RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466192.5

COL9A3-205, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 2

Gene COL9A3, Length 2,194 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL9A3-205ENST00000466192 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.02■■■□□ 2.08
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COL9A3-205ENST00000466192 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.12■■□□□ 1.93
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COL9A3-205ENST00000466192 PTPRGP23470 1445 aa27■■□□□ 1.91
COL9A3-205ENST00000466192 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
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COL9A3-205ENST00000466192 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.97■■□□□ 1.91
COL9A3-205ENST00000466192 ATP10BO94823 1461 aa26.95■■□□□ 1.91
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COL9A3-205ENST00000466192 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.78■■□□□ 1.88
COL9A3-205ENST00000466192 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.78■■□□□ 1.88
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COL9A3-205ENST00000466192 DAPK1P53355 1430 aa26.76■■□□□ 1.87
COL9A3-205ENST00000466192 AKNAQ7Z591 1439 aa26.75■■□□□ 1.87
COL9A3-205ENST00000466192 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.75■■□□□ 1.87
COL9A3-205ENST00000466192 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
COL9A3-205ENST00000466192 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.74■■□□□ 1.87
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