RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429289.5

EPHA1-AS1-202, EPHA1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EPHA1-AS1, Length 5,018 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 SETQ01105 290 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TRIM52Q96A61 297 aa13.08□□□□□ -0.32
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.05□□□□□ -0.32
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 PLCB2Q00722 1185 aa13.05□□□□□ -0.32
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 ARID3AQ99856 593 aa13.03□□□□□ -0.32
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa13.02□□□□□ -0.32
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 FAM9BQ8IZU0 186 aa13.01□□□□□ -0.33
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CHIC1Q5VXU3 224 aa13□□□□□ -0.33
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13□□□□□ -0.33
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 USP35Q9P2H5 1018 aa12.97□□□□□ -0.33
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 MYH16Q9H6N6 1097 aa12.96□□□□□ -0.33
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa12.96□□□□□ -0.34
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TMC1Q8TDI8 760 aa12.89□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 DRC7Q8IY82 874 aa12.89□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.89□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CASC1Q6TDU7 716 aa12.86□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 MIER1Q8N108 512 aa12.85□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 STK11IPQ8N1F8 1099 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 MRS2Q9HD23 443 aa12.84□□□□□ -0.35
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.83□□□□□ -0.36
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.36
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa12.82□□□□□ -0.36
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 HSCBQ8IWL3 235 aa12.79□□□□□ -0.36
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa12.79□□□□□ -0.36
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 GBP4Q96PP9 640 aa12.78□□□□□ -0.36
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 GPS2Q13227 327 aa12.77□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TEX35Q5T0J7 233 aa12.76□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.76□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 MAP7D2Q96T17 732 aa12.75□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 PDE4CQ08493 712 aa12.73□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CCDC66A2RUB6 948 aa12.72□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TONSLQ96HA7 1378 aa12.72□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 NEFHP12036 1026 aa12.71□□□□□ -0.37
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 RGS3P49796 1198 aa12.69□□□□□ -0.38
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 FAM13BQ9NYF5 915 aa12.68□□□□□ -0.38
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.67□□□□□ -0.38
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 RDXP35241 583 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TPM4P67936 248 aa12.64□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CFAP44Q96MT7 982 aa12.63□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.63□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 GSE1Q14687 1217 aa12.63□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa12.63□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CCDC191Q8NCU4 936 aa12.62□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 HMMRO75330 724 aa12.61□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa12.61□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 FGD1P98174 961 aa12.6□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TPM3P06753 285 aa12.59□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TAF3Q5VWG9 929 aa12.59□□□□□ -0.39
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 MCCP23508 829 aa12.57□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.57□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 FAM43AQ8N2R8 423 aa12.56□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 PHF14O94880 888 aa12.56□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TPM2P07951 284 aa12.56□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 H0YHG0 523 aa12.55□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 MS4A1P11836 297 aa12.55□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CCDC70Q6NSX1 233 aa12.55□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa12.54□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 KCNJ4P48050 445 aa12.53□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 ACBD3Q9H3P7 528 aa12.52□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.52□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.4
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CDR1P51861 262 aa12.51□□□□□ -0.41
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 USP8P40818 1118 aa12.51□□□□□ -0.41
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 DEF6Q9H4E7 631 aa12.51□□□□□ -0.41
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 RRP9O43818 475 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 CCDC34Q96HJ3 373 aa12.49□□□□□ -0.41
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
EPHA1-AS1-202ENST00000429289 DCTN1Q14203 1278 aa12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms