RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469223.5

HDAC6-217, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC6, Length 796 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-217ENST00000469223 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HDAC6-217ENST00000469223 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.66■■□□□ 1.38
HDAC6-217ENST00000469223 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.62■■□□□ 1.37
HDAC6-217ENST00000469223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.62■■□□□ 1.37
HDAC6-217ENST00000469223 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.59■■□□□ 1.37
HDAC6-217ENST00000469223 ADGRL1O94910 1474 aa23.58■■□□□ 1.37
HDAC6-217ENST00000469223 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
HDAC6-217ENST00000469223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.53■■□□□ 1.36
HDAC6-217ENST00000469223 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
HDAC6-217ENST00000469223 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HDAC6-217ENST00000469223 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.47■■□□□ 1.35
HDAC6-217ENST00000469223 JPH4Q96JJ6 628 aa23.45■■□□□ 1.34
HDAC6-217ENST00000469223 TOP2BQ02880 1626 aa23.41■■□□□ 1.34
HDAC6-217ENST00000469223 GLI2P10070 1586 aa23.29■■□□□ 1.32
HDAC6-217ENST00000469223 CUL7Q14999 1698 aa23.28■■□□□ 1.32
HDAC6-217ENST00000469223 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HDAC6-217ENST00000469223 FBXO41Q8TF61 875 aa23.23■■□□□ 1.31
HDAC6-217ENST00000469223 ASXL2Q76L83 1435 aa23.21■■□□□ 1.31
HDAC6-217ENST00000469223 ABCC2Q92887 1545 aa23.21■■□□□ 1.31
HDAC6-217ENST00000469223 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.21■■□□□ 1.31
HDAC6-217ENST00000469223 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.18■■□□□ 1.3
HDAC6-217ENST00000469223 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.17■■□□□ 1.3
HDAC6-217ENST00000469223 PTPRGP23470 1445 aa23.12■■□□□ 1.29
HDAC6-217ENST00000469223 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.11■■□□□ 1.29
HDAC6-217ENST00000469223 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HDAC6-217ENST00000469223 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HDAC6-217ENST00000469223 KIF21BO75037 1637 aa23.05■■□□□ 1.28
HDAC6-217ENST00000469223 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HDAC6-217ENST00000469223 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.03■■□□□ 1.28
HDAC6-217ENST00000469223 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.01■■□□□ 1.27
HDAC6-217ENST00000469223 LMTK3Q96Q04 1460 aa23■■□□□ 1.27
HDAC6-217ENST00000469223 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.98■■□□□ 1.27
HDAC6-217ENST00000469223 UACAQ9BZF9 1416 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC6-217ENST00000469223 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC6-217ENST00000469223 IQGAP2Q13576 1575 aa22.94■■□□□ 1.26
HDAC6-217ENST00000469223 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC6-217ENST00000469223 IGF1RP08069 1367 aa22.88■■□□□ 1.25
HDAC6-217ENST00000469223 DISP1Q96F81 1524 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC6-217ENST00000469223 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC6-217ENST00000469223 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC6-217ENST00000469223 PTPRMP28827 1452 aa22.83■■□□□ 1.25
HDAC6-217ENST00000469223 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HDAC6-217ENST00000469223 KIF27Q86VH2 1401 aa22.82■■□□□ 1.24
HDAC6-217ENST00000469223 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.81■■□□□ 1.24
HDAC6-217ENST00000469223 KIAA0556O60303 1618 aa22.78■■□□□ 1.24
HDAC6-217ENST00000469223 CD109Q6YHK3 1445 aa22.75■■□□□ 1.23
HDAC6-217ENST00000469223 MADDQ8WXG6 1647 aa22.75■■□□□ 1.23
HDAC6-217ENST00000469223 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.73■■□□□ 1.23
HDAC6-217ENST00000469223 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.72■■□□□ 1.23
HDAC6-217ENST00000469223 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
HDAC6-217ENST00000469223 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.71■■□□□ 1.23
HDAC6-217ENST00000469223 ILDR2Q71H61 639 aa22.7■■□□□ 1.22
HDAC6-217ENST00000469223 SOCS7O14512 581 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC6-217ENST00000469223 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.67■■□□□ 1.22
HDAC6-217ENST00000469223 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HDAC6-217ENST00000469223 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC6-217ENST00000469223 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.6■■□□□ 1.21
HDAC6-217ENST00000469223 KCNH8Q96L42 1107 aa22.59■■□□□ 1.21
HDAC6-217ENST00000469223 ABCA8O94911 1581 aa22.58■■□□□ 1.2
HDAC6-217ENST00000469223 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.55■■□□□ 1.2
HDAC6-217ENST00000469223 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.55■■□□□ 1.2
HDAC6-217ENST00000469223 CERKQ8TCT0 537 aa22.54■■□□□ 1.2
HDAC6-217ENST00000469223 HSPA2P54652 639 aa22.52■■□□□ 1.2
HDAC6-217ENST00000469223 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.5■■□□□ 1.19
HDAC6-217ENST00000469223 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.5■■□□□ 1.19
HDAC6-217ENST00000469223 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.47■■□□□ 1.19
HDAC6-217ENST00000469223 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HDAC6-217ENST00000469223 RAPGEF3O95398 923 aa22.43■■□□□ 1.18
HDAC6-217ENST00000469223 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.4■■□□□ 1.18
HDAC6-217ENST00000469223 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.4■■□□□ 1.18
HDAC6-217ENST00000469223 GOLGA3Q08378 1498 aa22.4■■□□□ 1.18
HDAC6-217ENST00000469223 NEO1Q92859 1461 aa22.4■■□□□ 1.18
HDAC6-217ENST00000469223 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.4■■□□□ 1.18
HDAC6-217ENST00000469223 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.39■■□□□ 1.17
HDAC6-217ENST00000469223 RICTORQ6R327 1708 aa22.39■■□□□ 1.17
HDAC6-217ENST00000469223 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.35■■□□□ 1.17
HDAC6-217ENST00000469223 ARID3CA6NKF2 412 aa22.33■■□□□ 1.17
HDAC6-217ENST00000469223 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.33■■□□□ 1.16
HDAC6-217ENST00000469223 FANCAO15360 1455 aa22.31■■□□□ 1.16
HDAC6-217ENST00000469223 STRCQ7RTU9 1775 aa22.3■■□□□ 1.16
HDAC6-217ENST00000469223 ATP10BO94823 1461 aa22.29■■□□□ 1.16
HDAC6-217ENST00000469223 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.26■■□□□ 1.15
HDAC6-217ENST00000469223 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.24■■□□□ 1.15
HDAC6-217ENST00000469223 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.24■■□□□ 1.15
HDAC6-217ENST00000469223 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.23■■□□□ 1.15
HDAC6-217ENST00000469223 AKNAQ7Z591 1439 aa22.23■■□□□ 1.15
HDAC6-217ENST00000469223 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HDAC6-217ENST00000469223 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.21■■□□□ 1.15
HDAC6-217ENST00000469223 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.2■■□□□ 1.14
HDAC6-217ENST00000469223 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-217ENST00000469223 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.18■■□□□ 1.14
HDAC6-217ENST00000469223 MLECQ14165 292 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC6-217ENST00000469223 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC6-217ENST00000469223 HECW1Q76N89 1606 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC6-217ENST00000469223 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC6-217ENST00000469223 SAMD9Q5K651 1589 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC6-217ENST00000469223 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 P3H3Q8IVL6 736 aa22.06■■□□□ 1.12
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