RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409289.6

RBMS1-204, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-204ENST00000409289 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RBMS1-204ENST00000409289 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.92■□□□□ 0.14
RBMS1-204ENST00000409289 POTEB2H3BUK9 544 aa15.91■□□□□ 0.14
RBMS1-204ENST00000409289 CREBZFQ9NS37 354 aa15.89■□□□□ 0.13
RBMS1-204ENST00000409289 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.88■□□□□ 0.13
RBMS1-204ENST00000409289 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.78■□□□□ 0.12
RBMS1-204ENST00000409289 PHF12Q96QT6 1004 aa15.76■□□□□ 0.11
RBMS1-204ENST00000409289 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
RBMS1-204ENST00000409289 SLC39A7Q92504 469 aa15.71■□□□□ 0.11
RBMS1-204ENST00000409289 C7P10643 843 aa15.71■□□□□ 0.1
RBMS1-204ENST00000409289 METRNQ9UJH8 293 aa15.71■□□□□ 0.1
RBMS1-204ENST00000409289 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
RBMS1-204ENST00000409289 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
RBMS1-204ENST00000409289 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.6■□□□□ 0.09
RBMS1-204ENST00000409289 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RBMS1-204ENST00000409289 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.57■□□□□ 0.08
RBMS1-204ENST00000409289 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
RBMS1-204ENST00000409289 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.54■□□□□ 0.08
RBMS1-204ENST00000409289 POTEJP0CG39 1038 aa15.53■□□□□ 0.08
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RBMS1-204ENST00000409289 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RBMS1-204ENST00000409289 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.48■□□□□ 0.07
RBMS1-204ENST00000409289 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RBMS1-204ENST00000409289 SMARCA4P51532 1647 aa15.47■□□□□ 0.07
RBMS1-204ENST00000409289 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.46■□□□□ 0.07
RBMS1-204ENST00000409289 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
RBMS1-204ENST00000409289 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
RBMS1-204ENST00000409289 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.41■□□□□ 0.06
RBMS1-204ENST00000409289 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
RBMS1-204ENST00000409289 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.4■□□□□ 0.06
RBMS1-204ENST00000409289 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RBMS1-204ENST00000409289 WIZO95785 1651 aa15.36■□□□□ 0.05
RBMS1-204ENST00000409289 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.29■□□□□ 0.04
RBMS1-204ENST00000409289 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
RBMS1-204ENST00000409289 SMARCA2P51531 1590 aa15.26■□□□□ 0.03
RBMS1-204ENST00000409289 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.26■□□□□ 0.03
RBMS1-204ENST00000409289 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.26■□□□□ 0.03
RBMS1-204ENST00000409289 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.25■□□□□ 0.03
RBMS1-204ENST00000409289 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
RBMS1-204ENST00000409289 TIE1P35590 1138 aa15.22■□□□□ 0.03
RBMS1-204ENST00000409289 KIF12Q96FN5 646 aa15.22■□□□□ 0.03
RBMS1-204ENST00000409289 POTEFA5A3E0 1075 aa15.21■□□□□ 0.03
RBMS1-204ENST00000409289 SEC24BO95487 1268 aa15.2■□□□□ 0.02
RBMS1-204ENST00000409289 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RBMS1-204ENST00000409289 NCAPD3P42695 1498 aa15.16■□□□□ 0.02
RBMS1-204ENST00000409289 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RBMS1-204ENST00000409289 HMGXB3Q12766 1538 aa15.13■□□□□ 0.01
RBMS1-204ENST00000409289 IER5LQ5T953 404 aa15.09■□□□□ 0.01
RBMS1-204ENST00000409289 MAP3K13O43283 966 aa15.07■□□□□ 0
RBMS1-204ENST00000409289 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
RBMS1-204ENST00000409289 TRPC6Q9Y210 931 aa15.06■□□□□ 0
RBMS1-204ENST00000409289 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.04■□□□□ -0
RBMS1-204ENST00000409289 PLEKHG5O94827 1062 aa15.04■□□□□ -0
RBMS1-204ENST00000409289 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.02■□□□□ -0
RBMS1-204ENST00000409289 ST18O60284 1047 aa15.01□□□□□ -0.01
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RBMS1-204ENST00000409289 CCDC88BA6NC98 1476 aa15□□□□□ -0.01
RBMS1-204ENST00000409289 MMRN1Q13201 1228 aa14.97□□□□□ -0.01
RBMS1-204ENST00000409289 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.97□□□□□ -0.01
RBMS1-204ENST00000409289 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.95□□□□□ -0.02
RBMS1-204ENST00000409289 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RBMS1-204ENST00000409289 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.92□□□□□ -0.02
RBMS1-204ENST00000409289 CUX2O14529 1486 aa14.91□□□□□ -0.02
RBMS1-204ENST00000409289 PROM2Q8N271 834 aa14.89□□□□□ -0.03
RBMS1-204ENST00000409289 RASEFQ8IZ41 740 aa14.88□□□□□ -0.03
RBMS1-204ENST00000409289 SNPHO15079 494 aa14.87□□□□□ -0.03
RBMS1-204ENST00000409289 PLCG2P16885 1265 aa14.86□□□□□ -0.03
RBMS1-204ENST00000409289 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.86□□□□□ -0.03
RBMS1-204ENST00000409289 MIER1Q8N108 512 aa14.82□□□□□ -0.04
RBMS1-204ENST00000409289 ERCC6Q03468 1493 aa14.8□□□□□ -0.04
RBMS1-204ENST00000409289 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.76□□□□□ -0.05
RBMS1-204ENST00000409289 PRDM2Q13029 1718 aa14.76□□□□□ -0.05
RBMS1-204ENST00000409289 CFTRP13569 1480 aa14.75□□□□□ -0.05
RBMS1-204ENST00000409289 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.74□□□□□ -0.05
RBMS1-204ENST00000409289 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.73□□□□□ -0.05
RBMS1-204ENST00000409289 NESP48681 1621 aa14.72□□□□□ -0.05
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RBMS1-204ENST00000409289 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RBMS1-204ENST00000409289 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RBMS1-204ENST00000409289 IFNL1Q8IU54 200 aa14.69□□□□□ -0.06
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RBMS1-204ENST00000409289 MARVELD3Q96A59 401 aa14.64□□□□□ -0.07
RBMS1-204ENST00000409289 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.63□□□□□ -0.07
RBMS1-204ENST00000409289 ABCC8Q09428 1581 aa14.61□□□□□ -0.07
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RBMS1-204ENST00000409289 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.61□□□□□ -0.07
RBMS1-204ENST00000409289 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.6□□□□□ -0.07
RBMS1-204ENST00000409289 FAM212AQ96EL1 285 aa14.6□□□□□ -0.07
RBMS1-204ENST00000409289 NUBP1P53384 320 aa14.57□□□□□ -0.08
RBMS1-204ENST00000409289 EMP3P54852 163 aa14.57□□□□□ -0.08
RBMS1-204ENST00000409289 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.55□□□□□ -0.08
RBMS1-204ENST00000409289 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
RBMS1-204ENST00000409289 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.49□□□□□ -0.09
RBMS1-204ENST00000409289 SYNJ1O43426 1573 aa14.49□□□□□ -0.09
RBMS1-204ENST00000409289 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RBMS1-204ENST00000409289 CUX1P39880 1505 aa14.47□□□□□ -0.09
RBMS1-204ENST00000409289 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.47□□□□□ -0.09
RBMS1-204ENST00000409289 TOP2BQ02880 1626 aa14.45□□□□□ -0.1
RBMS1-204ENST00000409289 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.45□□□□□ -0.1
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