RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462996.1

PTPN18-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN18, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18-208ENST00000462996 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.39■■■■□ 3.42
PTPN18-208ENST00000462996 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.37■■■■□ 3.41
PTPN18-208ENST00000462996 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPN18-208ENST00000462996 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.28■■■■□ 3.4
PTPN18-208ENST00000462996 MAPKBP1O60336 1514 aa36.27■■■■□ 3.4
PTPN18-208ENST00000462996 DIP2BQ9P265 1576 aa36.24■■■■□ 3.39
PTPN18-208ENST00000462996 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.23■■■■□ 3.39
PTPN18-208ENST00000462996 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.15■■■■□ 3.38
PTPN18-208ENST00000462996 KDM6BO15054 1643 aa36.09■■■■□ 3.37
PTPN18-208ENST00000462996 TSPOAP1O95153 1857 aa36.06■■■■□ 3.36
PTPN18-208ENST00000462996 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.05■■■■□ 3.36
PTPN18-208ENST00000462996 IGF1RP08069 1367 aa35.98■■■■□ 3.35
PTPN18-208ENST00000462996 PTPRGP23470 1445 aa35.87■■■■□ 3.33
PTPN18-208ENST00000462996 CUL7Q14999 1698 aa35.86■■■■□ 3.33
PTPN18-208ENST00000462996 KIF27Q86VH2 1401 aa35.83■■■■□ 3.33
PTPN18-208ENST00000462996 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
PTPN18-208ENST00000462996 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
PTPN18-208ENST00000462996 ABCC2Q92887 1545 aa35.76■■■■□ 3.31
PTPN18-208ENST00000462996 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
PTPN18-208ENST00000462996 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.74■■■■□ 3.31
PTPN18-208ENST00000462996 ASXL2Q76L83 1435 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPN18-208ENST00000462996 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.7■■■■□ 3.31
PTPN18-208ENST00000462996 GLI2P10070 1586 aa35.69■■■■□ 3.3
PTPN18-208ENST00000462996 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.69■■■■□ 3.3
PTPN18-208ENST00000462996 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.68■■■■□ 3.3
PTPN18-208ENST00000462996 ADGRL1O94910 1474 aa35.62■■■■□ 3.29
PTPN18-208ENST00000462996 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.61■■■■□ 3.29
PTPN18-208ENST00000462996 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
PTPN18-208ENST00000462996 IQGAP2Q13576 1575 aa35.59■■■■□ 3.29
PTPN18-208ENST00000462996 UACAQ9BZF9 1416 aa35.57■■■■□ 3.28
PTPN18-208ENST00000462996 DISP1Q96F81 1524 aa35.52■■■■□ 3.28
PTPN18-208ENST00000462996 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
PTPN18-208ENST00000462996 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.48■■■■□ 3.27
PTPN18-208ENST00000462996 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.47■■■■□ 3.27
PTPN18-208ENST00000462996 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
PTPN18-208ENST00000462996 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.39■■■■□ 3.26
PTPN18-208ENST00000462996 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.36■■■■□ 3.25
PTPN18-208ENST00000462996 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.36■■■■□ 3.25
PTPN18-208ENST00000462996 KIAA0556O60303 1618 aa35.28■■■■□ 3.24
PTPN18-208ENST00000462996 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.27■■■■□ 3.24
PTPN18-208ENST00000462996 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.24■■■■□ 3.23
PTPN18-208ENST00000462996 CD109Q6YHK3 1445 aa35.13■■■■□ 3.21
PTPN18-208ENST00000462996 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.11■■■■□ 3.21
PTPN18-208ENST00000462996 KCNH8Q96L42 1107 aa35.09■■■■□ 3.21
PTPN18-208ENST00000462996 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.08■■■■□ 3.21
PTPN18-208ENST00000462996 ABCA8O94911 1581 aa35.03■■■■□ 3.2
PTPN18-208ENST00000462996 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35■■■■□ 3.19
PTPN18-208ENST00000462996 GOLGA3Q08378 1498 aa34.97■■■■□ 3.19
PTPN18-208ENST00000462996 KIF21BO75037 1637 aa34.96■■■■□ 3.19
PTPN18-208ENST00000462996 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.87■■■■□ 3.17
PTPN18-208ENST00000462996 FBXO41Q8TF61 875 aa34.81■■■■□ 3.16
PTPN18-208ENST00000462996 ARID3CA6NKF2 412 aa34.79■■■■□ 3.16
PTPN18-208ENST00000462996 ATP10BO94823 1461 aa34.76■■■■□ 3.15
PTPN18-208ENST00000462996 PRXQ9BXM0 1461 aa34.75■■■■□ 3.15
PTPN18-208ENST00000462996 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.74■■■■□ 3.15
PTPN18-208ENST00000462996 PTPRMP28827 1452 aa34.73■■■■□ 3.15
PTPN18-208ENST00000462996 P3H3Q8IVL6 736 aa34.7■■■■□ 3.15
PTPN18-208ENST00000462996 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.7■■■■□ 3.14
PTPN18-208ENST00000462996 RAPGEF3O95398 923 aa34.69■■■■□ 3.14
PTPN18-208ENST00000462996 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.69■■■■□ 3.14
PTPN18-208ENST00000462996 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
PTPN18-208ENST00000462996 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.58■■■■□ 3.13
PTPN18-208ENST00000462996 NEO1Q92859 1461 aa34.58■■■■□ 3.13
PTPN18-208ENST00000462996 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.55■■■■□ 3.12
PTPN18-208ENST00000462996 MADDQ8WXG6 1647 aa34.54■■■■□ 3.12
PTPN18-208ENST00000462996 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
PTPN18-208ENST00000462996 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
PTPN18-208ENST00000462996 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.49■■■■□ 3.11
PTPN18-208ENST00000462996 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.49■■■■□ 3.11
PTPN18-208ENST00000462996 SAMD9Q5K651 1589 aa34.49■■■■□ 3.11
PTPN18-208ENST00000462996 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
PTPN18-208ENST00000462996 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
PTPN18-208ENST00000462996 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
PTPN18-208ENST00000462996 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
PTPN18-208ENST00000462996 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.37■■■■□ 3.09
PTPN18-208ENST00000462996 RICTORQ6R327 1708 aa34.35■■■■□ 3.09
PTPN18-208ENST00000462996 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
PTPN18-208ENST00000462996 HSPA2P54652 639 aa34.32■■■■□ 3.08
PTPN18-208ENST00000462996 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.31■■■■□ 3.08
PTPN18-208ENST00000462996 AKNAQ7Z591 1439 aa34.3■■■■□ 3.08
PTPN18-208ENST00000462996 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.3■■■■□ 3.08
PTPN18-208ENST00000462996 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.27■■■■□ 3.08
PTPN18-208ENST00000462996 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.26■■■■□ 3.08
PTPN18-208ENST00000462996 FANCAO15360 1455 aa34.25■■■■□ 3.07
PTPN18-208ENST00000462996 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
PTPN18-208ENST00000462996 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.24■■■■□ 3.07
PTPN18-208ENST00000462996 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.22■■■■□ 3.07
PTPN18-208ENST00000462996 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.2■■■■□ 3.06
PTPN18-208ENST00000462996 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.2■■■■□ 3.06
PTPN18-208ENST00000462996 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPN18-208ENST00000462996 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.19■■■■□ 3.06
PTPN18-208ENST00000462996 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.15■■■■□ 3.06
PTPN18-208ENST00000462996 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.15■■■■□ 3.06
PTPN18-208ENST00000462996 CERKQ8TCT0 537 aa34.14■■■■□ 3.06
PTPN18-208ENST00000462996 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.13■■■■□ 3.05
PTPN18-208ENST00000462996 MLECQ14165 292 aa34.12■■■■□ 3.05
PTPN18-208ENST00000462996 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.1■■■■□ 3.05
PTPN18-208ENST00000462996 HECW1Q76N89 1606 aa34.08■■■■□ 3.05
PTPN18-208ENST00000462996 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.07■■■■□ 3.04
PTPN18-208ENST00000462996 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.03■■■■□ 3.04
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