RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445076.1

CCDC18-AS1-214, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 620 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
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CCDC18-AS1-214ENST00000445076 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.37■□□□□ 0.05
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 NEO1Q92859 1461 aa15.37■□□□□ 0.05
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.37■□□□□ 0.05
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 MADDQ8WXG6 1647 aa15.35■□□□□ 0.05
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 SAMD9Q5K651 1589 aa15.34■□□□□ 0.05
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.34■□□□□ 0.05
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CCDC18-AS1-214ENST00000445076 HSPA2P54652 639 aa15.32■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.3■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.29■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 AKNAQ7Z591 1439 aa15.29■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 MLECQ14165 292 aa15.29■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 RICTORQ6R327 1708 aa15.27■□□□□ 0.04
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.26■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 FANCAO15360 1455 aa15.26■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.23■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.23■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa15.21■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.21■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.2■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 CERKQ8TCT0 537 aa15.2■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.2■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.2■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 HECW1Q76N89 1606 aa15.18■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.17■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.17■□□□□ 0.02
CCDC18-AS1-214ENST00000445076 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
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