■■■□ 3.23
LTB-213ENST00000483972 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.23■■■■□ 3.23
LTB-213ENST00000483972 KCNH8Q96L42 1107 aa35.16■■■■□ 3.22
LTB-213ENST00000483972 CD109Q6YHK3 1445 aa35.13■■■■□ 3.21
LTB-213ENST00000483972 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.05■■■■□ 3.2
LTB-213ENST00000483972 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.05■■■■□ 3.2
LTB-213ENST00000483972 GOLGA3Q08378 1498 aa35.01■■■■□ 3.19
LTB-213ENST00000483972 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.98■■■■□ 3.19
LTB-213ENST00000483972 KIF21BO75037 1637 aa34.95■■■■□ 3.19
LTB-213ENST00000483972 ABCA8O94911 1581 aa34.94■■■■□ 3.18
LTB-213ENST00000483972 ARID3CA6NKF2 412 aa34.89■■■■□ 3.18
LTB-213ENST00000483972 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
LTB-213ENST00000483972 FBXO41Q8TF61 875 aa34.82■■■■□ 3.16
LTB-213ENST00000483972 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.79■■■■□ 3.16
LTB-213ENST00000483972 P3H3Q8IVL6 736 aa34.75■■■■□ 3.15
LTB-213ENST00000483972 PTPRMP28827 1452 aa34.71■■■■□ 3.15
LTB-213ENST00000483972 ATP10BO94823 1461 aa34.68■■■■□ 3.14
LTB-213ENST00000483972 RAPGEF3O95398 923 aa34.68■■■■□ 3.14
LTB-213ENST00000483972 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
LTB-213ENST00000483972 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.67■■■■□ 3.14
LTB-213ENST00000483972 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
LTB-213ENST00000483972 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
LTB-213ENST00000483972 PRXQ9BXM0 1461 aa34.65■■■■□ 3.14
LTB-213ENST00000483972 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.63■■■■□ 3.13
LTB-213ENST00000483972 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.63■■■■□ 3.13
LTB-213ENST00000483972 NEO1Q92859 1461 aa34.56■■■■□ 3.12
LTB-213ENST00000483972 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.52■■■■□ 3.12
LTB-213ENST00000483972 MADDQ8WXG6 1647 aa34.52■■■■□ 3.12
LTB-213ENST00000483972 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
LTB-213ENST00000483972 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.48■■■■□ 3.11
LTB-213ENST00000483972 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.46■■■■□ 3.11
LTB-213ENST00000483972 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.45■■■■□ 3.1
LTB-213ENST00000483972 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.42■■■■□ 3.1
LTB-213ENST00000483972 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
LTB-213ENST00000483972 SAMD9Q5K651 1589 aa34.4■■■■□ 3.1
LTB-213ENST00000483972 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
LTB-213ENST00000483972 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.36■■■■□ 3.09
LTB-213ENST00000483972 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
LTB-213ENST00000483972 HSPA2P54652 639 aa34.34■■■■□ 3.09
LTB-213ENST00000483972 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.33■■■■□ 3.09
LTB-213ENST00000483972 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
LTB-213ENST00000483972 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.3■■■■□ 3.08
LTB-213ENST00000483972 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.3■■■■□ 3.08
LTB-213ENST00000483972 AKNAQ7Z591 1439 aa34.3■■■■□ 3.08
LTB-213ENST00000483972 FANCAO15360 1455 aa34.27■■■■□ 3.08
LTB-213ENST00000483972 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.26■■■■□ 3.07
LTB-213ENST00000483972 RICTORQ6R327 1708 aa34.26■■■■□ 3.07
LTB-213ENST00000483972 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.24■■■■□ 3.07
LTB-213ENST00000483972 MLECQ14165 292 aa34.23■■■■□ 3.07
LTB-213ENST00000483972 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.19■■■■□ 3.06
LTB-213ENST00000483972 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.16■■■■□ 3.06
LTB-213ENST00000483972 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.16■■■■□ 3.06
LTB-213ENST00000483972 CERKQ8TCT0 537 aa34.15■■■■□ 3.06
LTB-213ENST00000483972 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.14■■■■□ 3.06
LTB-213ENST00000483972 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.13■■■■□ 3.05
LTB-213ENST00000483972 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.11■■■■□ 3.05
LTB-213ENST00000483972 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.08■■■■□ 3.05
LTB-213ENST00000483972 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.07■■■■□ 3.05
LTB-213ENST00000483972 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.06■■■■□ 3.04
LTB-213ENST00000483972 HECW1Q76N89 1606 aa34.05■■■■□ 3.04
LTB-213ENST00000483972 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.03■■■■□ 3.04
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