RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481114.1

SDCCAG3-210, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-210ENST00000481114 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.9■■□□□ 1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.9■■□□□ 1.42
SDCCAG3-210ENST00000481114 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.86■■□□□ 1.41
SDCCAG3-210ENST00000481114 MAPKBP1O60336 1514 aa23.82■■□□□ 1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.8■■□□□ 1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 DIP2BQ9P265 1576 aa23.78■■□□□ 1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.76■■□□□ 1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGF1RP08069 1367 aa23.73■■□□□ 1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 TSPOAP1O95153 1857 aa23.71■■□□□ 1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 CUL7Q14999 1698 aa23.7■■□□□ 1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 KIF27Q86VH2 1401 aa23.7■■□□□ 1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 KDM6BO15054 1643 aa23.7■■□□□ 1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 PTPRGP23470 1445 aa23.63■■□□□ 1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.59■■□□□ 1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.58■■□□□ 1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.57■■□□□ 1.36
SDCCAG3-210ENST00000481114 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.55■■□□□ 1.36
SDCCAG3-210ENST00000481114 ABCC2Q92887 1545 aa23.53■■□□□ 1.36
SDCCAG3-210ENST00000481114 IQGAP2Q13576 1575 aa23.49■■□□□ 1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 ASXL2Q76L83 1435 aa23.49■■□□□ 1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.49■■□□□ 1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 GLI2P10070 1586 aa23.45■■□□□ 1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.43■■□□□ 1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 UACAQ9BZF9 1416 aa23.43■■□□□ 1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 DISP1Q96F81 1524 aa23.38■■□□□ 1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.33■■□□□ 1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 ADGRL1O94910 1474 aa23.33■■□□□ 1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.32■■□□□ 1.32
SDCCAG3-210ENST00000481114 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.32■■□□□ 1.32
SDCCAG3-210ENST00000481114 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.31■■□□□ 1.32
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SDCCAG3-210ENST00000481114 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.3■■□□□ 1.32
SDCCAG3-210ENST00000481114 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SDCCAG3-210ENST00000481114 KIAA0556O60303 1618 aa23.28■■□□□ 1.32
SDCCAG3-210ENST00000481114 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SDCCAG3-210ENST00000481114 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.2■■□□□ 1.3
SDCCAG3-210ENST00000481114 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.16■■□□□ 1.3
SDCCAG3-210ENST00000481114 KCNH8Q96L42 1107 aa23.13■■□□□ 1.29
SDCCAG3-210ENST00000481114 GOLGA3Q08378 1498 aa23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3-210ENST00000481114 CD109Q6YHK3 1445 aa23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3-210ENST00000481114 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.12■■□□□ 1.29
SDCCAG3-210ENST00000481114 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.1■■□□□ 1.29
SDCCAG3-210ENST00000481114 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.08■■□□□ 1.29
SDCCAG3-210ENST00000481114 ABCA8O94911 1581 aa23.08■■□□□ 1.29
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARID3CA6NKF2 412 aa22.97■■□□□ 1.27
SDCCAG3-210ENST00000481114 KIF21BO75037 1637 aa22.97■■□□□ 1.27
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRXQ9BXM0 1461 aa22.96■■□□□ 1.27
SDCCAG3-210ENST00000481114 P3H3Q8IVL6 736 aa22.93■■□□□ 1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.92■■□□□ 1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 ATP10BO94823 1461 aa22.9■■□□□ 1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.85■■□□□ 1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.85■■□□□ 1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 RAPGEF3O95398 923 aa22.81■■□□□ 1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.79■■□□□ 1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.78■■□□□ 1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 PTPRMP28827 1452 aa22.78■■□□□ 1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 SAMD9Q5K651 1589 aa22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 NEO1Q92859 1461 aa22.77■■□□□ 1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.75■■□□□ 1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 FBXO41Q8TF61 875 aa22.72■■□□□ 1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.71■■□□□ 1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.69■■□□□ 1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 MADDQ8WXG6 1647 aa22.68■■□□□ 1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.65■■□□□ 1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.64■■□□□ 1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.62■■□□□ 1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 AKNAQ7Z591 1439 aa22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 RICTORQ6R327 1708 aa22.6■■□□□ 1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 FANCAO15360 1455 aa22.58■■□□□ 1.2
SDCCAG3-210ENST00000481114 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.58■■□□□ 1.2
SDCCAG3-210ENST00000481114 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.58■■□□□ 1.2
SDCCAG3-210ENST00000481114 EEA1Q15075 1411 aa22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3-210ENST00000481114 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3-210ENST00000481114 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3-210ENST00000481114 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.54■■□□□ 1.2
SDCCAG3-210ENST00000481114 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3-210ENST00000481114 HSPA2P54652 639 aa22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3-210ENST00000481114 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.49■■□□□ 1.19
SDCCAG3-210ENST00000481114 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.48■■□□□ 1.19
SDCCAG3-210ENST00000481114 MLECQ14165 292 aa22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3-210ENST00000481114 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3-210ENST00000481114 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.45■■□□□ 1.19
SDCCAG3-210ENST00000481114 HECW1Q76N89 1606 aa22.45■■□□□ 1.18
SDCCAG3-210ENST00000481114 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SDCCAG3-210ENST00000481114 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.43■■□□□ 1.18
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