RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456467.1

SIX3-AS1-202, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 557 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.54■■□□□ 1.36
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.52■■□□□ 1.36
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.51■■□□□ 1.35
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.49■■□□□ 1.35
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.37■■□□□ 1.33
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MAPKBP1O60336 1514 aa23.36■■□□□ 1.33
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.36■■□□□ 1.33
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DIP2BQ9P265 1576 aa23.35■■□□□ 1.33
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IGF1RP08069 1367 aa23.34■■□□□ 1.33
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.29■■□□□ 1.32
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TSPOAP1O95153 1857 aa23.29■■□□□ 1.32
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KDM6BO15054 1643 aa23.27■■□□□ 1.32
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PTPRGP23470 1445 aa23.25■■□□□ 1.31
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KIF27Q86VH2 1401 aa23.16■■□□□ 1.3
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.13■■□□□ 1.29
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ASXL2Q76L83 1435 aa23.12■■□□□ 1.29
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.12■■□□□ 1.29
SIX3-AS1-202ENST00000456467 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ABCC2Q92887 1545 aa23.08■■□□□ 1.29
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.05■■□□□ 1.28
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.04■■□□□ 1.28
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CUL7Q14999 1698 aa23.03■■□□□ 1.28
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ADGRL1O94910 1474 aa23.03■■□□□ 1.28
SIX3-AS1-202ENST00000456467 UACAQ9BZF9 1416 aa23■■□□□ 1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GLI2P10070 1586 aa23■■□□□ 1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.98■■□□□ 1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DISP1Q96F81 1524 aa22.97■■□□□ 1.27
SIX3-AS1-202ENST00000456467 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IQGAP2Q13576 1575 aa22.93■■□□□ 1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.9■■□□□ 1.26
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KCNH8Q96L42 1107 aa22.86■■□□□ 1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.85■■□□□ 1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.84■■□□□ 1.25
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.8■■□□□ 1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.8■■□□□ 1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.78■■□□□ 1.24
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CD109Q6YHK3 1445 aa22.74■■□□□ 1.23
SIX3-AS1-202ENST00000456467 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.74■■□□□ 1.23
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KIAA0556O60303 1618 aa22.73■■□□□ 1.23
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ARID3CA6NKF2 412 aa22.7■■□□□ 1.22
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.66■■□□□ 1.22
SIX3-AS1-202ENST00000456467 P3H3Q8IVL6 736 aa22.63■■□□□ 1.21
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ABCA8O94911 1581 aa22.6■■□□□ 1.21
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RAPGEF3O95398 923 aa22.57■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FBXO41Q8TF61 875 aa22.57■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.55■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KIF21BO75037 1637 aa22.55■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GOLGA3Q08378 1498 aa22.54■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ATP10BO94823 1461 aa22.52■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.51■■□□□ 1.19
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.47■■□□□ 1.19
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PTPRMP28827 1452 aa22.47■■□□□ 1.19
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PRXQ9BXM0 1461 aa22.45■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.39■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.38■■□□□ 1.17
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.37■■□□□ 1.17
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HSPA2P54652 639 aa22.35■■□□□ 1.17
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.34■■□□□ 1.17
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NEO1Q92859 1461 aa22.3■■□□□ 1.16
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.29■■□□□ 1.16
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.28■■□□□ 1.16
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MADDQ8WXG6 1647 aa22.28■■□□□ 1.16
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.28■■□□□ 1.16
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.27■■□□□ 1.16
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.25■■□□□ 1.15
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MLECQ14165 292 aa22.23■■□□□ 1.15
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.22■■□□□ 1.15
SIX3-AS1-202ENST00000456467 AKNAQ7Z591 1439 aa22.21■■□□□ 1.15
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SAMD9Q5K651 1589 aa22.2■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.18■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CERKQ8TCT0 537 aa22.17■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-202ENST00000456467 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.15■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FANCAO15360 1455 aa22.13■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RICTORQ6R327 1708 aa22.11■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.11■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.11■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-202ENST00000456467 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.06■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.05■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.03■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ILDR2Q71H61 639 aa22.03■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.03■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HECW1Q76N89 1606 aa22.02■■□□□ 1.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.01■■□□□ 1.11
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms