RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477093.1

PXDN-208, Transcript of peroxidasin, humanhuman

TSL 4

Gene PXDN, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDN-208ENST00000477093 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.62■■□□□ 1.69
PXDN-208ENST00000477093 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PXDN-208ENST00000477093 MAPKBP1O60336 1514 aa25.58■■□□□ 1.68
PXDN-208ENST00000477093 DIP2BQ9P265 1576 aa25.52■■□□□ 1.68
PXDN-208ENST00000477093 TOP2BQ02880 1626 aa25.52■■□□□ 1.68
PXDN-208ENST00000477093 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.48■■□□□ 1.67
PXDN-208ENST00000477093 KDM6BO15054 1643 aa25.47■■□□□ 1.67
PXDN-208ENST00000477093 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.44■■□□□ 1.66
PXDN-208ENST00000477093 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.42■■□□□ 1.66
PXDN-208ENST00000477093 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PXDN-208ENST00000477093 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.33■■□□□ 1.65
PXDN-208ENST00000477093 TSPOAP1O95153 1857 aa25.28■■□□□ 1.64
PXDN-208ENST00000477093 PTPRGP23470 1445 aa25.27■■□□□ 1.64
PXDN-208ENST00000477093 IGF1RP08069 1367 aa25.23■■□□□ 1.63
PXDN-208ENST00000477093 ADGRL1O94910 1474 aa25.21■■□□□ 1.63
PXDN-208ENST00000477093 ABCC2Q92887 1545 aa25.17■■□□□ 1.62
PXDN-208ENST00000477093 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.17■■□□□ 1.62
PXDN-208ENST00000477093 ASXL2Q76L83 1435 aa25.17■■□□□ 1.62
PXDN-208ENST00000477093 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PXDN-208ENST00000477093 GLI2P10070 1586 aa25.14■■□□□ 1.62
PXDN-208ENST00000477093 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.14■■□□□ 1.61
PXDN-208ENST00000477093 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PXDN-208ENST00000477093 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.1■■□□□ 1.61
PXDN-208ENST00000477093 KIF27Q86VH2 1401 aa25.09■■□□□ 1.61
PXDN-208ENST00000477093 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PXDN-208ENST00000477093 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.06■■□□□ 1.6
PXDN-208ENST00000477093 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.05■■□□□ 1.6
PXDN-208ENST00000477093 CUL7Q14999 1698 aa25.03■■□□□ 1.6
PXDN-208ENST00000477093 UACAQ9BZF9 1416 aa25.02■■□□□ 1.6
PXDN-208ENST00000477093 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.01■■□□□ 1.59
PXDN-208ENST00000477093 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PXDN-208ENST00000477093 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.97■■□□□ 1.59
PXDN-208ENST00000477093 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.95■■□□□ 1.58
PXDN-208ENST00000477093 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.92■■□□□ 1.58
PXDN-208ENST00000477093 DISP1Q96F81 1524 aa24.9■■□□□ 1.58
PXDN-208ENST00000477093 IQGAP2Q13576 1575 aa24.89■■□□□ 1.58
PXDN-208ENST00000477093 FBXO41Q8TF61 875 aa24.87■■□□□ 1.57
PXDN-208ENST00000477093 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.79■■□□□ 1.56
PXDN-208ENST00000477093 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PXDN-208ENST00000477093 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.76■■□□□ 1.55
PXDN-208ENST00000477093 CD109Q6YHK3 1445 aa24.75■■□□□ 1.55
PXDN-208ENST00000477093 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.75■■□□□ 1.55
PXDN-208ENST00000477093 KCNH8Q96L42 1107 aa24.71■■□□□ 1.55
PXDN-208ENST00000477093 KIAA0556O60303 1618 aa24.67■■□□□ 1.54
PXDN-208ENST00000477093 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.66■■□□□ 1.54
PXDN-208ENST00000477093 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.59■■□□□ 1.53
PXDN-208ENST00000477093 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.58■■□□□ 1.53
PXDN-208ENST00000477093 PTPRMP28827 1452 aa24.57■■□□□ 1.52
PXDN-208ENST00000477093 KIF21BO75037 1637 aa24.56■■□□□ 1.52
PXDN-208ENST00000477093 ABCA8O94911 1581 aa24.53■■□□□ 1.52
PXDN-208ENST00000477093 GOLGA3Q08378 1498 aa24.51■■□□□ 1.51
PXDN-208ENST00000477093 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.51■■□□□ 1.51
PXDN-208ENST00000477093 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.46■■□□□ 1.51
PXDN-208ENST00000477093 RAPGEF3O95398 923 aa24.46■■□□□ 1.51
PXDN-208ENST00000477093 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PXDN-208ENST00000477093 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.4■■□□□ 1.5
PXDN-208ENST00000477093 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
PXDN-208ENST00000477093 ARID3CA6NKF2 412 aa24.39■■□□□ 1.49
PXDN-208ENST00000477093 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PXDN-208ENST00000477093 ATP10BO94823 1461 aa24.38■■□□□ 1.49
PXDN-208ENST00000477093 NEO1Q92859 1461 aa24.34■■□□□ 1.49
PXDN-208ENST00000477093 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.32■■□□□ 1.48
PXDN-208ENST00000477093 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.31■■□□□ 1.48
PXDN-208ENST00000477093 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.3■■□□□ 1.48
PXDN-208ENST00000477093 HSPA2P54652 639 aa24.3■■□□□ 1.48
PXDN-208ENST00000477093 MADDQ8WXG6 1647 aa24.3■■□□□ 1.48
PXDN-208ENST00000477093 CERKQ8TCT0 537 aa24.29■■□□□ 1.48
PXDN-208ENST00000477093 P3H3Q8IVL6 736 aa24.28■■□□□ 1.48
PXDN-208ENST00000477093 PRXQ9BXM0 1461 aa24.26■■□□□ 1.47
PXDN-208ENST00000477093 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.24■■□□□ 1.47
PXDN-208ENST00000477093 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PXDN-208ENST00000477093 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PXDN-208ENST00000477093 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.17■■□□□ 1.46
PXDN-208ENST00000477093 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PXDN-208ENST00000477093 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.16■■□□□ 1.46
PXDN-208ENST00000477093 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.16■■□□□ 1.46
PXDN-208ENST00000477093 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.15■■□□□ 1.46
PXDN-208ENST00000477093 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PXDN-208ENST00000477093 ILDR2Q71H61 639 aa24.15■■□□□ 1.46
PXDN-208ENST00000477093 SOCS7O14512 581 aa24.14■■□□□ 1.45
PXDN-208ENST00000477093 AKNAQ7Z591 1439 aa24.12■■□□□ 1.45
PXDN-208ENST00000477093 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.12■■□□□ 1.45
PXDN-208ENST00000477093 FANCAO15360 1455 aa24.1■■□□□ 1.45
PXDN-208ENST00000477093 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.09■■□□□ 1.45
PXDN-208ENST00000477093 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PXDN-208ENST00000477093 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.07■■□□□ 1.44
PXDN-208ENST00000477093 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.05■■□□□ 1.44
PXDN-208ENST00000477093 MLECQ14165 292 aa24.05■■□□□ 1.44
PXDN-208ENST00000477093 RICTORQ6R327 1708 aa24.04■■□□□ 1.44
PXDN-208ENST00000477093 SAMD9Q5K651 1589 aa24.03■■□□□ 1.44
PXDN-208ENST00000477093 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.03■■□□□ 1.44
PXDN-208ENST00000477093 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.02■■□□□ 1.44
PXDN-208ENST00000477093 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.01■■□□□ 1.43
PXDN-208ENST00000477093 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24■■□□□ 1.43
PXDN-208ENST00000477093 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.99■■□□□ 1.43
PXDN-208ENST00000477093 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.96■■□□□ 1.43
PXDN-208ENST00000477093 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.95■■□□□ 1.43
PXDN-208ENST00000477093 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.95■■□□□ 1.43
PXDN-208ENST00000477093 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.43
PXDN-208ENST00000477093 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms