RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466165.1

PRKRA-208, Transcript of protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2, human

TSL 2

Gene PRKRA, Length 585 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKRA-208	ENST00000466165	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRKRA-208	ENST00000466165	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PRKRA-208	ENST00000466165	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PRKRA-208	ENST00000466165	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PRKRA-208	ENST00000466165	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PRKRA-208	ENST00000466165	DIP2B	Q9P265	1576 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PRKRA-208	ENST00000466165	KDM6B	O15054	1643 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRKRA-208	ENST00000466165	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.95	■■■□□ 2.23
PRKRA-208	ENST00000466165	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PRKRA-208	ENST00000466165	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PRKRA-208	ENST00000466165	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PRKRA-208	ENST00000466165	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRKRA-208	ENST00000466165	PTPRG	P23470	1445 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PRKRA-208	ENST00000466165	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PRKRA-208	ENST00000466165	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PRKRA-208	ENST00000466165	IGF1R	P08069	1367 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PRKRA-208	ENST00000466165	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.64	■■■□□ 2.17
PRKRA-208	ENST00000466165	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PRKRA-208	ENST00000466165	GLI2	P10070	1586 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PRKRA-208	ENST00000466165	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PRKRA-208	ENST00000466165	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PRKRA-208	ENST00000466165	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PRKRA-208	ENST00000466165	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PRKRA-208	ENST00000466165	CUL7	Q14999	1698 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRKRA-208	ENST00000466165	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PRKRA-208	ENST00000466165	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PRKRA-208	ENST00000466165	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
PRKRA-208	ENST00000466165	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRKRA-208	ENST00000466165	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.45	■■■□□ 2.15
PRKRA-208	ENST00000466165	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PRKRA-208	ENST00000466165	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRKRA-208	ENST00000466165	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PRKRA-208	ENST00000466165	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PRKRA-208	ENST00000466165	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PRKRA-208	ENST00000466165	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PRKRA-208	ENST00000466165	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PRKRA-208	ENST00000466165	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PRKRA-208	ENST00000466165	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PRKRA-208	ENST00000466165	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PRKRA-208	ENST00000466165	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PRKRA-208	ENST00000466165	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PRKRA-208	ENST00000466165	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PRKRA-208	ENST00000466165	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PRKRA-208	ENST00000466165	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PRKRA-208	ENST00000466165	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PRKRA-208	ENST00000466165	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PRKRA-208	ENST00000466165	KIF21B	O75037	1637 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PRKRA-208	ENST00000466165	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PRKRA-208	ENST00000466165	PTPRM	P28827	1452 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PRKRA-208	ENST00000466165	GOLGA3	Q08378	1498 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKRA-208	ENST00000466165	ABCA8	O94911	1581 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PRKRA-208	ENST00000466165	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PRKRA-208	ENST00000466165	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PRKRA-208	ENST00000466165	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PRKRA-208	ENST00000466165	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PRKRA-208	ENST00000466165	RAPGEF3	O95398	923 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PRKRA-208	ENST00000466165	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PRKRA-208	ENST00000466165	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PRKRA-208	ENST00000466165	ARID3C	A6NKF2	412 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PRKRA-208	ENST00000466165	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PRKRA-208	ENST00000466165	ATP10B	O94823	1461 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKRA-208	ENST00000466165	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PRKRA-208	ENST00000466165	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		27.7	■■■□□ 2.03
PRKRA-208	ENST00000466165	NEO1	Q92859	1461 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PRKRA-208	ENST00000466165	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PRKRA-208	ENST00000466165	P3H3	Q8IVL6	736 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PRKRA-208	ENST00000466165	HSPA2	P54652	639 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PRKRA-208	ENST00000466165	CERK	Q8TCT0	537 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PRKRA-208	ENST00000466165	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PRKRA-208	ENST00000466165	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PRKRA-208	ENST00000466165	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PRKRA-208	ENST00000466165	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.56	■■■□□ 2
PRKRA-208	ENST00000466165	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.55	■■■□□ 2
PRKRA-208	ENST00000466165	PRX	Q9BXM0	1461 aa		27.54	■■■□□ 2
PRKRA-208	ENST00000466165	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		27.52	■■■□□ 2
PRKRA-208	ENST00000466165	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
PRKRA-208	ENST00000466165	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PRKRA-208	ENST00000466165	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		27.45	■■□□□ 1.99
PRKRA-208	ENST00000466165	FANCA	O15360	1455 aa		27.45	■■□□□ 1.99
PRKRA-208	ENST00000466165	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PRKRA-208	ENST00000466165	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PRKRA-208	ENST00000466165	SOCS7	O14512	581 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PRKRA-208	ENST00000466165	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PRKRA-208	ENST00000466165	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PRKRA-208	ENST00000466165	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PRKRA-208	ENST00000466165	ILDR2	Q71H61	639 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PRKRA-208	ENST00000466165	MLEC	Q14165	292 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PRKRA-208	ENST00000466165	SAMD9	Q5K651	1589 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PRKRA-208	ENST00000466165	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PRKRA-208	ENST00000466165	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.35	■■□□□ 1.97
PRKRA-208	ENST00000466165	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PRKRA-208	ENST00000466165	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PRKRA-208	ENST00000466165	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PRKRA-208	ENST00000466165	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PRKRA-208	ENST00000466165	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PRKRA-208	ENST00000466165	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PRKRA-208	ENST00000466165	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PRKRA-208	ENST00000466165	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PRKRA-208	ENST00000466165	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PRKRA-208	ENST00000466165	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.26	■■□□□ 1.95	5e-8	■■■■■ 28.6

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